Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  3  of  328  ( 39316 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
743137--743161
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12
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0
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0
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1.70
746493--746621
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2
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0
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10
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30
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1.9
18
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5
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100
0
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12
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3.1
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61
35
66
44
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47
2.1
47
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0
198
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10
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2.6
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2
129
50
10
4
34
1.56
772724--772780
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2.2
25
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69
50
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0
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0
0
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16
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2
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2.0
20
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60
73
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2
13
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785306--785339
18
1.9
17
88
5
50
64
11
5
17
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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39
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2
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4.0
149
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2
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20
17
34
1.95
793271--793866
297
2.0
298
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2
950
27
20
17
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1.95
795828--795873
19
2.3
19
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65
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12
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1
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0
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0
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11
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0
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1.9
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1.54
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2
0
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2.7
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1
0
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1.08
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45
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60
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852441--852485
15
2.9
16
80
12
58
22
33
11
33
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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132
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20
23
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12
3.4
12
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0
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2
24
1.63
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18
2.0
19
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5
5
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1.48
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2.3
18
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7
52
52
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2
38
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11
58
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0
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2.5
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17
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1.79
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17
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52
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0
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1.58
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3
19
1.57
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2.8
42
80
3
123
20
58
2
18
1.51
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3
88
0
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2.5
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0
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14
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0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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13
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13
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2
0
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1.12
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2.1
32
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2
125
48
13
9
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1.73
918693--919249
272
2.0
273
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1080
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24
16
28
1.96
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1
108
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19
1.59
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2.5
26
73
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69
13
59
7
19
1.58
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45
2.5
44
81
7
121
27
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0
17
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0
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6
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1.52
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3.0
131
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3
449
27
18
19
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2.3
23
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11
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2.5
19
89
0
78
20
25
14
39
1.91
935253--935279
6
4.5
6
100
0
54
33
14
33
18
1.92
935245--935279
18
1.9
18
88
0
52
34
17
31
17
1.93
935275--935369
45
2.1
45
90
3
147
40
20
18
21
1.92
935347--935371
12
2.1
12
100
0
50
40
20
24
16
1.91
935582--935662
40
2.0
40
80
0
90
38
17
9
34
1.83
936421--936462
18
2.3
18
87
0
57
11
11
2
73
1.18
936428--936476
13
3.7
13
81
10
55
14
10
2
73
1.18
936484--936523
3
13.3
3
94
0
71
65
0
0
35
0.93
937651--937796
52
2.8
52
91
1
220
24
15
9
50
1.73
938480--938607
64
2.0
64
90
0
202
31
18
13
36
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
938632--938842
45
4.7
45
67
9
144
28
19
25
26
1.99
938630--939192
133
4.3
133
88
5
835
28
19
24
27
1.98
938943--939186
123
2.0
123
91
0
398
27
19
23
29
1.98
939138--939359
88
2.5
88
89
0
336
31
21
23
22
1.98
942330--942718
131
3.0
131
86
1
510
27
18
19
34
1.95
943124--943175
22
2.3
23
78
21
58
44
11
11
32
1.77
943720--943755
16
2.4
14
90
9
54
72
0
0
27
0.85
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13
2.4
14
90
9
52
70
0
0
29
0.87
946631--946885
39
6.5
39
90
1
386
29
29
22
18
1.97
960146--960228
12
6.7
12
69
13
60
21
61
1
15
1.41
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42
2.0
42
95
0
150
29
15
9
45
1.78
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29
2.7
29
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4
111
46
15
14
23
1.82
979000--979040
19
2.2
20
82
8
50
46
0
0
53
1.00
979732--979759
2
14.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
980275--980307
17
2.0
17
88
5
50
63
0
15
21
1.30
981752--981791
20
2.0
20
85
9
55
32
0
5
62
1.17
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6
6.0
6
100
0
72
83
0
0
16
0.65
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8
4.9
8
87
0
51
30
0
2
66
1.05
998942--999027
31
2.8
31
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3
93
56
5
10
26
1.55
1002645--1002677
16
2.1
16
100
0
66
6
12
21
60
1.53
1004952--1005001
25
2.0
25
96
0
91
30
16
22
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1006483--1006526
14
3.1
14
76
3
52
34
2
2
61
1.21
1017849--1018412
289
2.0
289
97
0
1056
18
19
9
52
1.71
1021468--1021511
3
14.7
3
100
0
88
34
0
0
65
0.93
1023141--1023175
10
3.4
10
84
7
52
40
31
0
28
1.57
1024865--1025336
125
3.8
125
83
5
567
38
18
15
27
1.91
1026114--1026144
5
6.0
5
92
7
53
77
3
0
19
0.90
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29
2.1
29
84
3
79
29
6
0
63
1.19
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3.9
16
79
4
74
37
0
1
60
1.06
1027085--1027150
33
2.0
33
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0
123
37
0
1
60
1.06
1035227--1035268
22
2.0
21
86
13
59
40
9
7
42
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328