Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  44  of  328  ( 39316 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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170
26
22
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12801727--12801781
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21
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1.99
12809635--12809753
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5
170
26
22
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3.2
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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4
63
25
2
2
70
1.10
12933349--12933401
21
2.5
20
82
11
61
28
1
3
66
1.20
12933504--12933551
21
2.3
21
82
3
62
47
10
10
31
1.71
12934808--12934943
53
2.6
51
88
4
227
22
8
16
52
1.71
12934844--12934928
27
3.2
27
66
21
79
22
8
15
54
1.67
12940356--12940395
15
2.7
15
84
3
55
57
15
7
20
1.61
12952093--12952530
72
6.0
72
84
7
501
31
17
19
31
1.95
12952316--12952444
66
1.9
67
92
1
215
37
17
20
24
1.93
12952463--12952633
93
1.8
93
86
2
245
27
21
19
32
1.97
12952555--12953037
77
6.0
77
71
16
325
27
16
19
36
1.93
12952389--12952915
245
2.2
239
84
5
655
29
17
18
34
1.94
12953270--12953369
30
3.4
29
80
6
103
35
19
3
43
1.66
12955927--12955993
29
2.3
29
76
0
71
43
13
4
38
1.64
12956385--12956420
13
2.6
14
86
8
56
69
25
0
5
1.10
12959377--12959411
3
11.3
3
87
6
52
37
0
0
62
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12976332--12976391
30
2.0
30
87
6
86
36
8
26
28
1.85
12976813--12976989
47
3.8
46
80
13
218
20
20
29
29
1.98
12984355--12984452
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
12986162--12986239
40
2.0
40
86
0
111
20
14
34
30
1.92
12990943--12991003
31
2.0
31
86
0
86
27
27
18
26
1.98
12991099--12991468
70
5.3
70
83
3
372
30
24
15
30
1.95
12991139--12991468
139
2.4
139
82
2
358
28
25
15
30
1.96
12991099--12991468
35
10.6
35
86
2
332
30
24
15
30
1.95
12996819--12996890
31
2.3
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4
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41
8
8
41
1.65
12997858--12997893
13
2.8
14
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16
51
27
25
0
47
1.52
12997845--12997885
18
2.2
19
87
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59
29
24
0
46
1.53
12998008--12998142
39
3.4
38
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8
101
28
28
20
23
1.99
12999736--12999788
5
10.0
5
80
11
61
56
1
0
41
1.10
12999735--12999790
12
4.5
12
81
16
69
55
1
0
42
1.10
13010447--13010500
18
3.3
18
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28
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22
7
48
22
1.75
13010442--13010540
30
3.3
30
91
0
162
18
5
49
27
1.68
13011492--13011525
16
2.1
16
88
0
50
73
2
5
17
1.16
13011510--13012031
73
7.1
73
91
1
789
32
22
16
27
1.96
13011510--13012024
218
2.3
220
90
2
793
32
23
16
27
1.96
13023112--13023165
18
3.3
18
66
28
57
22
7
48
22
1.75
13023106--13023195
18
5.7
17
64
29
56
18
5
50
25
1.69
13023107--13023201
30
3.2
30
92
0
163
17
5
49
27
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13023861--13024241
86
4.4
83
73
12
288
35
18
14
31
1.92
13024154--13024187
13
2.5
14
90
4
52
67
0
8
23
1.18
13024012--13024627
73
8.0
81
80
11
329
33
21
16
28
1.95
13024178--13024694
73
7.1
73
88
3
711
31
23
17
28
1.97
13031724--13032061
44
7.5
44
75
7
257
31
15
22
30
1.94
13031727--13031991
133
2.0
133
83
4
338
30
15
21
31
1.95
13031920--13032093
95
1.8
95
81
7
219
33
16
20
29
1.95
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17
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21
2
0
76
0.90
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2.1
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60
8
0
31
1.26
13045766--13045799
16
2.2
16
89
5
52
0
17
0
82
0.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328