Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr07 97507971 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  51  of  328  ( 39316 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14630315--14630365
24
2.1
25
85
10
70
27
0
11
60
1.31
14630902--14630936
10
3.6
10
92
3
54
25
5
0
68
1.11
14643922--14644073
44
3.4
44
92
1
232
32
13
23
29
1.93
14643922--14644092
88
1.9
89
83
4
218
32
14
24
28
1.94
14646416--14646726
44
7.0
44
78
7
279
32
15
21
30
1.95
14646455--14646665
89
2.4
88
80
4
237
33
15
21
29
1.94
14646414--14646724
133
2.3
133
78
5
324
32
15
21
29
1.95
14648108--14648185
3
26.0
3
83
5
95
33
2
2
61
1.23
14648086--14648185
9
10.7
9
80
13
60
39
2
2
57
1.22
14649506--14649630
45
2.8
45
85
0
160
22
16
17
43
1.88
14655705--14655826
46
2.7
43
82
10
129
29
19
27
22
1.98
14657528--14657553
5
5.2
5
100
0
52
61
0
0
38
0.96
14657528--14657561
15
2.3
15
89
0
50
64
2
0
32
1.08
14673290--14673317
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
14674347--14674381
16
2.3
15
90
5
52
62
2
2
31
1.24
14674495--14674554
23
2.9
20
70
15
59
56
5
6
31
1.47
14674611--14674642
2
16.5
2
93
6
57
53
0
0
46
1.00
14674668--14674719
24
2.2
23
83
10
61
59
0
3
36
1.16
14675231--14675286
18
3.4
18
68
27
52
21
7
46
25
1.76
14675198--14675296
30
3.3
30
88
0
153
18
5
50
26
1.67
14675949--14676269
88
3.6
85
79
8
295
37
19
14
28
1.91
14676175--14676800
77
8.2
76
80
10
613
33
20
16
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14676184--14676802
151
4.1
150
81
10
677
33
20
17
28
1.95
14676210--14676622
229
1.8
225
89
3
648
32
22
16
28
1.96
14676120--14676886
151
4.9
155
78
12
616
34
20
16
28
1.94
14676737--14676903
88
1.9
87
82
7
212
41
16
13
28
1.87
14676895--14677211
77
4.3
73
82
10
340
33
20
16
29
1.94
14676937--14677278
77
4.4
75
81
10
372
32
20
15
30
1.94
14677381--14677427
13
3.5
13
80
5
58
70
2
8
19
1.24
14677209--14677498
100
2.9
101
86
2
379
40
17
16
24
1.91
14677416--14677646
73
3.1
73
94
1
390
33
22
16
27
1.96
14677562--14677731
91
1.9
89
89
8
263
35
20
17
27
1.94
14684664--14684698
16
2.3
15
90
5
52
62
2
2
31
1.24
14684811--14684870
23
2.9
20
70
15
59
56
5
6
31
1.47
14684811--14684945
25
5.9
22
71
16
71
56
5
5
32
1.46
14684938--14685069
25
5.6
25
73
15
93
54
3
6
36
1.41
14684924--14685052
50
2.6
47
79
9
123
53
3
5
37
1.40
14686141--14686176
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
14686128--14686168
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
14686291--14686425
39
3.4
38
73
8
101
28
28
20
23
1.99
14686665--14686703
18
2.1
19
90
4
62
48
10
0
41
1.37
14687999--14688051
5
10.0
5
80
11
61
56
1
0
41
1.10
14687998--14688053
12
4.5
12
81
16
69
55
1
0
42
1.10
14692571--14692606
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14692558--14692598
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
14692721--14692855
39
3.4
38
73
8
101
28
28
20
23
1.99
14693095--14693133
18
2.1
19
90
4
62
48
10
0
41
1.37
14694451--14694500
5
10.0
5
82
8
66
56
2
0
42
1.11
14699020--14699055
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
14699007--14699047
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
14699170--14699304
39
3.4
38
73
8
101
28
28
20
23
1.99
14699544--14699582
18
2.1
19
90
4
62
48
10
0
41
1.37
14700893--14700945
5
10.0
5
80
11
61
56
1
0
41
1.10
14700892--14700947
12
4.5
12
81
16
69
55
1
0
42
1.10
14701417--14701515
30
3.3
30
86
0
153
18
6
49
26
1.70
14702650--14702683
14
2.3
14
90
10
50
41
0
2
55
1.15
14704288--14704349
25
2.5
24
80
10
72
33
0
1
64
1.03
14704289--14704339
26
2.0
25
84
3
66
35
0
1
62
1.06
14704337--14704379
20
2.2
20
95
0
77
44
0
2
53
1.13
14712400--14712481
39
2.1
39
100
0
164
43
4
31
19
1.72
14727849--14727977
43
3.0
43
85
5
136
31
17
24
26
1.97
14727864--14727977
43
2.7
43
87
5
151
30
17
24
27
1.97
14727913--14728007
43
2.2
46
81
11
110
31
15
23
29
1.95
14728132--14728238
43
2.4
45
76
4
121
30
14
23
31
1.94
14727779--14728411
219
2.9
218
86
1
845
32
17
23
26
1.96
14728131--14728834
177
4.0
177
89
1
993
30
17
24
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14728485--14728588
43
2.4
43
79
6
102
29
17
25
27
1.97
14728706--14728948
134
1.8
134
83
3
328
31
16
22
30
1.95
14728529--14729145
311
2.0
308
81
6
728
31
17
23
27
1.97
14728706--14728985
134
2.1
134
81
2
321
30
17
21
30
1.96
14728862--14729185
177
1.8
178
89
2
508
31
18
24
25
1.97
14731135--14731167
17
1.9
17
93
0
57
27
6
9
57
1.53
14731295--14731330
18
1.9
18
88
5
54
30
5
5
58
1.44
14736416--14736486
35
2.0
35
97
0
133
29
8
18
43
1.79
14740348--14740378
11
2.9
11
95
4
55
22
0
0
77
0.77
14740374--14740420
10
4.5
10
75
19
51
38
0
2
59
1.09
14740370--14740424
23
2.4
23
81
6
76
36
0
1
61
1.06
14740463--14740509
23
2.1
23
84
11
62
68
2
0
29
1.02
14742800--14742933
40
3.3
41
69
18
107
56
2
3
37
1.29
14743506--14743540
18
1.9
18
94
0
61
48
11
5
34
1.63
14747409--14747433
13
1.9
13
100
0
50
64
0
0
36
0.94
14749843--14750006
71
2.3
71
97
0
310
34
18
28
18
1.95
14763794--14763820
14
1.9
14
100
0
54
14
0
0
85
0.61
14763896--14763933
19
2.0
19
94
0
67
34
10
23
31
1.89
14764202--14764233
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
14769636--14769667
2
17.0
2
87
12
50
53
0
0
46
1.00
14769949--14769993
17
2.6
17
89
0
63
6
8
0
84
0.78
14771573--14771621
18
2.8
18
79
14
57
46
2
0
51
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14771590--14771634
21
2.1
21
83
0
54
42
2
2
53
1.25
14771649--14771738
10
9.0
10
72
16
55
31
2
1
65
1.12
14771647--14771744
50
2.0
50
84
8
128
32
3
1
63
1.17
14771694--14771754
30
1.9
32
87
12
90
40
1
1
55
1.19
14773035--14773087
26
2.0
26
82
7
63
9
33
1
54
1.43
14779592--14779625
17
1.9
18
94
5
61
64
0
2
32
1.08
14779717--14779745
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
14781947--14782122
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
14781944--14782115
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
14789501--14789676
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
14789498--14789669
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
14791838--14792422
136
4.3
137
76
7
537
29
20
18
32
1.96
14791624--14792470
45
18.7
44
68
11
318
28
20
19
32
1.96
14791791--14792277
269
1.8
269
92
0
830
29
21
17
31
1.96
14791886--14792480
144
4.3
141
75
10
453
28
20
17
33
1.96
14794152--14794231
26
3.0
26
80
3
88
30
5
7
57
1.48
14795925--14796074
46
3.3
46
87
1
212
27
26
12
34
1.92
14795925--14796110
91
2.0
92
83
3
232
26
24
14
34
1.94
14796906--14796959
24
2.2
24
84
12
67
16
0
7
75
1.01
14798345--14798381
19
1.9
19
88
0
56
64
5
10
18
1.43
14800337--14800381
19
2.3
20
85
7
58
44
13
20
22
1.85
14802443--14802506
17
3.9
16
78
12
67
67
0
4
28
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14804728--14804784
2
28.0
2
92
3
96
50
1
0
47
1.11
14807949--14808038
19
4.9
19
83
15
127
36
12
14
36
1.84
14808325--14808359
18
2.0
17
88
5
52
31
0
0
68
0.90
14811449--14811479
16
1.9
16
93
0
53
54
3
0
41
1.16
14814247--14814406
29
5.6
29
87
3
198
25
16
31
26
1.96
14814243--14814407
57
2.9
58
84
3
201
26
15
31
26
1.96
14821754--14821914
29
5.6
29
87
1
207
25
16
32
26
1.96
14829726--14830315
220
2.7
220
93
1
984
32
18
22
26
1.97
14830257--14830494
78
3.1
78
88
1
343
32
19
23
24
1.98
14830477--14830521
18
2.6
17
83
16
58
40
15
24
20
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328