Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr07 97507971 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  18  of  328  ( 39316 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5536983--5537026
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0
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0
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0
0
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0.90
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1
0
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2.9
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2.0
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0
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0
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26
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2.2
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1.53
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2.5
25
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0
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1.9
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2.1
27
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59
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2.2
15
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2.0
24
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24
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2.1
19
100
0
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20
25
10
45
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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1
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1.30
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1
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1.34
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24
2.4
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11
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1
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1.30
5612841--5612906
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2.1
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16
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7
0
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1.30
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2.9
27
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7
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1.49
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20
2.0
22
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30
0
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1.55
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4
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170
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3
4
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1.38
5614464--5614672
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108
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325
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4
4
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1.38
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2.1
17
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0
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2.5
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0
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0
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9
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2.2
17
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0
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1.80
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2.1
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3
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3
37
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0
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2.0
21
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0
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4
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3.1
20
82
11
65
46
1
1
50
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
12
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12
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1.80
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0
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0
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1.15
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6
0
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2.0
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1
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24
11
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22
14
41
1.89
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2
0
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2.9
257
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2
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2.0
23
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2
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1.9
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25
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0
100
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16
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19
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19
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1.31
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115
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20
18
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152
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13
24
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2.0
59
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0
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50
4
6
38
1.49
5732945--5733037
30
3.2
28
65
19
73
48
4
6
40
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5744435--5744475
17
2.4
17
87
0
55
43
14
9
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1.78
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3.7
7
100
0
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0
11
0
88
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2.1
19
100
0
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30
5
37
1.78
5758141--5758197
23
2.5
23
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62
50
0
5
43
1.24
5759545--5759844
163
1.8
164
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3
417
31
14
18
35
1.91
5759707--5760126
199
2.1
199
91
1
682
32
12
19
35
1.89
5759369--5760047
362
1.9
364
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4
978
32
13
19
34
1.91
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1.9
131
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7
7
41
1.62
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17
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50
23
11
15
50
1.76
5767541--5767608
32
2.1
32
97
0
127
23
13
11
51
1.73
5769273--5769332
29
2.1
29
93
0
102
28
11
10
50
1.71
5771534--5771898
181
2.0
180
95
1
651
36
20
17
25
1.94
5781936--5782003
31
2.2
31
100
0
136
47
16
2
33
1.62
5783070--5783110
21
2.0
21
90
4
66
56
0
0
43
0.99
5783076--5783119
21
2.0
22
91
4
72
47
0
2
50
1.13
5794958--5795017
19
3.1
19
85
2
75
48
8
3
40
1.50
5796090--5796224
39
3.4
39
73
10
114
28
27
20
23
1.99
5797741--5797775
17
2.1
17
88
0
52
5
14
5
74
1.19
5797805--5797838
13
2.6
13
90
0
50
52
0
2
44
1.16
5801650--5801679
15
2.0
15
100
0
60
46
13
6
33
1.69
5805476--5805534
29
2.0
29
87
12
86
61
3
1
33
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5807789--5807875
46
1.9
45
90
4
140
28
25
13
32
1.94
5812851--5812879
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
5813518--5813854
134
2.5
133
79
7
357
29
17
17
35
1.93
5819260--5819310
24
2.1
24
96
0
93
37
17
5
39
1.74
5823653--5823700
23
2.1
23
88
0
69
22
6
39
31
1.79
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21
2.0
21
85
0
55
53
9
12
24
1.68
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13
2.9
14
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13
50
54
0
0
45
0.99
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16
2.3
16
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13
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59
0
0
40
0.97
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19
3.2
15
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21
50
54
1
0
43
1.11
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33
2.2
33
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11
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51
12
5
30
1.62
5827904--5828072
90
1.9
90
97
0
320
30
16
14
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1.89
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10.7
3
100
0
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0
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0
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18
2.0
17
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5
52
20
37
11
31
1.88
5834999--5835119
31
3.9
32
78
7
135
38
12
8
40
1.73
5835930--5836061
58
2.3
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80
10
157
34
3
1
60
1.21
5836896--5837029
9
14.8
9
64
23
50
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2
2
33
1.24
5836944--5837028
19
4.8
17
74
17
68
58
3
1
36
1.23
5837298--5837348
23
2.2
23
100
0
102
33
15
7
43
1.76
5837992--5838106
42
2.7
42
87
4
160
27
25
16
30
1.97
5838171--5838350
31
5.8
31
92
2
299
25
28
20
26
1.99
5838326--5838454
50
2.5
51
88
2
197
26
20
16
36
1.94
5843906--5844095
27
7.6
25
71
18
121
31
4
3
61
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5843948--5844064
50
2.3
49
82
8
128
33
5
1
59
1.29
5843906--5844092
26
7.5
23
72
17
94
31
4
3
60
1.31
5843907--5844094
76
2.5
75
78
8
170
31
4
3
60
1.32
5843949--5844095
26
6.0
25
72
19
107
34
4
1
59
1.27
5847673--5847709
3
12.0
3
94
5
65
64
2
32
0
1.07
5849677--5849739
26
2.4
27
78
7
76
38
7
17
36
1.79
5849713--5849737
13
1.9
13
100
0
50
32
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20
40
1.81
5857376--5857428
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2.4
22
100
0
106
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3
3
45
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2.0
15
93
0
51
50
0
10
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1.36
5859626--5859707
21
3.8
21
88
3
101
32
26
25
14
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328