Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  103  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28696057--28696152
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3.8
26
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2
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28702173--28702220
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13
27
1.53
28710506--28710537
16
1.9
17
93
6
57
81
0
3
15
0.82
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100
0
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0
0
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137
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0
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0
0
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2.1
25
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0
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1.64
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2.1
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2
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103
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5
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1.64
28742322--28742361
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2.2
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42
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2.1
42
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28
1.65
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2.6
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107
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2.2
19
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12
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2.1
36
100
0
150
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21
17
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
15
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0
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34
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17
1.89
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2.9
43
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15
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1.94
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2.2
18
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58
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1.34
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2.4
19
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13
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0
0
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3.9
39
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32
19
24
1.98
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1.9
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14
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1.8
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0
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2.0
27
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65
0
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55
3
31
0
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3
3
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0
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40
10
7
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3.1
13
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9
46
1.70
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2.0
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0
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110
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5
2
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11.7
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91
7
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0
0
70
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28837295--28837421
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2.7
47
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3
143
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13
26
34
1.94
28845930--28845991
27
2.3
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1
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1
84
0
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0
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13
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0
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0
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0
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0.37
28846561--28846624
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2.5
26
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0
101
0
7
0
92
0.40
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2.5
116
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513
31
31
14
22
1.94
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21
2.0
21
100
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0
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0
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2
0
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0.98
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1
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2.0
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1.97
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214
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27
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1.97
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18
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11
0
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1.14
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17
2.7
18
86
6
69
17
10
0
72
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28871727--28871769
13
3.3
13
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16
11
0
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1.13
28872872--28872920
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2.0
25
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0
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2
0
46
1.12
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2.0
34
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2
1
44
1.26
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13
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12
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20
61
50
0
2
48
1.12
28879469--28879501
15
2.2
15
94
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2.1
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93
0
51
46
36
0
16
1.47
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29
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82
13
37
20
27
1.91
28903570--28903634
22
3.1
21
85
10
80
47
10
0
41
1.38
28903599--28903638
19
2.1
19
90
0
62
50
10
0
40
1.36
28903605--28903642
19
2.0
19
94
0
67
50
10
0
39
1.37
28903654--28903701
22
2.2
22
84
0
60
47
12
2
37
1.53
28903672--28903902
52
4.6
50
69
18
140
45
10
3
40
1.57
28903603--28903863
52
5.1
50
70
16
162
47
10
4
36
1.60
28903617--28903906
150
1.9
150
88
4
433
45
10
4
39
1.58
28903570--28903922
150
2.4
151
81
8
417
45
11
3
39
1.58
28904065--28904120
8
6.1
9
78
13
53
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0
14
0
0.59
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12
2.8
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0
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0
11
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1.38
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10
3.5
10
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0
52
20
11
2
65
1.37
28905973--28906050
40
2.0
38
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5
129
24
12
5
57
1.55
28907376--28907412
3
12.3
3
100
0
74
32
0
0
67
0.91
28912392--28912431
19
2.1
19
85
4
53
35
12
0
52
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28913606--28913654
24
2.0
24
100
0
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12
28
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33
2.2
33
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2
119
33
16
0
50
1.46
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29
2.6
29
93
0
123
37
26
18
17
1.93
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19
2.0
20
85
14
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2
30
0
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1.05
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15
2
0
81
0.80
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4
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4
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0
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23
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7
0
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1.24
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15
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0
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0
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26
1.21
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13
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0
9
26
1.24
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2.0
18
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0
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2.1
17
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14
5
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1.49
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3
100
0
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0
0
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27
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3
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39
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280
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18
1.97
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28
2.3
28
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0
94
29
20
9
41
1.83
28950718--28950799
28
2.9
28
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3
76
29
21
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1.88
28952651--28952690
18
2.1
20
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9
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20
17
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1.33
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32
2.0
32
93
0
108
47
9
20
22
1.78
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5
5.6
5
100
0
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0
0
17
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14
3.9
15
73
16
50
69
0
5
25
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28963866--28963896
14
2.2
14
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0
53
77
0
9
12
0.99
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2.7
88
85
2
301
23
22
19
34
1.96
28965243--28965525
88
3.2
87
85
1
341
23
22
19
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1.96
28965560--28965878
44
7.3
43
63
20
133
19
25
23
32
1.97
28965525--28966271
88
8.7
88
88
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992
20
23
21
34
1.97
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44
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20
140
18
22
23
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128
2.0
127
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0
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177
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0
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2.1
21
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9
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22
1.67
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20
2.5
20
85
11
63
1
9
5
83
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328