Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  94  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Indels
Score
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1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Number
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Score
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(0-2)
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38
1.07
26414194--26414226
4
8.2
4
100
0
66
24
0
27
48
1.51
26418885--26418910
2
13.0
2
100
0
52
50
0
50
0
1.00
26422533--26422565
15
2.2
15
94
0
57
27
15
15
42
1.86
26422667--26422710
15
2.8
16
79
6
54
34
15
13
36
1.87
26425725--26425778
29
1.9
27
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7
72
46
3
20
29
1.68
26429541--26429775
39
6.0
40
80
6
196
24
26
22
25
2.00
26434607--26434645
17
2.1
20
86
13
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25
5
5
64
1.35
26439150--26439522
39
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39
92
1
570
29
29
22
18
1.98
26443044--26443090
22
2.1
22
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0
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1.49
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0
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0
0
68
0.90
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25
2.5
25
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3
0
53
1.16
26451556--26451645
26
3.6
25
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14
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45
4
0
50
1.22
26451657--26451719
10
5.8
10
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56
33
3
0
63
1.10
26451631--26451714
17
5.2
16
67
21
50
32
5
0
61
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26451625--26451726
19
5.0
19
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20
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32
4
0
61
1.23
26451657--26451721
24
2.8
24
88
2
87
33
3
0
63
1.10
26451625--26451702
41
2.0
38
80
16
88
34
5
0
60
1.19
26451974--26452034
24
2.6
25
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15
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39
0
0
60
0.97
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7
7.4
7
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41
0
0
58
0.98
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1.9
28
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11
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43
3
0
52
1.19
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204
3.8
205
92
1
1285
31
17
20
30
1.95
26466293--26466353
23
2.5
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3
0
54
1.17
26466364--26466426
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3
0
63
1.10
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16
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21
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32
5
0
61
1.20
26466332--26466433
19
5.0
19
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20
66
32
4
0
61
1.23
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24
2.8
24
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2
87
33
3
0
63
1.10
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2.0
38
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16
88
34
5
0
60
1.19
26466562--26466591
4
7.5
4
100
0
60
23
0
0
76
0.78
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2.2
21
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33
2
0
64
1.05
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12
2.9
12
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32
0
0
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0.91
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3
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3
77
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38
0
0
61
0.96
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14
4.2
13
79
20
64
38
0
0
61
0.96
26466668--26466734
22
3.0
22
85
14
86
38
1
0
59
1.06
26471919--26471959
21
2.0
21
100
0
82
21
4
24
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1.69
26474466--26474541
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2.6
30
79
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63
3
1
31
1.21
26475456--26475499
20
2.2
20
84
8
54
59
4
4
31
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26476131--26476188
29
2.0
29
96
0
107
22
6
13
56
1.61
26478199--26478376
75
2.4
75
82
1
205
25
21
24
29
1.99
26481594--26481685
6
15.8
6
94
1
118
65
1
0
33
1.00
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2.8
20
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29
1.77
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23
3.4
23
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33
18
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23
1.96
26484762--26484847
45
1.9
45
83
4
111
36
16
24
23
1.94
26484786--26484847
22
2.7
23
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20
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35
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1.95
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8
100
0
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0
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1.52
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20
5.7
20
74
10
79
39
17
8
33
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328