Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr07 97507971 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  117  of  328  ( 39316 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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19
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22
23
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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1.83
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19
9
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1.83
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80
85
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210
41
20
8
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1.82
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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4
1
41
1.30
33422080--33422114
16
2.2
16
90
5
54
37
14
2
45
1.59
33422223--33422247
11
2.3
11
100
0
50
32
0
0
68
0.90
33422269--33422311
18
2.3
18
80
4
50
53
2
6
37
1.41
33422986--33423024
5
7.8
5
83
11
53
61
20
0
17
1.34
33423660--33423686
12
2.2
12
100
0
54
29
29
7
33
1.85
33443768--33443910
46
3.1
46
81
2
171
23
26
16
34
1.95
33456673--33456800
29
4.5
28
75
9
107
26
17
30
25
1.97
33464192--33464319
29
4.5
28
76
7
107
26
17
30
25
1.98
33466759--33466799
20
2.0
20
100
0
82
24
9
24
41
1.85
33473393--33473436
19
2.3
19
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0
61
29
11
13
45
1.79
33473401--33473438
19
2.0
19
94
0
67
28
10
13
47
1.76
33474906--33474988
43
1.9
43
87
0
121
38
18
21
21
1.93
33475385--33475419
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
33487122--33487513
192
2.0
193
92
1
655
41
8
12
37
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33490447--33490669
37
6.0
37
73
3
187
28
17
18
35
1.93
33493683--33493734
24
2.2
24
92
0
86
36
3
7
51
1.49
33495651--33495678
7
4.0
7
100
0
56
85
0
0
14
0.59
33496753--33496823
31
2.3
31
97
2
135
47
8
0
43
1.33
33497970--33498003
16
2.1
16
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0
59
47
0
0
52
1.00
33499655--33499719
24
2.7
25
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13
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60
1
3
35
1.22
33499659--33499704
13
3.7
13
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2
2
32
1.19
33500345--33500412
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2.2
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7
77
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10
20
1.80
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4
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4
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0
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0
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100
0
50
0
0
12
88
0.53
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23
2.1
22
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60
6
29
6
58
1.47
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80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
33519090--33519197
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
33527647--33527695
17
2.8
18
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22
50
24
18
22
34
1.96
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4.2
40
79
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169
25
21
27
25
1.99
33535647--33535695
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
33536517--33536683
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
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80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
33538258--33538365
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
33546708--33546932
106
2.1
106
91
0
369
24
26
24
24
2.00
33548109--33548162
25
2.2
25
86
0
72
31
20
25
22
1.98
33553201--33553384
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33554897--33554957
19
3.2
20
71
15
65
60
1
4
32
1.28
33555525--33555577
25
2.1
26
89
3
81
33
0
3
62
1.13
33557431--33557550
46
2.6
44
83
7
143
30
19
26
24
1.98
33564859--33565030
46
3.7
45
78
7
175
30
20
28
20
1.97
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28
2.0
29
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10
80
14
19
46
19
1.84
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8
100
0
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58
0
0
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0.98
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4
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50
76
0
0
23
0.79
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15
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0
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1.56
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3.7
46
79
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193
22
29
19
27
1.98
33575146--33575319
94
1.9
92
84
7
235
22
29
20
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328