Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  67  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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1.99
Indices
Period
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Copy
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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1.9
16
93
0
53
25
29
19
25
1.99
18618653--18618691
16
2.5
15
84
12
51
25
33
17
23
1.96
18618709--18618847
34
4.1
34
85
0
188
33
17
18
30
1.94
18618914--18618965
23
2.4
22
81
15
63
34
23
19
23
1.96
18619003--18619149
34
4.3
34
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1
170
36
14
14
34
1.87
18619181--18619226
24
1.9
24
81
0
56
34
13
13
39
1.83
18619309--18619337
15
1.9
15
100
0
58
31
27
20
20
1.98
18622789--18622815
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
18625594--18625631
7
5.3
7
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6
58
13
2
0
84
0.73
18625594--18625631
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15
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60
13
2
0
84
0.73
18627825--18627895
24
3.0
22
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11
70
53
1
0
45
1.09
18630989--18631026
15
2.4
17
91
8
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10
15
0
73
1.09
18631896--18631977
34
2.4
34
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2
112
34
13
13
39
1.84
18639176--18639235
30
2.0
30
93
0
102
30
18
21
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18646545--18646584
15
2.7
15
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0
53
20
37
0
42
1.52
18656051--18656177
47
2.7
47
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2
157
19
14
29
35
1.92
18657643--18657709
30
2.3
29
86
2
89
23
14
23
37
1.93
18657643--18657738
29
3.3
29
82
2
104
22
13
23
39
1.90
18673389--18673662
130
2.1
130
80
1
298
28
16
15
39
1.89
18673643--18674359
130
5.5
130
85
1
889
30
17
13
37
1.89
18673443--18673885
224
2.0
224
80
0
501
30
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14
38
1.89
18673714--18673925
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3.2
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30
17
14
37
1.89
18673643--18674359
259
2.8
260
87
0
986
30
17
13
37
1.89
18673642--18674359
389
1.8
389
87
0
1067
31
17
13
37
1.89
18682816--18682863
15
3.3
13
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18
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2
2
20
1.02
18682819--18682864
23
2.0
23
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16
60
73
2
2
21
1.04
18683200--18683232
17
1.9
17
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11
50
54
6
3
36
1.41
18683613--18683657
21
2.1
21
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4
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6
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44
1.62
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28
2.0
28
96
0
105
54
3
5
36
1.40
18685251--18685302
23
2.2
23
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10
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3
19
1.55
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32
2.4
33
83
8
92
63
11
10
15
1.51
18700241--18700309
28
2.5
28
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2
122
18
10
27
43
1.82
18702104--18702147
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
18704948--18704983
18
2.0
18
89
10
56
69
0
0
30
0.89
18710051--18710126
22
3.7
21
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15
68
40
17
6
35
1.75
18710087--18710158
19
3.9
19
85
10
114
36
13
11
38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18710080--18710158
35
2.2
37
84
13
112
35
15
10
39
1.81
18713703--18713727
11
2.3
11
100
0
50
20
0
8
72
1.10
18718198--18718252
29
1.9
28
92
3
92
47
3
5
43
1.44
18721234--18721280
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
18721541--18721889
46
7.9
46
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10
444
22
24
15
37
1.93
18721541--18721889
84
4.0
88
89
4
453
22
24
15
37
1.93
18721720--18721879
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4.0
38
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12
239
23
26
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1.96
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2.0
13
100
0
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1.46
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2.1
44
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4
148
27
7
12
52
1.65
18734420--18734506
44
2.0
44
90
0
138
32
10
8
49
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          321   322   323   324   325   326   327   328