Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr07 97507971 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  317  of  328  ( 39316 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94036753--94036790
18
2.1
19
85
5
51
28
2
5
63
1.30
94038967--94038995
9
3.2
9
100
0
58
58
0
0
41
0.98
94039064--94039153
31
2.9
30
88
5
126
55
6
3
34
1.42
94040789--94040826
11
3.4
11
85
7
58
71
2
0
26
1.00
94044304--94044328
13
1.9
13
100
0
50
48
8
0
44
1.32
94048110--94048182
5
14.8
5
76
8
69
38
4
21
35
1.73
94048110--94048182
15
4.9
15
79
3
76
38
4
21
35
1.73
94048398--94048440
16
2.8
15
79
6
50
13
6
18
60
1.55
94051520--94051575
26
2.1
27
93
3
96
50
7
0
42
1.30
94054697--94054745
23
2.3
20
81
18
71
38
12
16
32
1.86
94054702--94054748
23
2.0
23
100
0
94
40
12
12
34
1.82
94059553--94059579
14
1.9
14
100
0
54
14
22
11
51
1.73
94066058--94066146
25
3.6
25
67
10
67
61
4
1
32
1.23
94066057--94066182
50
2.5
50
79
12
132
62
3
1
32
1.20
94066132--94066202
17
4.1
18
73
14
60
66
1
1
30
1.09
94066083--94066197
51
2.3
49
78
10
119
62
3
1
32
1.22
94066141--94066239
33
3.2
32
74
12
89
66
2
1
30
1.09
94066138--94066251
31
3.6
32
76
10
99
64
1
0
32
1.09
94068059--94068115
29
2.0
29
89
0
87
21
15
8
54
1.68
94078953--94078990
18
2.2
17
86
13
51
52
2
0
44
1.14
94079559--94079612
20
2.7
21
77
11
60
29
1
3
64
1.21
94094236--94094300
32
2.0
32
100
0
130
44
6
12
36
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94095847--94096124
46
6.0
46
87
0
351
41
13
23
21
1.88
94095847--94096109
92
2.9
92
88
0
391
42
12
23
21
1.87
94095861--94096124
138
1.9
138
88
0
402
41
14
23
20
1.89
94096405--94096437
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
94099852--94099893
19
2.2
20
91
4
68
57
0
2
40
1.12
94099877--94099913
14
2.7
14
91
4
58
43
2
0
54
1.14
94102652--94102696
21
2.2
20
84
4
54
6
17
11
64
1.46
94103278--94103306
4
7.2
4
100
0
58
75
0
24
0
0.80
94104070--94104180
47
2.4
47
83
6
145
27
16
21
35
1.94
94107669--94108239
202
2.8
202
84
2
727
34
14
21
29
1.93
94112074--94112135
20
3.1
19
73
19
54
56
3
1
38
1.25
94112016--94112108
48
1.9
47
81
16
111
51
3
4
40
1.38
94112383--94112424
19
2.2
19
83
8
50
30
0
0
69
0.89
94114533--94114672
69
2.0
69
97
0
262
27
6
27
37
1.81
94116625--94116651
14
1.9
14
100
0
54
0
14
0
85
0.61
94124517--94124547
13
2.3
14
94
5
55
32
0
0
67
0.91
94136418--94136451
11
3.3
11
92
8
54
0
11
0
88
0.52
94136414--94136450
15
2.5
15
87
12
51
0
13
0
86
0.57
94136414--94136449
20
1.9
20
88
11
58
0
13
0
86
0.58
94140928--94141092
85
1.9
85
97
0
312
45
18
12
23
1.83
94157226--94157266
21
1.9
22
85
5
57
14
4
12
68
1.36
94162174--94162212
21
1.9
20
89
5
60
58
7
0
33
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94172415--94172458
19
2.2
20
92
4
72
68
2
0
29
1.02
94177682--94177721
15
2.9
14
85
10
55
30
5
0
65
1.14
94177684--94177748
26
2.5
25
80
9
69
29
3
1
66
1.16
94177885--94177947
24
2.7
24
87
7
85
33
3
4
58
1.35
94177999--94178064
25
2.7
24
88
9
98
34
4
1
59
1.27
94178131--94178211
24
3.3
24
71
20
69
28
7
2
61
1.36
94178201--94178315
3
38.0
3
79
10
92
33
3
3
59
1.31
94190363--94190774
90
4.6
90
82
5
408
30
17
16
35
1.92
94194417--94194522
44
2.4
44
96
0
194
23
21
28
26
1.99
94196115--94196154
15
2.9
14
85
10
55
30
5
0
65
1.14
94196213--94196282
3
23.7
3
88
8
108
34
0
0
65
0.93
94196380--94196427
12
4.1
12
78
13
55
37
0
6
56
1.25
94196361--94196422
24
2.7
24
87
9
85
33
3
4
58
1.36
94196666--94196717
3
17.3
3
100
0
104
32
0
0
67
0.91
94200265--94200453
43
4.4
43
92
1
301
12
23
34
29
1.92
94207176--94207209
4
8.8
4
87
6
52
76
0
20
2
0.92
94207180--94207209
15
2.0
15
93
0
51
76
0
20
3
0.92
94209176--94209312
40
3.5
40
70
9
104
29
15
21
33
1.94
94211537--94211578
18
2.3
19
84
12
52
59
0
0
40
0.97
94212493--94212544
24
2.2
24
87
12
74
63
0
1
34
1.06
94215887--94215911
7
3.6
7
100
0
50
0
12
0
88
0.53
94218710--94218759
26
2.0
24
85
14
66
52
2
0
46
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94218727--94218767
20
2.1
20
86
4
57
56
0
0
43
0.99
94220916--94220969
22
2.5
21
79
5
63
74
3
1
20
1.07
94220879--94220972
22
4.1
22
74
12
59
71
4
3
21
1.18
94222924--94222962
16
2.4
16
82
0
51
25
33
17
23
1.96
94224432--94224551
59
2.0
59
100
0
240
29
17
6
46
1.73
94227108--94227155
21
2.4
20
86
6
62
41
6
2
50
1.39
94229988--94230084
50
1.9
50
100
0
194
41
8
15
35
1.77
94243804--94243875
20
3.8
19
80
15
87
40
1
0
58
1.07
94244820--94245100
92
3.0
94
83
7
363
43
6
20
29
1.76
94251521--94251572
20
2.6
20
79
11
61
71
3
0
25
1.03
94251522--94251570
10
4.9
10
80
5
55
73
4
0
22
1.00
94251782--94251820
21
1.9
20
84
5
51
28
20
7
43
1.79
94257522--94257552
16
1.9
16
93
0
53
35
9
0
54
1.33
94258764--94258788
12
2.1
12
100
0
50
44
24
0
32
1.54
94269049--94269090
21
1.9
21
90
9
66
64
14
4
16
1.45
94271242--94271287
22
2.0
23
87
4
67
30
4
32
32
1.77
94271886--94272039
79
2.0
78
90
3
247
47
3
19
29
1.65
94271886--94272039
39
3.9
40
94
1
251
47
3
19
29
1.65
94284468--94285250
204
3.8
203
93
3
1272
29
18
22
29
1.97
94285285--94285741
88
5.2
88
75
10
375
31
18
24
25
1.97
94285435--94285821
44
8.8
45
76
7
296
31
17
23
27
1.97
94285348--94285768
133
3.2
132
91
1
684
30
18
23
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94286274--94286319
22
2.0
23
87
4
67
30
4
32
32
1.77
94286281--94286330
23
2.2
22
85
3
64
30
2
32
36
1.69
94286877--94286919
22
2.0
22
86
4
61
41
2
11
44
1.53
94286935--94287085
39
3.9
39
94
2
252
48
3
17
30
1.64
94289535--94289567
13
2.4
14
85
5
50
57
3
0
39
1.14
94294988--94295012
7
3.6
7
100
0
50
16
28
0
56
1.41
94298295--94298350
26
2.2
26
90
6
87
28
25
17
28
1.98
94301002--94301063
29
2.1
29
93
0
106
38
14
14
32
1.86
94301002--94301071
29
2.4
29
88
4
88
41
12
17
28
1.86
94309625--94309673
26
1.9
26
91
4
82
24
26
18
30
1.98
94312146--94312204
21
2.8
22
82
7
61
67
6
1
23
1.24
94316901--94316948
17
2.8
17
81
9
53
64
2
2
31
1.16
94317827--94317880
28
1.9
28
92
0
90
16
9
16
57
1.64
94318241--94318291
17
2.9
16
83
16
50
56
3
1
37
1.29
94318264--94318303
17
2.3
18
82
8
55
67
0
0
32
0.91
94318246--94318326
41
1.9
42
85
9
112
62
1
1
34
1.11
94320824--94320869
20
2.3
20
88
0
65
67
0
30
2
1.03
94324724--94324802
39
2.0
39
100
0
158
37
13
25
22
1.91
94325212--94325259
25
1.9
25
83
8
62
31
8
12
47
1.71
94327766--94327804
16
2.5
16
87
4
53
69
0
0
30
0.89
94327769--94327818
9
5.8
9
77
15
52
68
0
2
30
1.01
94327769--94327816
24
2.0
24
87
4
69
70
0
2
27
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94328459--94328571
54
2.1
54
98
0
217
38
8
15
38
1.78
94329011--94329036
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
94329754--94329849
9
10.4
9
69
16
63
67
0
4
28
1.09
94329729--94329881
35
4.2
36
73
12
98
62
1
5
30
1.27
94329760--94329858
19
5.3
19
76
11
89
63
0
4
32
1.13
94329779--94329875
29
3.4
27
72
11
77
59
1
7
31
1.31
94329779--94329896
58
2.0
59
83
9
152
61
1
7
29
1.34
94330052--94330136
37
2.3
37
83
4
100
32
3
3
60
1.31
94330121--94330169
19
2.5
20
83
12
66
38
0
2
59
1.09
94330125--94330176
19
2.8
18
80
13
61
36
0
1
61
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328