Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  234  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70122083--70122179
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1.99
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256
25
28
21
23
1.99
70132626--70132846
118
1.9
120
82
7
281
25
28
21
23
1.99
70132607--70132849
40
6.1
40
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257
25
28
21
24
1.99
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0
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2.3
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100
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17
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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0
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1.94
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70
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258
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20
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0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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20
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30
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15
28
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70291540--70291636
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0
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0
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10
1.64
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93
93
0
297
21
21
28
28
1.98
70313306--70313343
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
70315567--70315663
30
3.2
30
72
8
81
28
27
15
27
1.96
70317788--70317827
19
2.1
19
86
9
55
27
35
15
22
1.94
70319068--70319112
14
3.2
14
87
0
54
17
33
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42
1.76
70322134--70322230
30
3.2
30
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2
97
29
14
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28
1.95
70323791--70323830
14
2.9
14
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0
53
50
7
32
10
1.64
70323819--70324169
171
2.1
171
98
1
677
34
15
22
27
1.95
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2
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75
1.14
70334411--70334478
21
3.2
21
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58
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5
23
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1.58
70334489--70334538
18
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18
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0
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28
14
1.37
70334482--70334563
24
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24
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0
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0
26
12
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30
2.2
30
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0
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26
13
28
31
1.94
70339940--70339978
18
2.2
17
86
13
53
10
7
5
76
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70339940--70339978
17
2.3
17
86
8
53
10
7
5
76
1.13
70339958--70340010
11
4.6
11
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4
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16
3
7
71
1.24
70341687--70341783
30
3.2
30
71
8
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27
15
28
27
1.96
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10
2.7
10
100
0
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29
11
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1.85
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10
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0
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27
27
1.94
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20
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1.99
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100
0
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28
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1.94
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28
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1.96
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2.3
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100
0
328
35
17
28
18
1.94
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30
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12
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1
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1.33
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1.30
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19
1.9
19
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0
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21
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1.63
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1.15
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30
3.2
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27
15
28
27
1.96
70383059--70383141
30
2.7
30
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9
89
13
21
1
63
1.35
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3.1
18
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7
19
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1.27
70383117--70383141
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70383210--70383270
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5
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3
18
0
78
0.88
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9
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0
17
1
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0.81
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3.6
15
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2
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3
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0
80
0.86
70383210--70383270
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3.0
21
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3
18
0
78
0.88
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11
3.6
11
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1.33
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18
1.9
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1.31
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1.96
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28
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3
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14
1.58
70391305--70391401
30
3.2
31
73
5
101
27
28
15
27
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328