Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  5  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1399031--1399081
18
2.8
18
71
11
50
39
3
27
29
1.74
1400299--1400337
19
2.1
18
90
4
60
41
5
5
48
1.47
1400525--1400559
2
17.0
2
88
5
52
45
2
2
48
1.32
1406343--1406379
15
2.4
16
86
13
51
56
10
0
32
1.34
1406484--1406567
20
4.2
21
81
7
77
38
0
3
58
1.16
1406483--1406566
39
2.1
40
84
6
109
39
0
3
57
1.16
1408234--1408273
12
3.0
13
85
14
55
45
2
2
50
1.28
1409253--1409362
29
3.8
28
80
5
121
31
20
21
25
1.98
1409255--1409386
58
2.3
58
80
5
142
28
21
22
27
1.99
1414313--1414451
39
3.5
40
91
2
203
20
23
27
29
1.98
1414313--1414467
39
3.9
39
90
2
188
18
21
28
30
1.97
1417521--1417603
30
2.8
29
73
12
80
51
4
10
32
1.58
1417521--1417614
29
3.1
30
73
17
86
50
5
12
31
1.63
1417709--1417740
16
2.0
16
93
0
55
40
3
6
50
1.43
1421279--1421318
17
2.3
18
87
8
57
32
0
22
45
1.53
1423387--1423417
14
2.1
15
94
5
55
64
3
0
32
1.09
1430318--1430347
3
10.0
3
92
0
51
70
0
30
0
0.88
1434156--1434189
2
17.5
2
93
6
61
47
0
0
52
1.00
1438351--1438376
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
1441308--1441427
48
2.5
48
98
0
231
39
19
0
41
1.51
1443950--1444009
30
2.0
30
93
0
102
31
8
11
48
1.69
1450455--1450501
22
2.1
22
84
7
60
63
2
2
31
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1454719--1454845
60
2.1
58
84
4
155
40
9
12
37
1.76
1460592--1460617
12
2.2
12
100
0
52
34
23
7
34
1.83
1464367--1464391
11
2.3
11
100
0
50
64
0
0
36
0.94
1464353--1464386
17
2.1
16
88
5
50
58
2
0
38
1.13
1465890--1465931
3
14.0
3
100
0
84
33
0
0
66
0.92
1465943--1465998
27
2.1
27
96
0
103
35
41
5
17
1.73
1469783--1469823
16
2.5
17
80
15
50
36
4
7
51
1.51
1473212--1473259
24
1.9
25
83
8
62
39
2
12
45
1.54
1475719--1475759
21
2.0
21
85
0
55
31
2
2
63
1.20
1484698--1484744
23
2.0
23
87
8
67
48
6
12
31
1.66
1486156--1486220
31
2.1
31
86
11
89
53
6
4
35
1.46
1486406--1486469
3
21.3
3
90
0
101
67
0
4
28
1.11
1486515--1486586
37
1.9
37
83
10
94
58
5
5
30
1.44
1488170--1488367
107
1.8
108
91
1
326
33
19
15
31
1.93
1488170--1488367
54
3.7
54
92
0
317
33
19
15
31
1.93
1488402--1488561
75
2.2
73
84
5
205
32
18
18
30
1.95
1488547--1488575
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
1488564--1488709
78
1.8
78
91
2
238
29
20
17
32
1.95
1488386--1489226
166
5.1
165
78
12
819
35
19
16
28
1.94
1488712--1488742
16
1.9
16
93
0
53
64
6
12
16
1.47
1488389--1489226
335
2.5
330
80
10
904
35
19
16
28
1.94
1488730--1488879
75
2.0
76
94
1
266
31
23
16
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1488799--1489139
91
3.9
88
79
12
318
36
21
15
26
1.93
1488992--1489286
77
4.0
74
82
6
321
33
21
16
28
1.95
1489020--1489293
73
3.7
72
83
5
307
32
21
17
29
1.96
1490848--1490889
10
4.2
10
87
9
59
0
9
2
88
0.61
1490848--1490883
12
3.0
12
92
8
56
0
8
0
91
0.41
1491463--1491500
14
2.8
14
81
18
53
5
10
2
81
0.94
1491463--1491522
13
4.7
12
73
19
50
3
11
3
81
0.93
1491456--1491525
32
2.3
30
85
9
88
5
12
4
77
1.10
1495737--1495801
31
2.1
31
86
11
89
53
6
4
35
1.46
1495981--1496028
3
16.0
3
86
0
69
68
0
4
27
1.07
1496074--1496145
37
1.9
37
83
10
94
58
5
5
30
1.44
1500331--1500362
16
2.0
16
93
0
55
40
15
0
43
1.47
1502449--1502486
16
2.3
17
86
4
51
28
0
15
55
1.41
1502698--1502733
17
2.1
17
89
0
54
27
16
11
44
1.82
1502795--1502830
17
2.1
17
89
0
54
27
16
11
44
1.82
1502697--1502899
97
2.1
97
98
0
388
27
9
14
48
1.75
1507689--1507764
39
2.0
39
81
2
91
52
10
7
28
1.64
1507751--1507814
22
2.9
22
90
6
85
56
7
4
31
1.49
1507766--1507814
22
2.2
22
100
0
98
59
8
4
28
1.45
1510754--1510845
33
2.8
33
94
0
148
16
41
4
38
1.68
1510749--1510830
6
13.2
6
79
7
56
17
40
3
39
1.67
1510755--1510866
33
3.4
33
89
0
125
17
41
4
35
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1510751--1510869
12
9.9
12
77
3
69
18
41
4
36
1.70
1513479--1513510
15
2.1
15
100
0
64
6
18
6
68
1.32
1523768--1523832
17
3.9
16
79
15
53
66
0
1
32
1.01
1523768--1523820
9
5.9
9
78
13
56
64
0
0
35
0.94
1532824--1532940
54
2.2
53
92
1
198
41
7
10
41
1.68
1533126--1533215
47
1.9
47
86
0
126
36
21
10
32
1.86
1540392--1540457
31
2.1
31
85
0
87
39
16
10
33
1.83
1541597--1541707
31
3.5
31
75
15
95
52
4
3
39
1.39
1541648--1541745
37
3.0
31
74
18
90
52
2
2
43
1.24
1541644--1541745
35
3.1
32
73
21
93
51
1
1
44
1.23
1543704--1543756
25
2.1
25
100
0
106
43
11
7
37
1.69
1544464--1544496
5
6.6
5
86
13
50
81
0
0
18
0.68
1548924--1548954
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
0.71
1550304--1550717
204
2.0
206
98
0
805
55
14
8
21
1.66
1550601--1550816
106
2.0
106
95
4
389
52
19
13
14
1.75
1550907--1550949
16
2.8
16
82
3
52
79
4
2
13
1.00
1551211--1551246
10
3.7
10
85
7
56
19
0
0
80
0.71
1552438--1552536
42
2.4
42
94
1
173
35
11
15
38
1.83
1556943--1556997
28
2.0
27
82
3
65
61
16
1
20
1.43
1558952--1559026
37
2.0
37
100
0
150
60
2
13
24
1.46
1560767--1560839
29
2.4
31
77
13
87
58
5
0
35
1.21
1561114--1561161
23
2.0
23
88
11
71
39
4
0
56
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1563966--1564061
21
4.5
21
89
2
129
13
22
27
36
1.92
1563953--1564061
42
2.5
42
85
2
137
15
22
25
35
1.94
1567064--1567088
2
12.5
2
100
0
50
0
0
48
52
1.00
1569387--1569490
51
2.0
51
96
0
190
37
8
25
27
1.86
1572941--1572982
21
2.0
21
95
0
75
52
16
19
11
1.74
1573189--1573213
1
25.0
1
100
0
50
100
0
0
0
0.00
1582316--1582346
15
2.1
15
93
0
53
67
0
32
0
0.91
1585489--1585603
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
1585489--1585622
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
1591431--1591545
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
1591431--1591564
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
1599727--1600083
46
7.8
46
83
5
382
42
14
22
20
1.88
1599724--1600088
92
4.0
92
85
2
437
41
13
23
21
1.88
1599734--1600083
183
1.9
184
83
1
452
42
14
22
20
1.88
1599724--1600106
137
2.8
137
81
5
450
42
13
22
21
1.88
1601464--1601515
15
3.2
15
73
19
50
38
0
1
59
1.08
1601551--1601605
18
3.2
18
71
21
55
60
0
0
40
0.97
1601551--1601586
19
1.9
18
88
5
54
58
0
0
41
0.98
1601561--1601614
16
3.4
17
70
12
51
59
0
0
40
0.98
1601560--1601640
28
2.8
28
78
14
76
54
1
0
44
1.08
1601674--1601716
21
2.0
21
82
13
52
41
0
6
51
1.29
1628828--1628852
13
1.9
13
100
0
50
16
8
28
48
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1629551--1629619
3
23.0
3
100
0
138
33
0
0
66
0.92
1629793--1629821
4
7.2
4
100
0
58
48
0
0
51
1.00
1632935--1633008
29
2.5
29
86
4
94
51
14
13
20
1.76
1635951--1636042
45
2.1
43
86
6
123
53
4
3
39
1.37
1636890--1637010
59
2.1
59
79
6
138
42
4
11
40
1.63
1637201--1637338
71
1.9
71
91
0
222
40
5
10
43
1.62
1637513--1637616
31
3.5
28
75
10
82
42
15
2
39
1.62
1637513--1637616
29
3.4
31
76
7
97
42
15
2
39
1.62
1643201--1643243
22
2.0
22
81
9
52
34
0
4
60
1.17
1645257--1645292
18
1.9
18
88
5
54
30
0
0
69
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328