Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  63  of  328  ( 39316 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17428036--17428063
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2.5
11
100
0
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28
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17431953--17432043
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19
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17431953--17432050
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3.0
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2.0
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20
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105
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0
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83
0
16
0
0.64
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14
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24
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4.5
45
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1.95
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1.9
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14
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1.95
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1.83
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134
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2.0
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2.0
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2.0
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16
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1.9
46
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4
106
30
17
23
28
1.97
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12.5
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27
1.96
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6.5
89
74
8
443
32
16
23
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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133
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3
646
32
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22
27
1.96
17442838--17443220
179
2.1
179
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0
543
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18
22
27
1.97
17444644--17444758
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17444644--17444714
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1
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8
0
60
1.27
17444671--17444786
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0
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17474093--17474259
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2.00
17482174--17482303
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3.2
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82
4
165
23
24
28
23
2.00
17482136--17482303
80
2.1
80
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0
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1.90
17522481--17522546
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1.90
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2.2
22
89
10
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38
22
24
16
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17587059--17587099
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2.2
19
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1.53
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28
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1
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1
0
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1.10
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19
71
55
1
0
42
1.10
17589900--17589945
16
2.9
16
87
9
60
36
10
13
39
1.79
17590080--17590125
16
2.8
16
80
3
56
41
19
6
32
1.77
17590080--17590133
16
3.3
15
77
12
54
38
18
7
35
1.79
17591601--17591779
33
5.5
33
75
7
150
32
23
10
33
1.88
17591601--17591771
65
2.6
65
90
0
279
33
23
9
33
1.87
17592940--17592964
13
1.9
13
100
0
50
48
8
0
44
1.32
17614715--17614884
84
2.0
84
100
0
340
40
4
12
42
1.63
17615592--17615689
28
3.2
28
68
18
88
35
12
4
47
1.60
17615581--17615707
63
2.0
63
100
0
254
34
9
5
50
1.58
17621749--17621789
2
20.5
2
100
0
82
48
0
0
51
1.00
17622026--17622077
25
2.1
25
100
0
104
36
17
7
38
1.78
17630310--17630406
33
3.0
32
80
8
97
27
18
11
42
1.85
17630345--17630451
33
3.3
33
76
6
101
33
21
9
35
1.86
17633484--17633547
29
2.1
31
83
11
80
35
0
3
60
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17633525--17633549
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
17638871--17638909
19
2.0
20
85
5
53
30
30
5
33
1.79
17649262--17649299
19
2.0
19
94
0
67
28
15
13
42
1.85
17662469--17662518
24
2.1
24
100
0
100
36
4
28
32
1.76
17663216--17663247
17
1.9
17
93
6
57
18
3
3
75
1.08
17668750--17668799
20
2.5
19
78
12
55
60
0
4
36
1.16
17668880--17668923
16
2.6
17
79
13
56
70
2
2
25
1.10
17670294--17670619
83
3.9
83
94
0
535
28
18
18
34
1.95
17670545--17670858
119
2.6
119
87
0
448
28
19
18
33
1.95
17670781--17670942
84
1.9
84
85
0
225
28
19
17
34
1.95
17674987--17675023
14
2.7
14
95
4
67
35
21
13
29
1.92
17682236--17683612
699
2.0
699
100
0
2754
47
9
11
32
1.71
17683855--17683904
20
2.5
19
78
12
55
60
0
4
36
1.16
17683986--17684029
16
2.6
17
79
13
56
70
2
2
25
1.10
17687565--17687598
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
17687929--17688025
30
2.7
40
67
29
106
38
13
14
34
1.85
17688031--17688065
18
1.9
18
94
0
61
31
14
20
34
1.92
17688771--17688864
44
2.1
44
88
7
136
35
25
5
34
1.79
17688846--17688897
16
3.2
16
88
0
77
32
25
1
40
1.67
17688853--17688900
16
3.0
16
90
0
78
33
25
0
41
1.55
17690154--17690279
10
12.3
10
72
15
71
62
2
3
30
1.26
17690128--17690280
10
15.7
9
71
17
60
64
2
3
29
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17690128--17690280
21
7.8
19
68
21
68
64
2
3
29
1.22
17690479--17690531
19
2.8
19
80
5
54
30
9
1
58
1.40
17690534--17690568
11
3.2
11
83
0
52
22
2
2
71
1.13
17691758--17691785
3
9.3
3
100
0
56
32
0
0
67
0.91
17692462--17692513
17
3.1
17
85
0
77
36
5
19
38
1.76
17692491--17692543
23
2.4
22
84
12
72
33
3
16
45
1.66
17694448--17694607
26
6.2
26
93
0
275
33
7
23
35
1.83
17699631--17699773
75
1.9
75
95
0
259
46
13
4
34
1.63
17699872--17699923
16
3.2
16
83
5
70
38
3
26
30
1.74
17699905--17699998
44
2.1
46
88
4
138
31
6
26
35
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328