Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  11  of  328  ( 39316 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3296304--3296351
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2
2
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24
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21
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3
6
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1.46
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2
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5
17
59
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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19
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13
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24
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19
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45
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3460326--3460350
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9
3.1
9
100
0
56
57
0
0
42
0.99
3500591--3500641
25
2.1
24
88
3
75
64
0
1
33
1.05
3500582--3500644
29
2.2
29
77
11
67
68
0
1
30
0.99
3508713--3508745
15
2.1
17
88
11
52
48
3
3
45
1.33
3513032--3513072
16
2.6
16
81
14
50
17
0
19
63
1.31
3515692--3515765
14
5.4
14
75
20
68
29
1
6
62
1.29
3515700--3515741
11
4.1
10
87
9
59
30
0
2
66
1.04
3515697--3515742
3
16.0
3
86
8
69
32
0
2
65
1.05
3516368--3516417
25
2.0
25
84
0
64
32
10
10
48
1.70
3516588--3516633
17
2.6
17
86
10
58
30
0
10
58
1.32
3517323--3517879
277
2.0
277
99
0
1096
33
22
11
31
1.90
3526842--3526893
21
2.4
21
81
12
61
59
5
9
25
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3527020--3527074
28
2.0
27
85
3
74
52
1
7
38
1.40
3527198--3527283
36
2.3
35
80
7
91
56
3
5
33
1.40
3527281--3527334
25
2.0
27
82
10
67
53
5
3
37
1.42
3527615--3527661
22
2.2
20
82
14
51
57
8
2
31
1.41
3527886--3527937
19
2.6
20
73
14
54
63
0
7
28
1.22
3528522--3528574
24
2.2
25
93
3
90
32
0
3
64
1.12
3530275--3530335
21
3.2
21
60
26
53
27
13
14
44
1.83
3530275--3530347
36
2.0
36
100
0
146
24
13
15
46
1.82
3536923--3536965
17
2.5
17
92
3
68
44
2
9
44
1.49
3550661--3550715
26
2.0
27
82
6
67
38
1
1
58
1.20
3554228--3554262
17
2.0
18
88
5
54
54
20
17
8
1.68
3557317--3557411
50
1.9
50
88
0
145
43
11
16
28
1.83
3557833--3557876
22
2.1
22
87
8
65
40
2
0
56
1.11
3565330--3565368
16
2.4
16
95
0
69
58
7
0
33
1.26
3568818--3568885
18
3.7
19
80
5
77
47
14
7
30
1.72
3569007--3569160
47
3.3
47
92
0
254
40
24
20
15
1.91
3569681--3569727
21
2.1
22
84
7
60
48
0
4
46
1.21
3571843--3571974
23
5.6
23
67
17
65
17
24
24
34
1.96
3571916--3571964
23
2.1
23
88
3
71
16
20
26
36
1.93
3572342--3572477
46
3.0
46
90
2
202
41
13
23
22
1.89
3579437--3579613
39
4.5
39
91
1
282
27
28
23
19
1.99
3579606--3579737
39
3.4
39
89
2
185
26
25
18
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3579437--3579730
78
3.7
78
83
5
233
27
27
21
23
1.99
3582089--3582118
8
3.8
8
90
0
51
36
26
13
23
1.92
3603039--3603107
34
2.0
34
97
0
129
30
8
18
42
1.81
3606455--3606486
14
2.1
16
88
11
50
0
6
12
81
0.87
3610297--3610347
18
2.7
19
75
22
54
41
5
1
50
1.37
3618768--3618943
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
3618765--3618936
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
3626223--3626398
46
3.8
46
78
12
207
20
20
29
29
1.98
3626220--3626391
93
1.8
93
94
0
308
20
20
29
28
1.98
3629959--3629989
15
2.1
15
100
0
62
19
12
0
67
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          321   322   323   324   325   326   327   328