Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  289  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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0
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3.8
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15
19
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38
1.91
86491581--86491655
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3.5
21
83
3
87
12
20
26
41
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
19
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1.94
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19
33
1.94
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1.9
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1.9
108
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19
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1.95
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19
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1.97
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2.0
182
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17
19
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1.95
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56
1.39
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2
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1.30
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1.24
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0
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28
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1.98
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19
2.2
20
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4
54
34
25
18
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86519106--86519177
34
2.1
35
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20
26
11
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1.86
86520245--86520370
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2.1
60
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25
17
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35
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0
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26
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1.77
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17
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1.98
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0
222
29
29
21
19
1.98
86545898--86546037
46
3.0
45
88
4
140
28
29
21
20
1.98
86549950--86550268
49
6.5
49
97
0
575
31
8
29
30
1.86
86550249--86550373
48
2.6
48
92
0
196
36
7
26
29
1.83
86549950--86550364
147
2.8
146
85
6
405
33
7
28
30
1.85
86555854--86555913
30
2.0
30
83
6
77
36
8
25
30
1.85
86556335--86556511
47
3.8
46
80
13
218
20
20
29
29
1.98
86557943--86558269
23
14.2
23
87
3
453
24
20
25
29
1.99
86561530--86561562
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
86564465--86564542
6
12.5
6
80
8
68
76
1
3
17
1.00
86564455--86564511
17
3.3
17
79
13
62
75
1
5
17
1.07
86564445--86564536
11
8.2
11
74
19
59
75
1
4
19
1.04
86564472--86564540
19
3.6
20
79
12
65
76
1
2
18
0.98
86573623--86573678
26
2.2
26
96
0
103
30
7
25
37
1.82
86579740--86579820
28
2.8
27
78
10
81
30
1
3
64
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86579751--86579814
28
2.3
29
83
8
87
31
1
3
64
1.19
86580299--86580357
26
2.4
24
77
5
64
49
11
13
25
1.76
86594396--86594680
143
2.0
143
86
1
392
24
21
21
32
1.98
86603604--86603673
31
2.3
30
80
7
79
55
4
4
35
1.39
86603838--86603936
33
3.1
31
76
18
96
55
1
7
36
1.34
86604041--86604083
22
2.0
21
86
4
59
69
4
2
23
1.18
86605102--86605152
18
2.8
18
78
21
54
21
0
1
76
0.88
86605106--86605150
18
2.4
18
85
10
56
20
0
2
77
0.87
86610024--86610050
13
2.1
13
100
0
54
70
0
7
22
1.12
86610027--86610067
21
2.0
21
85
9
57
73
0
4
21
1.02
86612726--86612756
5
6.2
5
96
0
53
16
38
22
22
1.92
86612428--86612972
187
3.0
183
88
5
777
20
25
26
27
1.99
86613330--86613383
24
2.2
24
86
0
72
12
40
31
14
1.84
86613422--86613537
58
2.0
58
91
0
187
31
22
21
24
1.98
86619184--86620389
43
28.3
43
83
3
1354
15
31
32
19
1.93
86619184--86620389
85
14.2
86
83
3
1354
15
31
32
19
1.93
86620129--86620425
43
7.0
43
74
8
169
16
30
34
19
1.94
86628818--86628983
46
3.6
46
79
6
201
30
29
18
21
1.97
86628826--86628997
93
1.8
93
90
2
274
29
28
19
22
1.98
86632614--86632649
5
7.2
5
93
0
63
16
38
19
25
1.92
86632427--86632799
197
1.9
197
92
0
620
19
26
26
26
1.99
86634176--86634297
58
2.1
59
84
4
158
33
22
19
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86638227--86638578
177
2.0
176
83
6
451
20
25
26
27
1.99
86639155--86639228
24
3.1
24
88
0
103
10
39
32
17
1.84
86639419--86640371
42
22.5
43
83
4
980
15
31
33
18
1.93
86639419--86640371
85
11.2
86
82
5
937
15
31
33
18
1.93
86639419--86640371
127
7.5
128
83
4
970
15
31
33
18
1.93
86640767--86640799
16
2.1
16
88
5
50
12
6
15
66
1.42
86650142--86650262
58
2.1
59
85
1
163
29
23
20
26
1.99
86650899--86651252
42
8.3
43
76
7
312
17
34
31
16
1.93
86650872--86651252
127
3.0
127
78
3
372
17
33
32
17
1.93
86650886--86651252
85
4.3
85
78
6
289
17
33
32
16
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328