Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  256  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76201994--76202187
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1.99
76218236--76218456
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27
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186
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24
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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54
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27
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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1.99
76401433--76401596
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27
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20
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22
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17
27
31
1.97
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2.1
43
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142
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13
21
27
1.91
76443089--76443121
2
17.0
2
93
6
59
51
0
0
48
1.00
76446721--76446838
43
2.8
42
82
6
141
23
16
26
33
1.96
76449172--76449294
48
2.6
47
81
8
124
35
27
16
20
1.94
76452854--76452960
53
2.0
53
94
0
187
31
13
18
36
1.89
76455760--76455787
5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68
76460893--76460974
23
3.7
22
72
25
75
30
3
1
64
1.18
76460951--76461019
32
2.2
31
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5
95
31
5
0
62
1.19
76461133--76461163
16
1.9
16
100
0
62
12
0
0
87
0.55
76461278--76461336
30
2.0
30
89
0
91
40
5
15
38
1.69
76461922--76461971
15
2.9
17
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17
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48
6
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38
1.57
76461975--76462091
56
2.1
56
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0
207
26
7
11
53
1.64
76462097--76462140
22
2.0
23
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4
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45
2
9
43
1.48
76462574--76462608
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
76465040--76465087
20
2.5
20
86
6
64
43
4
0
52
1.20
76469571--76469695
51
2.5
48
77
12
135
54
9
4
32
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76472669--76472842
43
4.1
43
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2
226
25
31
18
24
1.98
76474708--76474737
15
2.1
15
93
6
53
36
26
6
30
1.82
76484762--76484789
12
2.3
12
100
0
56
25
42
25
7
1.80
76485808--76485841
15
2.4
14
90
9
52
29
0
5
64
1.17
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42
2.3
42
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3
160
19
27
30
22
1.98
76492428--76492649
40
5.6
40
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283
26
25
23
24
2.00
76492428--76492645
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2.7
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273
25
26
23
24
2.00
76492428--76492649
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118
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26
25
23
24
2.00
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24
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22
26
2.00
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147
22
24
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23
1.99
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40
4.2
40
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2
223
23
21
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26
1.99
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2.6
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11
101
30
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20
23
1.98
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100
0
50
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0
0
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2
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2
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50
7
0
41
1.30
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16
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44
1.42
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21
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22
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3
100
0
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0
0
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2.0
39
90
0
122
35
13
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26
1.93
76549257--76549290
18
1.9
18
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32
17
11
38
1.86
76550542--76550612
28
2.5
28
90
0
115
25
35
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22
1.95
76553791--76553827
19
1.9
19
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0
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1.92
76557061--76557135
39
1.9
39
88
0
114
37
16
5
41
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76557443--76557480
18
2.1
18
85
9
51
57
7
0
34
1.28
76557454--76557480
9
3.0
9
100
0
54
55
11
0
33
1.35
76565361--76565434
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2.3
32
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0
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10
10
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1.9
81
81
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189
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41
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13
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2.0
23
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0
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21
2.0
21
90
0
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23
0
2
73
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328