Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  53  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15081246--15081283
2
19.0
2
94
0
67
47
0
2
50
1.15
15081451--15081489
16
2.4
16
95
0
69
35
12
0
51
1.40
15090068--15090114
24
2.0
22
84
15
60
19
12
6
61
1.52
15093516--15093575
29
2.1
29
81
6
70
65
1
6
26
1.27
15096910--15097009
12
8.8
11
70
16
62
58
0
5
37
1.20
15096929--15097009
3
27.0
3
70
14
51
60
0
4
34
1.18
15096954--15097004
15
3.2
15
76
15
57
60
0
3
35
1.15
15097649--15097690
13
3.2
13
80
19
52
80
0
16
2
0.81
15098495--15098741
43
5.7
44
78
8
247
21
21
20
36
1.96
15098450--15098696
130
1.9
130
90
5
392
22
21
20
35
1.96
15098501--15098749
87
2.9
87
86
1
331
23
21
20
35
1.96
15098891--15099045
44
3.5
44
74
6
143
18
23
21
36
1.95
15098888--15099052
88
1.9
87
87
3
242
19
23
21
35
1.96
15099865--15099897
8
4.0
8
92
7
57
15
0
0
84
0.61
15099864--15099897
17
2.0
17
94
0
59
14
0
0
85
0.60
15099864--15099897
9
3.9
9
92
7
52
14
0
0
85
0.60
15111066--15111090
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
15111464--15111563
12
8.8
11
70
16
62
58
0
5
37
1.20
15111483--15111563
3
27.0
3
70
14
51
60
0
4
34
1.18
15111508--15111558
15
3.2
15
76
15
57
60
0
3
35
1.15
15112168--15112209
13
3.2
13
80
19
52
80
0
16
2
0.81
15113900--15114287
3
127.7
3
68
15
140
61
3
6
28
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15113878--15113967
43
2.1
42
93
2
153
63
5
6
24
1.41
15121363--15121611
132
1.9
132
88
1
383
26
24
18
30
1.98
15130330--15130359
13
2.3
13
100
0
60
13
30
0
56
1.37
15135459--15135501
21
2.0
21
100
0
86
48
4
23
23
1.69
15138135--15138173
19
2.0
20
90
5
62
71
7
0
20
1.10
15140247--15140715
253
1.9
253
97
0
893
39
13
14
32
1.86
15142165--15142370
40
5.2
39
80
4
200
26
27
20
25
1.99
15147260--15147323
31
2.1
31
100
0
128
39
18
3
39
1.67
15148527--15148667
42
3.3
43
79
7
144
34
24
16
24
1.95
15148526--15148667
44
3.3
42
79
7
135
33
24
16
25
1.95
15153210--15153319
26
4.2
26
90
0
184
36
24
5
33
1.79
15159799--15159907
26
4.2
26
92
1
184
36
24
4
33
1.76
15160544--15160582
18
2.3
16
82
8
51
33
2
7
56
1.41
15160731--15160787
22
2.6
22
82
0
60
5
21
0
73
1.02
15167093--15167126
17
1.9
18
88
5
52
52
14
0
32
1.42
15168750--15168785
17
2.1
17
89
0
54
2
13
5
77
1.05
15168743--15168794
21
2.4
21
83
3
59
3
13
7
75
1.17
15168800--15168834
8
4.4
8
86
13
54
37
0
0
62
0.95
15168806--15168834
11
2.7
11
94
5
51
37
0
0
62
0.96
15168835--15168878
15
2.9
15
79
0
52
59
4
2
34
1.30
15169618--15169704
45
1.9
45
88
0
129
26
20
10
42
1.84
15170696--15170728
15
2.2
15
100
0
66
39
0
12
48
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15173950--15174033
42
2.0
42
100
0
168
38
21
23
16
1.93
15176280--15176396
4
29.2
4
98
0
225
50
0
24
24
1.50
15180858--15181503
3
217.7
3
70
11
291
60
3
7
29
1.39
15181287--15181337
22
2.3
22
79
3
57
56
1
3
37
1.29
15184681--15184857
67
2.6
67
79
8
191
28
23
14
33
1.94
15190229--15190259
2
16.0
2
93
6
55
51
0
0
48
1.00
15190332--15190393
21
2.9
19
76
19
54
66
0
4
29
1.12
15190430--15190468
14
2.9
14
85
7
55
71
0
0
28
0.86
15190585--15190627
19
2.3
18
88
4
59
62
2
0
34
1.08
15190838--15190876
21
2.0
20
85
10
53
56
5
2
35
1.35
15190871--15190945
14
5.3
14
73
10
55
64
0
4
32
1.12
15190965--15191005
21
1.9
22
90
5
66
60
0
2
36
1.10
15192580--15193337
206
3.7
205
92
1
1176
28
21
18
31
1.96
15205181--15205242
21
2.9
19
76
19
54
66
0
4
29
1.12
15205268--15205315
23
2.0
22
84
11
60
70
2
2
25
1.09
15205350--15205390
18
2.3
18
95
0
73
58
0
9
31
1.31
15205707--15205745
20
2.0
21
85
10
55
58
0
2
38
1.12
15205715--15205807
30
3.4
28
73
16
88
62
0
3
34
1.11
15205729--15205758
12
2.6
11
90
10
51
70
0
3
26
1.03
15205734--15205808
14
5.3
14
73
10
55
64
0
4
32
1.12
15205790--15205823
17
2.0
17
88
11
52
64
0
8
26
1.22
15209967--15210004
20
1.9
19
94
5
67
55
0
2
42
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15215025--15215063
20
2.0
20
100
0
78
56
5
12
25
1.57
15216664--15216733
32
2.2
32
84
0
86
15
1
22
60
1.44
15217407--15217541
26
5.2
26
94
1
227
33
5
25
36
1.78
15217407--15217541
51
2.6
52
96
1
245
33
5
25
36
1.78
15219312--15219735
137
3.1
137
97
0
812
25
19
24
31
1.98
15224708--15224841
26
5.2
26
94
3
218
33
5
24
36
1.78
15226615--15227025
137
3.0
137
98
0
804
25
18
24
31
1.98
15233922--15233970
21
2.4
20
90
6
80
22
8
6
63
1.44
15236272--15236322
10
5.0
10
79
9
50
3
19
17
58
1.54
15245495--15245520
13
2.0
13
100
0
52
15
30
38
15
1.88
15247900--15247964
3
21.0
3
96
3
112
32
0
0
67
0.91
15248567--15248615
24
2.0
24
100
0
98
28
8
16
46
1.75
15249103--15249166
31
2.1
31
96
0
119
46
17
9
26
1.78
15249444--15249556
51
2.2
51
95
0
199
30
23
12
32
1.92
15249535--15249573
7
5.6
7
87
0
51
17
30
10
41
1.83
15253593--15253636
20
2.2
20
83
4
52
68
4
2
25
1.20
15253677--15253705
3
9.7
3
100
0
58
0
31
0
68
0.89
15253704--15253753
3
16.3
3
95
4
91
34
0
0
66
0.92
15253979--15254019
21
2.0
21
95
0
73
53
12
12
21
1.70
15255903--15255943
21
1.9
22
85
14
59
39
2
2
56
1.26
15262094--15262140
2
23.5
2
91
0
76
48
2
2
46
1.25
15262300--15262351
20
2.5
21
87
6
79
53
7
0
38
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15262873--15262907
11
3.2
11
88
12
54
45
0
54
0
0.99
15263004--15263058
12
4.6
12
95
0
101
14
1
7
76
1.08
15263004--15263066
24
2.7
24
90
2
101
14
1
7
76
1.08
15263443--15263513
35
2.0
35
94
0
124
25
9
46
18
1.79
15263824--15263923
44
2.3
45
80
3
105
29
15
16
40
1.88
15264317--15265210
72
11.8
72
78
14
838
33
19
17
29
1.95
15264575--15264603
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
15264429--15265614
163
7.5
163
89
5
1692
33
19
17
28
1.95
15264738--15264766
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
15265197--15265225
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
15264233--15265538
622
2.1
621
97
1
2461
33
19
17
29
1.95
15265527--15265555
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
15277888--15277954
2
35.0
2
82
8
77
52
5
0
41
1.26
15278474--15278507
11
3.1
11
87
12
52
47
0
52
0
1.00
15278597--15278650
12
4.6
12
90
4
92
14
1
7
75
1.09
15278597--15278658
23
2.7
23
90
7
99
14
1
8
75
1.10
15278599--15278667
35
2.0
35
85
0
93
20
1
7
71
1.18
15279034--15279104
35
2.0
35
94
0
124
25
9
46
18
1.79
15280651--15280734
9
9.4
9
70
15
59
53
1
1
44
1.16
15280617--15280734
63
1.9
62
82
8
150
55
1
0
42
1.16
15280680--15280731
10
5.4
9
76
13
50
63
1
1
32
1.16
15286264--15286345
40
2.0
41
97
2
157
39
14
0
46
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15286540--15286583
15
2.8
16
82
10
54
75
0
4
20
0.98
15290592--15291023
88
5.0
85
70
16
291
37
18
16
27
1.92
15290771--15290832
30
2.1
30
87
6
90
41
27
9
20
1.84
15290983--15291194
79
2.7
77
86
5
266
33
17
17
30
1.94
15291037--15291507
168
2.9
165
78
12
455
33
18
17
29
1.95
15290603--15291436
253
3.4
241
82
8
911
35
18
17
28
1.94
15291188--15291540
77
4.7
75
89
3
462
32
19
17
31
1.95
15291188--15291540
149
2.4
148
86
3
476
32
19
17
31
1.95
15291494--15291589
49
2.0
49
93
0
165
32
19
15
32
1.93
15291422--15291656
121
1.9
121
94
0
416
34
18
16
31
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328