Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  40  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11701764--11701828
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2.2
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3
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1.14
11705529--11705595
26
2.6
24
80
13
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32
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1.25
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22
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5
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0
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0
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0.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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2.1
99
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227
29
8
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58
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.33
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0
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0.77
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24
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1.98
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18
23
27
1.97
11815307--11816022
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320
30
18
22
28
1.97
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89
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19
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1.98
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134
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99
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2.0
23
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0
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45
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19
28
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11841721--11841789
31
2.2
32
82
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43
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17
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1.99
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2.3
18
81
14
52
62
11
2
23
1.40
11859184--11859246
28
2.2
28
97
0
117
30
19
11
39
1.86
11859609--11859660
11
4.9
11
75
17
56
38
19
9
32
1.84
11861419--11861483
24
2.8
22
84
11
69
26
1
1
70
1.04
11861449--11861500
24
2.2
24
82
6
61
26
3
1
67
1.18
11862997--11863055
25
2.3
26
85
2
75
59
1
6
32
1.34
11862998--11863093
25
3.7
25
68
16
61
55
3
9
32
1.48
11864643--11864704
3
20.7
3
100
0
124
33
0
0
66
0.92
11864749--11864857
53
2.1
53
98
0
209
33
5
8
53
1.54
11865016--11865072
21
2.7
21
77
0
51
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10
1
56
1.44
11877421--11877574
79
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79
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0
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28
16
20
33
1.95
11877483--11877812
85
3.7
92
83
10
391
26
17
18
37
1.93
11877757--11877918
54
3.0
54
88
2
227
30
12
17
39
1.86
11879000--11879029
15
2.0
15
93
0
51
0
10
6
83
0.81
11879857--11879923
3
22.7
3
96
3
127
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11880337--11880398
24
2.6
21
76
18
52
32
4
4
58
1.40
11883282--11883312
6
5.3
6
96
3
55
0
12
0
87
0.55
11886697--11886784
31
2.9
30
84
3
79
48
13
6
30
1.68
11886712--11886784
31
2.4
31
88
0
110
46
13
8
31
1.73
11887129--11887198
36
2.2
31
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26
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2
15
45
1.61
11887138--11887211
36
2.1
36
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0
139
37
4
13
44
1.63
11889279--11889392
23
4.9
23
70
18
60
55
6
7
30
1.53
11889348--11889392
11
4.1
11
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0
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0
35
1.17
11889915--11889950
11
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0
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0
1.00
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17
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75
0
7
16
1.02
11891331--11891388
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1.9
30
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44
25
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20
1.80
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24
2.0
24
100
0
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26
24
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1.96
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14
2.6
14
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4
54
51
5
14
28
1.65
11891567--11891779
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2.7
77
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3
257
33
18
18
30
1.95
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2.1
91
84
5
238
34
19
20
25
1.96
11891783--11891947
75
2.1
77
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6
237
30
20
19
29
1.97
11891951--11892232
74
3.9
73
78
11
285
28
23
17
30
1.97
11891621--11892095
167
2.8
167
91
2
747
29
20
19
29
1.97
11892031--11892155
64
1.9
65
93
1
216
22
23
17
36
1.94
11891978--11892232
141
1.8
138
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4
368
27
23
16
31
1.96
11904577--11904688
23
4.9
23
69
20
58
55
6
8
30
1.54
11904646--11904688
11
3.9
11
81
0
50
60
4
0
34
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11905173--11905208
11
3.2
12
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11
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47
0
52
0
1.00
11905412--11905452
18
2.3
18
76
19
50
73
0
9
17
1.09
11905415--11905453
17
2.3
17
86
8
53
71
0
10
17
1.12
11908232--11908267
8
4.4
8
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50
2
0
47
1.15
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
11910146--11910170
2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2.0
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0
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13
1
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1.54
11913223--11913276
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28
100
0
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0
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22
74
13
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67
5
24
2
1.24
11914987--11915030
22
2.0
21
82
4
52
47
4
22
25
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328