Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  62  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17127135--17127206
4
18.0
4
82
0
90
41
6
25
26
1.80
17128834--17128935
37
2.6
38
75
20
95
58
3
4
32
1.37
17130341--17130422
27
2.9
28
90
5
130
4
3
20
70
1.21
17130911--17130987
35
2.2
35
97
0
145
22
16
5
55
1.61
17138572--17138609
17
2.2
16
86
13
58
31
0
10
57
1.32
17138575--17138609
18
2.0
17
94
5
61
34
0
11
54
1.37
17144232--17144275
15
3.0
14
83
9
52
11
15
2
70
1.26
17146672--17146731
30
2.0
30
93
0
102
26
0
13
60
1.34
17163863--17163919
28
2.1
27
93
3
96
40
7
17
35
1.77
17164494--17164527
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
17167145--17167203
29
2.0
29
90
6
93
61
3
8
27
1.41
17168547--17168590
22
2.0
22
86
0
61
40
2
4
52
1.34
17168735--17168776
21
2.0
21
86
9
59
40
2
0
57
1.12
17176309--17176355
22
2.3
19
85
14
58
44
2
0
53
1.12
17176311--17176352
16
2.7
15
79
20
50
45
2
0
52
1.13
17176987--17177047
25
2.4
24
78
8
68
36
1
1
60
1.16
17177007--17177060
25
2.2
25
80
12
58
38
1
1
57
1.20
17179863--17179906
22
2.0
22
86
0
61
38
0
4
56
1.20
17180043--17180087
22
2.0
22
87
8
65
42
2
0
55
1.12
17190497--17190548
25
2.1
25
96
0
95
36
7
11
44
1.70
17190791--17190841
20
2.5
20
100
0
102
17
37
33
11
1.86
17194683--17194717
17
2.1
16
94
5
61
22
0
17
60
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17196712--17196773
20
3.0
20
77
17
74
67
1
8
22
1.25
17196714--17196773
10
6.0
10
79
14
63
68
1
8
21
1.25
17196714--17196771
30
1.9
30
83
13
75
68
1
8
20
1.25
17198744--17198790
15
3.1
15
73
11
51
70
0
6
23
1.10
17198759--17198825
5
13.4
5
76
17
68
76
0
2
20
0.92
17200921--17200998
40
2.0
40
97
0
147
19
12
37
30
1.89
17201361--17201428
29
2.4
28
85
4
91
69
4
2
23
1.21
17201376--17201434
29
2.1
29
87
6
86
71
1
3
23
1.11
17207048--17207114
33
2.0
33
100
0
134
40
17
5
35
1.75
17213454--17213545
45
2.0
45
93
0
157
33
13
29
23
1.92
17219625--17219663
15
2.4
16
87
8
53
35
0
0
64
0.94
17220809--17220845
17
2.2
16
95
4
65
32
0
5
62
1.18
17222401--17222638
24
10.0
23
83
5
190
31
16
23
28
1.96
17222436--17222640
24
8.7
23
86
2
194
29
16
24
29
1.96
17222436--17222638
94
2.1
95
85
2
275
30
16
24
29
1.96
17222643--17222766
43
2.8
43
87
2
176
24
14
21
39
1.91
17227960--17228236
50
5.5
50
93
0
464
36
16
22
25
1.94
17228215--17228298
31
2.7
31
86
1
114
29
20
25
25
1.99
17238223--17238258
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
17244642--17244712
31
2.3
31
82
0
88
38
8
8
45
1.65
17247539--17247595
27
2.1
26
78
9
60
31
0
21
47
1.51
17247901--17247947
24
2.0
23
88
12
69
53
0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17247902--17247944
15
2.9
15
83
10
61
55
0
0
44
0.99
17249258--17249288
2
16.0
2
93
6
55
48
0
0
51
1.00
17250268--17250292
13
1.9
13
100
0
50
24
0
0
76
0.80
17251347--17251391
22
2.0
22
100
0
90
48
4
8
37
1.55
17255369--17255399
15
2.1
15
93
0
53
51
0
3
45
1.17
17257335--17257359
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
17258680--17258731
27
1.9
27
85
14
72
51
1
11
34
1.49
17260650--17260696
24
2.0
24
84
16
62
25
2
6
65
1.27
17261115--17261142
10
2.8
10
100
0
56
17
10
10
60
1.57
17268060--17268111
24
2.2
24
82
0
59
51
11
3
32
1.56
17268924--17268959
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
17269298--17269363
30
2.2
31
83
2
80
50
9
0
40
1.34
17276663--17276722
25
2.3
26
80
2
68
28
18
20
33
1.96
17283375--17283400
12
2.2
12
100
0
52
76
7
0
15
0.99
17283669--17283698
15
2.0
15
93
0
51
23
13
16
46
1.82
17285572--17285626
28
2.0
28
82
7
67
52
7
7
32
1.56
17285814--17285853
18
2.3
17
91
4
62
20
2
7
70
1.24
17286942--17286992
10
5.0
10
80
9
59
62
0
0
37
0.95
17286922--17286979
19
3.0
19
84
2
71
58
5
0
36
1.20
17288542--17288604
22
2.9
22
82
0
72
17
28
15
38
1.91
17290041--17290102
13
4.8
13
87
0
88
33
8
20
37
1.83
17291230--17291344
27
4.3
26
83
5
131
37
21
22
18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17291230--17291344
54
2.1
54
85
3
160
37
21
22
18
1.94
17291734--17291763
8
3.8
8
90
0
51
3
26
26
43
1.70
17300697--17300727
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
17307209--17307260
22
2.3
22
83
3
59
63
1
3
30
1.23
17307223--17307320
52
1.9
49
81
6
115
54
7
8
30
1.57
17307614--17307646
13
2.5
13
90
0
57
72
0
3
24
0.98
17316525--17316654
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
17316488--17316654
80
2.1
79
81
7
196
25
23
27
23
2.00
17320151--17320178
13
2.2
13
100
0
56
7
21
39
32
1.80
17324577--17324706
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
17324540--17324706
80
2.1
79
81
7
196
25
23
27
23
2.00
17327870--17327981
27
4.2
26
85
7
143
37
23
24
15
1.93
17327870--17327981
54
2.1
54
88
3
163
37
23
24
15
1.93
17335695--17335806
27
4.2
26
85
7
143
37
23
24
15
1.93
17335695--17335806
54
2.1
54
88
3
163
37
23
24
15
1.93
17346362--17346422
30
2.1
29
96
3
113
39
22
13
24
1.90
17349160--17349188
3
9.7
3
100
0
58
0
31
0
68
0.89
17349915--17350032
59
2.0
59
98
0
227
27
15
5
51
1.64
17351942--17352078
37
3.5
39
75
12
120
32
26
15
26
1.95
17352264--17352333
2
35.5
2
80
18
76
48
5
0
45
1.26
17352252--17352346
43
2.3
43
94
3
167
45
10
1
43
1.45
17353093--17353167
27
2.7
26
77
20
82
49
1
4
45
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17353576--17353619
23
1.9
23
85
0
61
29
13
29
27
1.94
17356043--17356103
26
2.3
26
80
0
68
24
18
16
40
1.90
17357904--17358045
60
2.4
61
80
8
166
27
23
19
29
1.98
17360494--17360637
43
3.3
43
79
8
150
23
19
29
27
1.98
17360561--17360649
43
2.1
43
84
0
115
26
16
31
24
1.97
17365058--17365195
60
2.3
60
78
6
145
28
23
18
29
1.97
17372517--17372553
19
1.9
19
94
0
65
29
10
10
48
1.72
17373137--17373222
42
2.1
41
89
6
129
27
10
10
51
1.69
17377491--17377525
17
2.1
17
89
5
54
74
0
11
14
1.08
17377710--17377750
16
2.6
16
96
3
75
56
0
9
34
1.32
17381741--17382267
265
2.0
264
95
0
946
35
15
17
31
1.91
17384954--17384982
14
2.0
15
93
6
51
27
0
20
51
1.47
17386105--17386276
43
4.0
43
70
17
135
25
18
26
30
1.98
17396857--17396886
12
2.5
12
94
0
51
6
20
43
30
1.77
17400781--17400917
53
2.4
58
79
13
176
18
18
18
43
1.88
17400893--17400923
6
5.2
6
96
0
53
16
19
16
48
1.81
17401037--17401106
18
3.8
18
75
9
61
32
11
11
44
1.76
17401113--17401168
18
3.1
18
80
10
69
39
5
14
41
1.68
17401113--17401195
36
2.3
36
85
0
103
39
6
12
42
1.67
17406457--17406487
3
10.7
3
93
6
55
0
67
0
32
0.91
17406458--17406485
14
2.0
14
100
0
56
0
71
0
28
0.86
17410108--17410149
4
10.5
4
84
0
57
47
23
2
26
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17411617--17411695
37
2.1
37
100
0
158
34
16
16
32
1.91
17421686--17421752
34
2.0
34
96
0
125
17
35
4
41
1.70
17422510--17422560
25
2.0
25
100
0
102
27
31
19
21
1.97
17423216--17423268
6
9.3
6
78
12
58
16
1
1
79
0.92
17423216--17423268
11
4.7
11
81
11
63
16
1
1
79
0.92
17423812--17423874
29
2.2
28
78
13
65
30
7
0
61
1.24
17423823--17423883
15
3.9
16
81
14
65
29
8
0
62
1.24
17423815--17423883
32
2.2
32
82
10
79
30
8
0
60
1.26
17423841--17423886
15
2.9
15
93
6
74
26
8
0
65
1.21
17424026--17424188
3
53.7
3
87
6
222
32
2
1
63
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328