Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  65  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17947134--17947241
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4.2
26
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0
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17947134--17947241
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2.1
52
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191
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23
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1.83
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2.1
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0
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12
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0
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2.2
21
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17992761--17992851
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17999940--18000371
197
2.2
198
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2
618
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10
19
37
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21
2.3
22
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4
26
34
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3.0
18
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1
1
51
1.22
18014451--18014508
24
2.3
26
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50
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2.1
19
100
0
80
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10
0
60
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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65
36
0
1
61
1.06
18034142--18034192
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0
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0
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19
28
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2.3
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28
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1.95
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31
15
29
1.95
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2.0
57
91
0
181
19
36
15
29
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
28
1.95
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2.0
113
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32
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27
1.94
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1.94
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2.0
157
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13
28
1.94
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88
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18
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1.95
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22
23
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18060410--18060448
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2.1
19
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4
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43
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2
53
1.14
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1.9
17
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0
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45
3
0
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1.16
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1
1
59
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0
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19
26
17
36
1.94
18065924--18066090
24
7.0
24
71
14
80
17
24
20
37
1.94
18068322--18068448
63
2.0
63
100
0
254
23
7
17
51
1.71
18070077--18070133
28
2.0
28
100
0
114
43
7
10
38
1.66
18071499--18071539
21
2.0
21
90
9
66
53
7
12
26
1.64
18073380--18073440
10
6.2
10
75
11
54
65
1
3
29
1.18
18074045--18074101
18
3.1
18
74
20
55
49
0
5
45
1.24
18074688--18074747
13
4.2
13
72
25
50
60
0
0
40
0.97
18076256--18076337
14
5.8
14
81
8
94
23
34
21
20
1.97
18076256--18076339
29
2.9
29
80
5
91
22
34
21
21
1.97
18076527--18076673
23
6.6
23
78
11
130
32
21
13
32
1.92
18076527--18076671
45
3.3
42
77
11
146
32
20
13
33
1.92
18076705--18076760
15
3.7
15
83
9
78
23
26
25
25
2.00
18076705--18076769
30
2.2
30
88
0
94
24
26
24
24
2.00
18078486--18078534
25
2.0
25
91
0
80
36
4
34
24
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18081697--18081929
90
2.6
90
82
8
267
33
7
9
49
1.64
18084694--18084735
19
2.2
19
91
0
66
38
4
2
54
1.34
18088579--18088744
81
2.0
81
90
0
260
32
16
21
29
1.95
18095836--18095882
23
2.0
23
95
0
85
63
0
6
29
1.19
18105577--18105688
10
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9
70
15
64
35
0
4
59
1.17
18105629--18105667
19
2.1
19
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0
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38
0
0
61
0.96
18107748--18107779
12
2.6
13
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14
50
0
50
3
46
1.17
18112775--18112828
17
3.1
17
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10
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53
0
3
42
1.18
18113441--18113659
121
1.8
122
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1
314
27
10
21
41
1.85
18115231--18115280
12
4.2
12
86
0
64
6
40
6
48
1.52
18115222--18115280
18
3.3
18
80
4
66
8
40
5
45
1.56
18124647--18124790
73
2.0
73
92
0
243
31
9
16
42
1.79
18126678--18126769
44
2.1
44
89
4
141
32
25
21
20
1.98
18134015--18134068
26
2.1
26
89
0
81
27
37
14
20
1.92
18134041--18134185
48
3.0
48
85
5
186
26
28
17
26
1.98
18135890--18135922
17
2.0
17
88
5
50
45
0
0
54
0.99
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11
3.2
10
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12
50
29
0
0
70
0.87
18139246--18139368
40
3.1
40
83
4
149
31
11
18
38
1.86
18139348--18139577
79
2.9
78
87
1
320
32
15
22
30
1.94
18142320--18142408
25
3.6
25
90
0
115
17
30
15
35
1.92
18142314--18142408
50
1.9
50
86
0
136
16
30
16
35
1.92
18146601--18146625
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18155133--18155242
49
2.2
49
85
6
143
22
28
15
33
1.95
18156220--18156261
20
2.0
22
90
9
70
40
16
0
42
1.48
18156906--18156949
3
14.7
3
100
0
88
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0
0
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0.93
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15
3.1
15
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3
76
30
4
0
65
1.12
18157904--18157950
13
3.5
13
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16
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38
6
0
55
1.26
18159394--18159445
20
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19
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0
0
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2.6
23
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1
0
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1.11
18159525--18159563
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19
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0
0
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4
0
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1.20
18164006--18164859
81
10.5
81
88
3
1060
35
15
23
25
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328