Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  55  of  328  ( 39316 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.19
15518777--15518845
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2.5
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2.2
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5
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1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
23
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1.9
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1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.34
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42
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0
29
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.82
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2.0
32
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16
12
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11
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1.65
15686891--15687053
85
1.9
85
85
0
227
32
15
20
31
1.93
15687635--15687685
24
2.3
21
80
12
57
39
9
11
39
1.75
15687643--15687685
21
1.9
23
86
13
63
39
6
9
44
1.64
15687713--15687761
22
2.3
19
78
21
53
44
8
2
44
1.45
15691498--15691554
15
3.5
15
69
17
51
50
5
0
43
1.24
15693578--15693619
21
2.0
22
90
4
68
21
4
14
59
1.53
15694615--15694643
9
3.3
9
95
4
51
79
0
20
0
0.74
15696766--15696798
10
3.3
10
84
16
50
60
0
3
36
1.12
15696766--15696809
17
2.6
18
85
7
56
63
0
2
34
1.07
15696724--15696809
20
4.3
21
73
20
78
62
0
5
31
1.18
15696747--15696825
37
2.2
32
77
18
77
63
2
2
31
1.21
15703898--15703959
23
2.5
26
82
10
76
43
6
6
43
1.55
15707704--15707751
16
2.9
16
90
6
69
39
0
0
60
0.97
15708563--15708594
2
17.0
2
87
12
50
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15710119--15710207
25
3.6
25
83
3
99
20
26
21
31
1.98
15710144--15710224
25
3.2
25
81
10
94
20
25
19
33
1.97
15710679--15710745
33
2.0
33
94
5
118
25
28
14
31
1.95
15711024--15711112
25
3.6
25
83
3
99
20
26
21
31
1.98
15711049--15711129
25
3.2
25
81
10
94
20
25
19
33
1.97
15711584--15711650
33
2.0
33
94
5
118
25
28
14
31
1.95
15711930--15712018
25
3.6
25
83
3
99
20
26
21
31
1.98
15711955--15712035
25
3.2
25
81
10
94
20
25
19
33
1.97
15712490--15712556
33
2.0
33
94
5
118
25
28
14
31
1.95
15710108--15713735
906
4.0
906
99
0
7249
28
13
19
38
1.90
15712836--15712924
25
3.6
25
83
3
99
20
26
21
31
1.98
15712861--15712941
25
3.2
25
81
10
94
20
25
19
33
1.97
15713396--15713462
33
2.0
33
94
5
118
25
28
14
31
1.95
15723073--15723099
13
2.1
13
100
0
54
40
7
14
37
1.74
15723753--15723800
16
2.9
16
87
6
60
39
2
0
58
1.10
15723765--15723828
25
2.6
25
75
5
67
37
3
1
57
1.24
15723898--15723944
23
2.0
25
83
8
62
29
6
8
55
1.55
15724164--15724203
12
3.3
12
85
0
53
32
5
0
62
1.17
15729209--15729270
30
2.1
30
82
8
74
66
3
4
25
1.27
15729247--15729281
18
1.9
18
88
0
52
65
2
0
31
1.07
15729696--15729747
24
2.2
24
92
0
86
48
1
3
46
1.31
15732899--15732935
3
12.3
3
94
0
65
29
35
2
32
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15738831--15738887
1
57.0
1
92
0
96
0
3
0
96
0.22
15739305--15739376
28
2.7
26
78
15
76
31
0
1
66
1.00
15739325--15739377
22
2.4
22
78
15
63
33
0
1
64
1.05
15739328--15739389
26
2.3
26
78
15
65
33
3
1
61
1.22
15740851--15741146
136
2.2
136
81
1
342
26
22
18
32
1.97
15742266--15742299
15
2.1
17
89
10
54
47
0
0
52
1.00
15742321--15742372
13
4.1
13
81
18
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46
0
0
53
1.00
15742317--15742376
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11
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20
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45
0
0
55
0.99
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2.0
13
100
0
52
23
7
7
61
1.49
15755338--15755375
20
1.9
20
84
10
51
52
5
2
39
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328