Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr07 97507971 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  4  of  328  ( 39316 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1037236--1037381
53
2.7
53
89
4
204
29
27
15
27
1.96
1044070--1044100
3
10.3
3
100
0
62
67
0
0
32
0.91
1044328--1044398
3
24.0
3
77
8
56
57
2
8
30
1.43
1044559--1044638
3
26.7
3
100
0
160
66
0
0
33
0.92
1045577--1045620
23
1.9
23
90
0
70
25
11
47
15
1.79
1046846--1046890
14
3.0
15
87
6
65
62
0
4
33
1.15
1046846--1046888
15
2.9
15
89
6
61
65
0
4
30
1.13
1063035--1063086
22
2.4
22
75
12
52
19
15
7
57
1.62
1063668--1063720
21
2.5
21
82
14
65
47
1
1
49
1.23
1063735--1063791
30
1.9
30
82
13
73
45
1
0
52
1.11
1067440--1067468
12
2.5
12
94
5
51
0
0
13
86
0.58
1073691--1073824
63
2.1
63
97
1
252
29
14
19
37
1.91
1077207--1077270
25
2.5
25
84
2
74
29
9
3
57
1.45
1082687--1082737
19
2.7
20
81
9
61
49
0
1
49
1.12
1088602--1088654
21
2.5
23
73
14
60
37
3
13
45
1.61
1090342--1090455
51
2.2
51
95
0
201
33
14
23
28
1.94
1093913--1094009
48
2.0
48
100
0
194
24
14
12
48
1.78
1096486--1096515
14
2.1
14
100
0
60
36
20
30
13
1.90
1099193--1099243
23
2.2
24
82
10
61
39
0
1
58
1.09
1100668--1100725
20
2.8
20
79
7
64
50
0
3
46
1.18
1100860--1100891
16
2.0
16
100
0
64
50
12
12
25
1.75
1104522--1104562
21
2.0
21
100
0
82
43
4
9
41
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1104768--1104898
69
1.9
69
100
0
262
29
7
12
50
1.67
1105499--1105527
2
15.0
2
92
7
51
48
0
0
51
1.00
1109078--1109117
20
2.0
20
85
0
53
32
5
0
62
1.17
1109293--1109324
15
2.0
17
88
11
50
59
0
0
40
0.97
1111523--1111554
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
1111583--1111620
19
1.9
19
89
5
58
39
0
15
44
1.47
1111855--1111893
19
2.1
19
95
0
69
51
10
5
33
1.58
1112743--1112791
15
3.3
15
85
0
62
36
2
12
48
1.52
1125284--1125326
14
3.1
14
80
6
52
9
4
4
81
0.97
1126998--1127026
14
2.1
14
100
0
58
41
13
17
27
1.87
1130677--1130710
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
1130869--1130903
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
1137289--1137344
21
2.7
21
85
0
76
32
12
17
37
1.88
1137393--1137458
33
2.0
33
100
0
132
24
12
15
48
1.78
1138634--1138680
21
2.3
20
85
10
60
55
4
6
34
1.45
1138841--1138867
14
1.9
14
100
0
54
88
0
11
0
0.50
1139026--1139079
3
18.0
3
84
0
72
62
1
5
29
1.28
1139122--1139194
36
2.0
36
87
10
105
64
0
5
30
1.16
1139134--1139180
21
2.5
18
86
13
60
68
0
2
29
1.02
1139820--1139862
16
2.7
16
100
0
86
53
0
46
0
1.00
1141384--1141418
17
2.2
17
90
10
56
57
5
0
37
1.23
1141372--1141412
21
1.9
22
85
5
57
56
4
0
39
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1149576--1149708
65
2.0
65
97
0
248
31
19
9
39
1.84
1151176--1151224
25
2.0
25
100
0
98
28
30
0
40
1.57
1152993--1153076
42
2.0
42
100
0
168
38
14
11
35
1.83
1157077--1157104
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
1158388--1158428
19
2.1
20
90
4
66
58
2
0
39
1.11
1162034--1162067
17
2.0
17
100
0
68
17
23
17
41
1.90
1164707--1164746
20
2.0
20
85
9
55
55
0
12
32
1.38
1181158--1181254
49
2.0
49
83
0
122
19
15
21
43
1.88
1181263--1181519
51
5.0
51
83
0
325
24
15
16
44
1.85
1181559--1181882
40
8.2
40
70
8
189
32
22
20
25
1.98
1181734--1181882
40
3.7
40
85
1
190
29
24
22
23
1.99
1181734--1181882
81
1.9
80
84
1
199
29
24
22
23
1.99
1181578--1181978
196
2.1
194
87
2
563
31
22
20
25
1.98
1181599--1182038
196
2.3
195
83
2
506
32
22
18
25
1.97
1181774--1182117
156
2.2
154
87
3
485
33
22
18
25
1.97
1186673--1186751
5
14.8
5
81
13
61
18
3
0
77
0.92
1186858--1186962
42
2.5
42
87
3
140
29
33
11
25
1.91
1188491--1188538
20
2.4
20
96
0
87
22
20
20
35
1.96
1193001--1193035
14
2.6
14
90
4
54
37
2
14
45
1.59
1193756--1193994
43
5.6
43
78
4
239
25
19
23
31
1.98
1193732--1193994
86
3.1
86
82
2
321
25
17
24
32
1.97
1193760--1193994
129
1.8
129
83
3
312
25
18
23
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1194697--1194837
67
2.1
68
84
4
178
21
12
17
48
1.79
1194697--1194869
67
2.6
67
80
4
152
21
14
17
46
1.84
1200581--1200619
6
6.3
6
82
5
51
79
2
0
17
0.84
1203032--1203074
20
2.2
20
95
0
77
23
20
16
39
1.92
1207386--1207517
65
2.0
64
91
1
210
50
9
12
28
1.71
1208083--1208305
115
1.9
115
83
7
283
33
16
14
36
1.89
1209672--1209710
20
2.0
20
90
10
62
35
2
0
61
1.10
1214406--1214446
21
1.9
22
90
5
66
70
2
7
19
1.22
1220543--1220584
21
2.0
22
86
9
61
59
0
0
40
0.97
1220551--1220584
3
11.0
3
87
6
50
64
0
0
35
0.94
1220544--1220584
15
2.7
15
88
7
57
60
0
0
39
0.96
1232698--1232750
21
2.5
21
81
9
63
32
0
1
66
1.03
1244360--1244393
7
5.1
7
89
10
54
0
0
11
88
0.52
1244360--1244393
13
2.6
14
90
9
54
0
0
11
88
0.52
1245664--1245692
12
2.5
12
94
5
51
34
0
6
58
1.25
1246993--1247019
3
9.0
3
100
0
54
33
0
0
66
0.92
1247019--1247078
28
2.1
30
81
12
72
31
13
6
48
1.68
1247102--1247128
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
1252992--1253028
20
1.9
20
88
5
58
5
10
13
70
1.32
1254363--1254419
23
2.5
23
91
0
87
45
8
1
43
1.45
1267634--1267666
16
2.1
16
88
5
50
63
3
0
33
1.10
1267655--1267692
20
1.9
19
89
5
58
60
2
0
36
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1268442--1268468
7
3.9
7
100
0
54
88
0
0
11
0.50
1286539--1286595
26
2.3
26
84
6
73
22
3
8
64
1.37
1287900--1287955
2
28.5
2
92
3
96
50
0
0
50
1.00
1288369--1288412
20
2.0
22
83
12
56
43
2
4
50
1.35
1292591--1292626
17
2.1
17
100
0
72
25
0
16
58
1.38
1294087--1294157
35
2.0
35
94
0
124
18
46
9
25
1.79
1294545--1294579
12
2.9
12
91
0
61
74
5
2
17
1.14
1294665--1294698
11
3.1
11
91
8
52
0
52
0
47
1.00
1295176--1295206
3
10.3
3
100
0
62
32
0
0
67
0.91
1295309--1295352
3
14.7
3
100
0
88
34
0
0
65
0.93
1295567--1295639
33
2.3
30
82
11
92
36
5
2
54
1.38
1310835--1310877
20
2.2
20
84
16
54
25
0
18
55
1.42
1310855--1310940
39
2.2
40
83
8
104
26
2
9
61
1.38
1317198--1317224
5
5.4
5
100
0
54
40
0
0
59
0.98
1318496--1318552
15
3.9
14
86
6
78
35
1
12
50
1.50
1318925--1319031
21
5.0
22
85
6
114
15
23
25
35
1.94
1318937--1319018
21
3.8
21
91
3
119
14
25
26
32
1.95
1320150--1320188
21
2.0
21
85
10
55
69
0
7
23
1.14
1320369--1320393
13
1.9
13
100
0
50
24
0
12
64
1.27
1323541--1323602
28
2.2
28
88
0
88
45
9
12
32
1.75
1328034--1328059
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
1328499--1328540
17
2.5
17
80
7
50
21
2
2
73
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1329576--1329617
14
2.8
15
85
10
59
80
0
19
0
0.70
1329576--1329617
15
2.9
14
89
7
57
80
0
19
0
0.70
1342142--1342186
23
1.9
24
86
4
65
60
0
6
33
1.23
1347828--1348521
180
4.0
178
81
6
773
40
20
8
29
1.83
1351894--1352013
59
2.0
60
88
1
179
35
16
17
30
1.92
1359569--1359650
3
27.3
3
100
0
164
32
0
0
67
0.91
1361569--1361606
10
3.7
10
96
3
67
31
0
0
68
0.90
1374628--1374660
16
2.0
17
94
5
59
30
3
0
66
1.06
1386503--1386541
19
2.1
19
100
0
78
38
0
20
41
1.53
1394235--1394351
38
3.1
39
81
3
112
53
11
7
26
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328