Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  274  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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Period
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1.98
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Period
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Copy
Number
Consensus
Size
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Score
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1.11
Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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64
1.28
82195780--82195843
23
2.8
22
71
4
56
53
1
3
42
1.26
82199321--82199369
20
2.3
22
82
10
66
51
2
2
44
1.24
82199894--82199932
2
19.5
2
83
0
51
43
7
0
48
1.31
82199895--82199932
10
3.8
10
89
0
58
42
7
0
50
1.31
82200837--82200861
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
82203133--82203171
15
2.6
15
95
0
69
46
20
12
20
1.83
82204246--82204297
26
2.0
27
88
3
79
28
11
3
55
1.53
82208248--82208294
19
2.5
19
86
6
60
27
19
8
44
1.79
82214395--82214589
49
4.0
49
85
1
264
25
16
28
29
1.97
82214394--82214575
99
1.8
99
91
0
301
25
16
28
29
1.97
82217277--82217326
15
3.3
15
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8
66
14
10
18
58
1.63
82219367--82219426
30
2.0
30
87
6
86
36
8
26
28
1.85
82220075--82220269
49
4.0
49
86
1
255
24
16
29
29
1.97
82220074--82220255
99
1.8
99
91
0
301
24
17
29
29
1.97
82238760--82238797
19
2.0
19
100
0
76
36
10
10
42
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82238779--82239704
177
5.2
177
88
0
1294
31
17
24
26
1.97
82239233--82240002
44
17.2
46
65
17
178
30
16
25
27
1.97
82239412--82240002
319
1.9
319
87
0
869
30
16
25
27
1.97
82239562--82239844
142
2.0
142
88
1
424
29
17
27
25
1.97
82243665--82243733
32
2.1
34
81
10
81
33
8
4
53
1.51
82248187--82248249
27
2.3
27
78
13
65
57
7
7
26
1.55
82248742--82248786
21
2.1
21
84
8
56
64
2
6
26
1.30
82248734--82248883
20
7.6
19
67
28
57
60
1
7
30
1.32
82250116--82250148
17
2.0
17
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5
50
24
6
42
27
1.78
82250508--82250748
81
2.9
82
93
1
385
29
19
19
32
1.96
82250498--82250756
83
3.1
83
91
2
405
28
19
18
32
1.96
82250678--82250994
119
2.7
119
91
1
501
28
19
18
33
1.95
82250517--82251483
405
2.4
404
94
0
1677
28
19
18
32
1.96
82250913--82251161
84
3.0
84
89
1
374
28
20
17
33
1.95
82251083--82251399
119
2.7
119
91
1
501
28
20
18
32
1.96
82251318--82251483
84
2.0
85
85
3
228
28
19
18
33
1.95
82263562--82263657
42
2.3
40
77
8
104
62
4
1
32
1.21
82263544--82263671
11
11.2
11
67
17
57
61
3
1
33
1.21
82266134--82266203
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
82273534--82273603
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
82277165--82277211
21
2.1
22
84
7
60
48
0
4
46
1.21
82277375--82277467
9
10.1
9
70
13
55
70
3
23
2
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82279267--82279541
46
6.0
46
90
1
347
40
14
24
20
1.90
82279277--82279536
139
1.9
139
87
4
391
41
15
24
19
1.89
82290415--82290449
18
1.9
19
88
11
56
57
25
8
8
1.57
82298618--82298718
28
3.5
30
81
6
118
29
15
26
27
1.96
82306041--82306177
60
2.3
59
80
11
145
26
24
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1.98
82306838--82306868
16
2.0
15
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9
19
19
51
1.74
82310430--82310516
33
2.6
34
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28
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2.5
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25
19
27
1.99
82310456--82310634
60
3.0
60
75
14
172
27
24
19
28
1.99
82314045--82314147
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328