Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  197  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Copy
Number
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Score
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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Indices
Period
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Score
A
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(0-2)
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33
14
25
26
1.94
59087930--59088089
59
2.8
57
88
4
214
33
14
25
26
1.94
59095883--59096042
29
5.5
30
88
8
213
33
14
25
26
1.94
59095883--59096042
59
2.8
57
88
4
214
33
14
25
26
1.94
59100202--59100263
31
2.0
31
81
6
72
54
9
9
25
1.63
59100426--59100596
93
1.8
94
83
3
229
32
20
13
33
1.91
59100675--59100893
73
2.9
74
77
12
223
30
23
12
32
1.92
59101321--59101453
7
18.7
7
78
9
83
36
40
1
21
1.63
59101291--59101424
50
2.7
49
81
6
126
36
38
2
22
1.67
59101321--59101453
21
6.2
21
73
11
92
36
40
1
21
1.63
59101331--59101426
50
1.9
50
89
4
149
34
40
2
22
1.66
59101528--59101572
14
3.2
14
87
0
63
48
26
0
24
1.51
59101581--59101627
14
3.6
14
72
21
57
44
10
0
44
1.38
59101582--59101631
24
2.1
24
100
0
100
42
12
0
46
1.41
59102324--59102470
42
3.5
42
82
4
163
31
20
14
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59104967--59104992
13
2.0
13
100
0
52
38
15
7
38
1.76
59105344--59105381
13
2.9
14
80
11
53
52
15
10
21
1.72
59106977--59107020
20
2.2
20
95
0
79
47
20
6
25
1.74
59110561--59110631
33
2.2
33
100
0
142
16
19
23
39
1.92
59114798--59114864
25
2.7
24
77
9
64
34
1
5
58
1.32
59119783--59119950
40
4.2
40
80
3
187
25
21
27
26
1.99
59128072--59128239
40
4.2
40
80
3
196
25
22
27
25
2.00
59139084--59139555
43
10.7
43
68
12
260
29
21
23
25
1.99
59139075--59139650
133
4.3
133
96
0
1046
29
22
22
25
1.99
59142520--59142556
14
2.6
14
86
0
56
27
0
0
72
0.84
59142528--59142554
7
3.9
7
100
0
54
25
0
0
74
0.83
59143025--59143077
21
2.5
21
96
0
97
20
9
39
30
1.84
59143457--59143489
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
59145066--59145225
32
5.0
32
89
0
248
44
10
11
33
1.76
59145064--59145225
64
2.5
64
93
0
279
44
10
11
33
1.75
59149853--59149927
37
2.0
37
97
0
141
30
16
20
33
1.94
59150492--59150523
15
2.1
15
94
0
55
15
6
9
68
1.36
59153523--59153625
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
59161541--59161643
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
59163200--59163254
25
2.2
25
90
0
83
27
30
20
21
1.98
59166973--59167026
25
2.0
28
82
10
69
33
3
20
42
1.70
59167117--59167435
48
6.6
48
77
7
290
28
19
28
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59167117--59167435
96
3.3
96
82
6
335
28
19
28
23
1.98
59170555--59170617
13
4.8
13
78
7
65
34
4
22
38
1.75
59182658--59182712
21
2.7
21
91
2
85
14
12
12
60
1.60
59184951--59184993
22
2.0
22
85
0
59
34
25
18
20
1.96
59204183--59204402
119
1.8
119
80
9
261
25
26
20
27
1.99
59209064--59209187
50
2.6
47
81
11
139
28
17
30
23
1.97
59215772--59215820
24
2.0
24
96
0
89
38
22
4
34
1.73
59220832--59220856
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3
100
0
50
32
0
0
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0.90
59223872--59223912
22
1.9
22
90
5
66
17
26
46
9
1.79
59225107--59225277
46
3.7
46
81
7
168
22
27
21
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          321   322   323   324   325   326   327   328