Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  245  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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2.0
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0.90
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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72934077--72934218
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5.5
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72934093--72934214
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2.0
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1.06
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24
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144
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17
1.91
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49
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193
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29
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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(0-2)
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3.0
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92
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1.62
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28
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1.98
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28
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28
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1.99
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28
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22
1.98
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21
32
22
1.98
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3.5
29
94
0
177
37
13
23
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73064938--73064973
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19
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0
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23
1.92
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1
244
38
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23
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26
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0
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0
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18
22
1.97
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6
9.0
6
95
0
99
35
0
14
50
1.44
73081552--73081599
14
3.4
14
85
0
60
18
31
6
43
1.75
73081967--73082005
11
3.7
11
86
6
55
87
5
0
7
0.68
73081988--73082012
1
25.0
1
100
0
50
100
0
0
0
0.00
73088440--73088487
14
3.4
14
85
0
60
18
31
6
43
1.75
73092872--73093019
42
3.5
41
80
4
161
31
17
25
26
1.97
73096618--73096657
6
6.7
6
100
0
80
32
0
0
67
0.91
73096913--73096944
2
15.5
2
93
6
55
46
3
0
50
1.17
73103091--73103144
24
2.3
24
87
3
74
33
20
25
20
1.97
73113133--73113182
24
2.1
24
88
3
75
38
22
22
18
1.94
73114240--73114273
13
2.6
13
100
0
68
23
35
29
11
1.90
73123442--73123622
39
4.6
39
90
2
247
22
31
22
23
1.98
73123472--73123622
77
1.9
79
91
2
252
22
31
21
23
1.98
73123472--73123622
39
3.9
39
93
2
250
22
31
21
23
1.98
73129060--73129141
40
2.0
40
90
0
128
24
14
19
41
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73130377--73130590
47
4.6
44
77
13
207
24
29
18
28
1.98
73130377--73130590
94
2.3
94
95
0
374
24
29
18
28
1.98
73133840--73133867
5
5.6
5
100
0
56
82
17
0
0
0.68
73139626--73139854
40
5.8
39
93
2
361
26
27
22
22
1.99
73139614--73139854
79
3.0
79
92
4
371
26
27
22
22
1.99
73147633--73147875
40
6.1
40
90
2
341
27
27
22
23
1.99
73147645--73147873
119
1.9
120
88
4
347
27
27
21
23
1.99
73155710--73155743
17
2.1
15
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10
50
70
2
26
0
1.01
73162996--73163079
29
2.9
28
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7
78
9
20
2
67
1.30
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22
2.0
22
82
8
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36
25
11
27
1.90
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40
8.1
39
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4
368
25
27
22
25
2.00
73180487--73180789
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3.8
78
84
8
346
25
27
22
24
2.00
73188714--73188935
40
5.6
39
80
8
211
27
26
20
25
1.99
73188714--73188936
77
2.8
79
80
9
244
27
26
20
25
1.99
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42
3.2
43
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7
118
34
25
12
27
1.92
73200990--73201097
42
2.6
42
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2
146
36
24
12
27
1.91
73201766--73201843
39
2.0
39
95
5
140
46
15
16
21
1.84
73203320--73203379
23
2.6
23
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0
93
21
35
30
13
1.92
73203474--73203555
40
2.0
40
88
0
119
13
41
23
21
1.88
73204935--73205033
42
2.3
43
81
5
112
34
34
15
16
1.90
73206132--73206156
7
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7
100
0
50
60
0
0
40
0.97
73208798--73208844
20
2.3
21
85
3
60
31
21
25
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73211098--73211161
30
2.2
29
83
8
76
14
25
1
59
1.44
73212392--73212422
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
73213509--73213655
67
2.3
63
79
11
154
21
29
17
30
1.96
73215570--73215614
19
2.4
19
96
0
81
17
2
4
75
1.07
73217089--73217135
20
2.3
21
85
3
60
31
21
25
21
1.98
73220776--73220807
13
2.5
13
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0
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9
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73221940--73222052
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2.7
43
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122
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22
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100
0
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23
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28
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0
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1.17
73229706--73229730
6
4.2
6
100
0
50
16
68
0
16
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328