Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr07 97507971 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  54  of  328  ( 39316 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15291543--15291766
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1.93
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1.91
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144
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1.96
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23
11
11
52
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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29
19
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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(0-2)
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0
58
1.26
15406163--15406262
41
2.6
37
87
9
146
59
0
1
40
1.04
15410323--15410372
25
2.0
25
88
0
73
48
10
0
42
1.37
15411227--15411275
5
10.0
5
80
12
57
34
0
4
61
1.15
15411226--15411271
24
1.9
24
90
0
74
34
0
4
60
1.16
15422040--15422130
44
2.1
44
87
0
128
47
3
7
41
1.48
15422053--15422087
18
2.0
18
88
5
54
51
2
2
42
1.31
15426545--15426606
27
2.3
27
83
5
81
19
20
30
29
1.97
15426558--15426604
14
3.5
13
85
2
58
14
21
34
29
1.93
15426864--15426921
18
3.3
18
78
2
64
34
15
17
32
1.91
15428554--15428592
11
3.5
11
78
0
51
20
15
7
56
1.63
15428609--15428655
18
2.5
19
83
10
62
31
0
4
63
1.13
15428817--15428850
12
2.8
12
90
0
50
67
0
0
32
0.91
15429571--15429732
26
6.2
26
95
0
252
33
5
24
36
1.79
15431174--15431248
26
2.8
26
87
4
78
34
21
10
33
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15431185--15431248
26
2.4
27
89
5
94
31
23
12
32
1.92
15431352--15431464
27
4.2
27
86
3
138
17
23
22
36
1.95
15431350--15431464
54
2.1
54
90
3
178
17
23
22
36
1.95
15435181--15435231
20
2.5
20
75
9
59
49
9
0
41
1.36
15439016--15439044
14
2.0
15
93
6
51
51
20
0
27
1.47
15440294--15440359
28
2.4
28
89
5
98
50
15
10
24
1.75
15443148--15443186
18
2.2
18
86
9
53
64
0
7
28
1.21
15457736--15457766
1
31.0
1
100
0
62
0
0
0
100
0.00
15465938--15465964
2
13.5
2
100
0
54
0
51
0
48
1.00
15467238--15467297
31
2.0
30
87
6
86
55
5
5
35
1.44
15468319--15468343
12
2.1
12
100
0
50
32
0
24
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1.54
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13
2.4
14
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15
50
0
12
15
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1.12
15471015--15471045
15
2.1
14
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5
53
54
6
3
35
1.42
15471032--15471100
21
3.4
20
71
16
70
55
7
1
36
1.37
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21
2.7
19
80
11
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54
3
3
37
1.36
15478579--15478639
19
2.9
21
73
14
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49
0
3
47
1.18
15491204--15491246
16
2.7
16
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20
54
44
0
34
20
1.52
15491321--15491382
19
3.1
21
77
13
69
51
1
0
46
1.10
15491335--15491382
21
2.5
18
87
12
69
50
0
0
50
1.00
15491473--15491512
21
1.9
21
85
10
55
47
5
0
47
1.24
15492731--15492789
31
1.9
31
86
6
84
44
11
11
32
1.78
15493410--15493448
14
2.8
14
80
0
51
25
7
2
64
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15493811--15493843
2
17.0
2
87
6
50
45
0
0
54
0.99
15498686--15498742
19
3.0
19
94
0
96
33
8
24
33
1.86
15502182--15502218
19
1.9
19
88
0
56
48
0
13
37
1.43
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7
4.3
7
91
8
51
72
0
27
0
0.85
15505883--15505911
13
2.1
14
93
6
51
72
0
27
0
0.85
15506751--15506813
20
3.2
19
78
17
67
58
6
0
34
1.23
15506784--15506821
18
2.0
20
90
10
62
57
5
0
36
1.21
15506782--15506827
20
2.3
22
78
21
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4
0
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1.19
15506832--15506881
10
5.6
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73
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50
60
0
2
38
1.09
15510717--15510759
5
8.8
5
82
12
54
0
18
0
81
0.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328