Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  68  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18739482--18739584
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3.4
31
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102
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6
0
39
1.35
18739479--18739607
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2.1
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0
222
50
6
0
41
1.35
18742309--18742416
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2.2
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5
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1.73
18742323--18742430
25
4.4
25
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6
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38
1.79
18744148--18744226
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41
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0
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2
18
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70
1.22
18744876--18744923
21
2.2
21
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3
60
12
43
27
16
1.84
18745708--18745747
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2.0
20
90
5
62
35
0
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18748719--18748751
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2.1
16
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0
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9
0
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5.7
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1
393
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15
24
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1.92
18753404--18753664
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2.8
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1
400
39
15
24
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18753354--18753664
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2.3
130
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6
428
38
15
24
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1.92
18753925--18753971
25
2.0
25
83
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4
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1.60
18758317--18758359
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2.9
14
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6
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79
0
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9
4.2
9
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3
51
38
15
12
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244
2.0
236
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15
40
1.83
18783468--18783533
29
2.3
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5
105
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30
30
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18783468--18783565
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3.4
29
79
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94
25
14
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28
3.5
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6
114
29
26
13
29
1.94
18794476--18794576
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
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18800266--18800313
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3.1
15
87
6
60
56
25
2
16
1.51
18800268--18800313
24
1.9
24
81
0
56
56
23
2
17
1.52
18800283--18800314
16
2.0
16
100
0
64
56
25
0
18
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18801670--18801746
29
2.7
29
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11
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31
12
24
31
1.93
18804406--18804794
215
1.8
210
92
2
652
17
5
21
55
1.62
18804863--18804906
19
2.3
19
88
0
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13
2
25
59
1.46
18809635--18809794
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3.7
43
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4
223
21
22
31
24
1.98
18809632--18809817
87
2.2
86
93
1
309
23
22
28
25
1.99
18810185--18810230
21
2.2
21
84
0
56
2
50
19
28
1.60
18815879--18816035
9
17.6
9
80
3
156
36
1
15
47
1.54
18815880--18816034
27
5.8
27
88
0
177
36
1
14
47
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18816140--18816195
15
3.8
15
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64
51
0
1
46
1.11
18816277--18817710
289
5.0
289
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1
2792
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11
13
36
1.81
18822625--18822701
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26.0
3
93
2
129
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0
0
33
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15
2.3
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9
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42
0
57
0
0.99
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39
1
0
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1.09
18824149--18824180
15
2.1
15
94
0
55
31
9
0
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1.29
18825195--18825454
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41
91
0
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25
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18828958--18829038
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2.0
40
100
0
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27
1.90
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2.0
85
96
0
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33
17
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36
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18832353--18832396
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2.0
22
86
0
61
9
18
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63
1.49
18832705--18832747
12
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13
84
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20
0
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48
0
0
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1.00
18833648--18833689
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2.0
20
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33
0
7
59
1.25
18835191--18835253
31
2.0
31
84
6
81
34
9
12
42
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18843425--18843455
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2
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0
0
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1.00
18843503--18843532
2
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0
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0
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0
50
1.00
18845680--18845711
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10.7
3
100
0
64
68
0
0
31
0.90
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2.2
40
89
0
131
51
7
7
32
1.60
18854331--18854414
40
2.1
40
97
0
159
45
7
9
38
1.64
18854466--18854572
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2.2
49
86
0
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40
13
13
33
1.83
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2.2
32
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4
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13
10
24
50
1.74
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1.94
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3.1
31
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19
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1.64
18858000--18858093
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3
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47
1.65
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1.9
20
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16
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16
0
0
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0
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18876742--18877170
216
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214
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0
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1.92
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0
0
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20
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28
1.98
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20
28
28
1.99
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15
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76
11
18
12
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1.64
18891160--18891239
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94
12
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18893003--18893050
22
2.2
22
100
0
96
41
20
20
16
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18893061--18893090
13
2.3
13
100
0
60
33
40
26
0
1.57
18898014--18898184
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2.4
75
84
7
212
32
11
23
33
1.90
18898017--18898182
35
4.6
35
84
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174
31
11
23
33
1.90
18900526--18900571
21
2.1
22
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4
67
28
26
34
10
1.90
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5
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0
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0
0
22
0.77
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28
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16
14
25
1.86
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24
32
1.96
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2.0
399
96
0
1488
33
10
17
38
1.84
18906277--18906364
23
3.8
23
80
4
88
34
11
14
39
1.82
18906329--18906375
23
2.0
23
84
8
60
46
10
10
31
1.73
18908270--18908333
27
2.3
27
86
7
85
31
3
0
65
1.08
18908375--18908580
90
2.3
90
81
6
242
33
8
17
39
1.80
18909136--18909165
7
4.3
7
100
0
60
73
0
0
26
0.84
18914720--18914744
12
2.1
12
100
0
50
68
0
16
16
1.22
18914891--18914961
25
2.8
25
82
2
79
43
9
18
28
1.81
18917399--18917646
127
2.0
127
90
0
397
31
10
23
34
1.89
18931360--18931749
205
1.9
205
94
0
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1.71
18933236--18933283
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10
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4
56
1.52
18937163--18937252
45
2.0
45
93
0
153
26
31
12
30
1.92
18937495--18937545
22
2.3
22
96
0
93
45
7
15
31
1.75
18941323--18941437
27
4.3
26
85
5
140
36
22
23
17
1.95
18941323--18941437
54
2.1
54
87
3
160
36
22
23
17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18943056--18943165
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4.2
26
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0
175
35
24
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33
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18
1.9
18
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11
54
40
51
8
0
1.33
18951439--18951472
2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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25
2.1
26
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3
90
58
0
3
37
1.16
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17
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0
5
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1.16
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2
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2
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0
0
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1.00
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0
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53
10
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33
1.51
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17
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17
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1
2
32
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13
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11
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21
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2
2
29
1.21
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17
3.4
17
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1
3
31
1.20
18963512--18963580
34
2.0
35
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8
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1
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30
1.32
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0
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2.5
15
100
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17
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2.0
73
98
0
285
26
20
19
34
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10.7
119
95
0
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30
20
17
31
1.95
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5.9
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94
5
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12
0
0
87
0.54
18967653--18967691
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2.9
13
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12
0
0
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0.55
18967654--18967692
20
2.0
20
100
0
78
12
0
0
87
0.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18978505--18978546
18
2.2
20
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73
2
0
23
0.94
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20
2.2
20
87
4
61
65
0
2
32
1.06
18978634--18978663
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1.9
15
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53
10
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1.51
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17
5.8
16
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19
52
61
1
3
33
1.19
18978780--18978864
21
5.1
16
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20
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1
3
32
1.20
18978856--18978922
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2
2
25
1.18
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2.4
24
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0
1
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0
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0
0
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1.50
18987293--18987396
51
2.0
51
98
0
199
34
29
4
30
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328