Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  43  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12478838--12478874
19
2.0
18
89
5
56
70
0
0
29
0.88
12479142--12479184
21
2.0
22
90
4
70
34
18
6
39
1.78
12479163--12479199
19
1.9
19
94
0
65
32
16
10
40
1.83
12479326--12479366
21
2.0
21
85
9
57
7
2
14
75
1.12
12489002--12489027
4
6.5
4
100
0
52
50
23
0
26
1.50
12491177--12491211
18
1.9
18
100
0
70
28
28
5
37
1.80
12491368--12491394
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
12492160--12492193
2
17.0
2
87
0
50
50
5
0
44
1.26
12492501--12492525
12
2.1
12
100
0
50
0
8
0
92
0.40
12495532--12495577
22
2.1
22
100
0
92
32
30
8
28
1.87
12495831--12495890
28
2.2
26
80
11
75
26
25
11
36
1.90
12495845--12495907
28
2.2
28
94
0
108
28
26
11
33
1.91
12500841--12501196
57
6.2
57
94
1
599
29
35
17
17
1.93
12500840--12501196
113
3.1
114
93
1
610
29
35
17
17
1.93
12500840--12501196
170
2.1
170
93
1
608
29
35
17
17
1.93
12503108--12503167
28
2.2
26
80
11
75
26
25
11
36
1.90
12503122--12503184
28
2.2
28
94
0
108
28
26
11
33
1.91
12506346--12506488
39
3.6
39
89
1
214
29
23
17
30
1.97
12506310--12506488
79
2.3
79
88
1
252
29
22
17
30
1.97
12513041--12513078
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
12514852--12514897
18
2.6
17
83
12
58
17
26
41
15
1.88
12516979--12517221
122
2.0
121
91
0
396
23
17
18
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12517945--12517988
20
2.2
20
84
8
54
45
6
6
40
1.57
12526924--12526951
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
12529726--12529752
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
12532769--12532856
23
3.6
23
65
14
59
59
25
5
10
1.52
12535764--12535827
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
12536017--12536135
24
5.0
24
88
5
161
27
22
21
28
1.99
12536017--12536135
47
2.5
48
87
5
161
27
22
21
28
1.99
12536186--12536245
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
12536186--12536240
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
12536288--12536335
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
12543844--12543906
30
2.1
31
93
3
110
23
22
14
39
1.91
12544097--12544214
24
5.0
24
87
7
161
27
22
21
28
1.99
12544097--12544214
46
2.5
48
87
6
161
27
22
21
28
1.99
12544265--12544318
11
5.4
11
70
20
55
31
20
11
37
1.88
12544265--12544323
19
3.0
20
95
5
111
33
20
10
35
1.86
12544366--12544413
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
12546348--12546396
3
16.0
3
79
12
55
34
2
2
61
1.19
12546337--12546401
15
4.3
15
75
18
55
32
3
4
60
1.33
12559027--12559160
71
1.9
71
87
0
196
30
16
23
29
1.96
12558936--12559322
160
2.4
160
96
0
704
29
17
20
32
1.96
12559187--12559362
71
2.5
72
85
2
230
31
15
22
30
1.95
12559401--12559574
68
2.6
66
80
7
181
28
14
17
39
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12561447--12561481
3
11.3
3
87
6
52
37
0
0
62
0.95
12566805--12566844
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
12570155--12570288
62
2.1
62
80
4
153
23
23
25
27
2.00
12576081--12576110
15
2.0
15
93
0
51
26
16
20
36
1.93
12581794--12581859
28
2.5
28
85
7
84
28
6
1
63
1.27
12582141--12582192
24
2.1
26
85
7
72
30
0
7
61
1.24
12583665--12583704
6
6.7
6
100
0
80
0
15
15
70
1.18
12583665--12583709
18
2.6
18
92
3
65
2
13
13
71
1.25
12584217--12584260
19
2.3
19
84
7
54
20
20
13
45
1.85
12587315--12587392
39
2.0
39
100
0
156
23
20
15
41
1.90
12588252--12588657
133
3.1
133
83
2
487
30
20
24
24
1.99
12588615--12588725
45
2.5
45
82
7
129
31
18
24
26
1.97
12591430--12591459
5
6.0
5
92
0
51
83
16
0
0
0.65
12592527--12592739
3
70.0
3
76
9
173
32
5
1
60
1.27
12594598--12595310
3
238.0
3
71
12
405
60
2
7
29
1.38
12596877--12596911
12
2.9
12
82
0
52
74
0
0
25
0.82
12597552--12597605
27
2.0
27
96
0
99
48
9
7
35
1.63
12601550--12601581
5
6.6
5
92
7
57
40
0
0
59
0.97
12601545--12601581
15
2.6
14
88
12
58
40
0
0
59
0.97
12602850--12602906
15
3.9
15
88
2
89
35
0
12
52
1.39
12603279--12603382
42
2.4
42
85
3
154
12
24
29
33
1.92
12603300--12603370
21
3.4
21
100
0
142
11
29
32
26
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12607917--12607953
5
7.6
5
93
6
67
40
0
0
59
0.97
12609215--12609271
15
3.9
15
88
2
89
35
0
12
52
1.39
12609643--12609727
23
4.0
23
69
17
74
15
21
24
38
1.92
12609655--12609703
21
2.2
22
92
7
82
12
24
28
34
1.91
12612797--12612832
17
2.1
17
100
0
72
52
16
5
25
1.65
12615205--12615242
17
2.2
18
90
4
60
26
0
2
71
1.00
12617814--12617859
18
2.6
18
86
6
58
30
34
21
13
1.91
12621180--12621218
20
2.1
19
85
9
53
53
17
25
2
1.56
12624402--12624440
20
2.1
19
85
9
53
58
17
20
2
1.50
12625870--12625897
13
2.2
13
100
0
56
53
14
0
32
1.41
12634277--12634305
13
2.2
13
100
0
58
55
13
0
31
1.39
12643950--12644050
39
2.6
39
90
0
148
41
23
21
12
1.88
12648524--12648641
31
3.5
35
89
9
135
22
23
16
37
1.94
12648547--12648641
31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
12648833--12648949
24
5.0
24
85
9
152
27
22
21
29
1.99
12648833--12648949
46
2.5
48
84
9
152
27
22
21
29
1.99
12649000--12649038
20
2.0
20
100
0
78
30
20
10
38
1.86
12649080--12649128
25
2.0
25
87
0
71
26
16
24
32
1.96
12660657--12660726
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
12675369--12675409
11
3.7
11
80
0
55
19
14
9
56
1.66
12675450--12675510
30
2.0
30
83
0
77
26
6
11
55
1.59
12675635--12675666
11
2.8
12
86
13
50
65
0
0
34
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12699971--12700012
22
1.9
22
85
9
59
85
2
9
2
0.77
12705087--12705116
13
2.4
13
94
5
53
70
0
0
30
0.88
12707206--12707259
23
2.3
24
78
15
60
25
7
1
64
1.30
12710476--12710509
13
2.6
13
90
0
50
44
2
0
52
1.16
12711025--12711133
21
5.1
21
85
4
128
15
22
25
36
1.93
12717329--12717367
12
3.2
12
82
7
51
48
0
0
51
1.00
12717318--12717371
13
4.6
12
76
17
51
51
0
0
48
1.00
12717889--12717984
21
4.5
21
89
2
129
13
22
27
36
1.92
12717876--12717984
42
2.5
42
85
2
137
15
22
25
35
1.94
12723893--12723918
13
2.0
13
100
0
52
46
0
7
46
1.31
12725074--12725137
34
1.9
33
83
3
83
42
12
17
28
1.85
12727283--12727353
34
2.2
31
83
14
83
28
11
28
32
1.91
12727296--12727365
34
2.1
34
100
0
140
22
11
30
35
1.90
12754873--12754976
29
3.6
28
83
10
138
31
16
24
27
1.96
12762983--12763086
29
3.6
28
83
10
138
31
16
24
27
1.96
12768552--12768585
17
2.0
17
88
11
52
14
35
38
11
1.83
12775396--12775440
17
2.9
16
72
27
51
0
15
11
73
1.10
12775419--12775458
19
2.0
20
85
4
55
0
10
15
75
1.05
12776200--12776234
3
11.7
3
100
0
70
68
0
0
31
0.90
12776567--12776597
14
2.2
14
94
0
53
70
3
12
12
1.27
12780045--12780086
21
2.0
21
86
9
59
16
26
4
52
1.63
12782901--12782952
15
3.4
15
78
2
50
51
5
7
34
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12782975--12783005
2
15.5
2
93
0
53
48
0
3
48
1.17
12783625--12783662
18
2.1
18
90
9
60
2
7
0
89
0.57
12784572--12784849
73
3.8
74
88
3
359
28
21
18
31
1.97
12784572--12785241
159
4.4
145
80
10
420
30
21
17
30
1.96
12784527--12784849
73
4.5
71
85
6
334
29
21
17
31
1.96
12784875--12785241
71
4.9
71
70
15
279
30
22
16
30
1.96
12784717--12785170
159
2.8
160
91
2
698
30
22
17
29
1.96
12785035--12785241
73
2.9
71
85
5
274
28
23
16
30
1.97
12784876--12785331
233
2.0
233
95
0
831
30
21
17
30
1.96
12797557--12797610
15
3.5
15
79
2
54
53
5
9
31
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328