Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  9  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2678577--2678610
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0
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0
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1.9
20
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5
39
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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15
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17
16
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1.92
2772879--2773019
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2.6
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19
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16
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161
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473
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18
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4.6
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19
18
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1.96
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2.4
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18
16
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180
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19
17
29
1.94
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2.1
28
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5
0
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1.36
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25
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1.60
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4.7
46
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1
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21
24
14
39
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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0
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2.0
131
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0
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0
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0
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0
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36
10
13
39
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2878533--2878571
20
2.0
20
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0
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1.31
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0
57
1.12
2903379--2903414
17
2.1
17
90
10
56
44
0
0
55
0.99
2910158--2910200
21
2.2
20
87
8
61
58
0
2
39
1.11
2924533--2924614
20
4.1
20
95
3
146
10
25
19
43
1.83
2924534--2924615
41
2.0
41
97
0
155
12
25
19
42
1.86
2924683--2924733
20
2.5
21
84
9
70
47
1
5
45
1.38
2937123--2937175
26
2.0
26
92
0
88
39
7
0
52
1.30
2937797--2937834
15
2.4
16
86
8
60
31
0
7
60
1.25
2939036--2939083
19
2.7
18
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9
62
60
8
0
31
1.26
2939970--2940003
7
5.0
7
89
3
52
14
85
0
0
0.60
2949452--2949485
13
2.5
13
90
4
50
70
0
0
29
0.87
2950034--2950075
15
2.8
16
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14
52
64
0
2
33
1.07
2950051--2950150
42
2.6
38
73
16
89
60
2
4
34
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2950105--2950179
20
3.8
20
69
16
57
56
1
1
41
1.16
2950032--2950192
9
17.6
9
64
24
52
60
1
2
35
1.21
2950868--2950932
31
2.1
30
85
2
85
56
12
3
27
1.50
2952148--2952176
14
2.1
14
100
0
58
27
6
20
44
1.77
2964516--2964559
9
4.9
9
85
0
61
52
4
0
43
1.22
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17
1.9
18
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11
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42
12
0
45
1.41
2965575--2965639
21
3.2
21
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12
73
41
21
26
10
1.86
2965569--2965657
39
2.3
39
98
0
169
39
23
24
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1.89
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2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
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15
2.2
16
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5
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68
0
2
28
1.04
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2
24.0
2
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0
87
47
0
2
50
1.12
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16
2.6
16
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0
55
53
0
29
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1.44
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21
2.4
21
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21
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32
0
10
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1.31
2982575--2982607
13
2.4
14
90
10
50
45
0
3
51
1.16
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26
2.1
27
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50
5
1
42
1.35
2982976--2983027
27
2.0
26
84
3
68
46
9
0
44
1.36
2989490--2989514
7
3.6
7
100
0
50
16
0
0
84
0.63
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75
1.9
74
86
7
205
46
4
2
46
1.37
2989854--2989896
20
2.2
19
83
4
50
55
0
4
39
1.20
2991552--2991581
12
2.5
12
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0
51
46
23
0
30
1.52
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21
2.1
21
86
0
61
29
9
34
27
1.87
3005192--3005225
13
2.6
13
80
0
50
26
0
2
70
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3006857--3006890
9
3.8
9
92
0
59
11
8
0
79
0.94
3006995--3007061
22
3.0
23
80
14
77
43
0
0
56
0.99
3006995--3007061
23
2.9
24
82
10
77
43
0
0
56
0.99
3006975--3007070
21
4.3
23
75
11
67
43
1
1
54
1.14
3007076--3007146
37
1.9
36
88
2
106
43
1
4
50
1.30
3012463--3012561
10
10.4
9
75
10
65
51
3
1
44
1.23
3012453--3012515
29
2.2
29
91
2
101
55
3
0
41
1.16
3012454--3012561
39
2.8
39
74
12
100
52
2
0
43
1.22
3012531--3012620
33
2.7
34
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14
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53
0
1
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1.07
3012668--3012839
90
1.9
90
96
0
317
55
11
17
15
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328