Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  269  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80517503--80517543
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11
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0
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0
0.93
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21
1.91
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1.9
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0
315
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19
1.90
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130
2.6
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6
443
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15
23
21
1.90
80519858--80519988
46
2.7
48
87
6
169
42
15
22
19
1.88
80522925--80523100
46
3.8
45
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11
187
22
20
28
28
1.99
80522921--80523092
93
1.8
93
91
2
283
22
20
29
27
1.99
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6.5
177
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18
23
28
1.97
80524637--80525770
350
3.2
350
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1473
30
18
23
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1.97
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3.3
19
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15
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2
1
50
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2
2
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48
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20
28
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1.99
80542240--80542522
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2.9
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19
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1.99
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100
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2
352
24
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1.97
80545888--80546268
153
2.5
153
90
1
586
24
16
27
30
1.97
80545888--80546277
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7.7
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403
24
16
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1.9
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21
20
27
1.98
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23
5.1
23
92
3
195
29
21
20
29
1.98
80558029--80558149
47
2.6
47
92
4
199
29
21
19
28
1.98
80558360--80558422
31
2.0
31
93
0
108
36
15
23
23
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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24
1.93
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19
2.3
19
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0
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22
25
22
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1.99
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0
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4
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9
0
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80584724--80584828
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22
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1.97
80584764--80584836
23
3.2
23
74
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76
31
20
23
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1.98
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31
2.0
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100
0
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3
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5.8
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1
1
42
1.21
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3.5
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10
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26
28
17
27
1.98
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29
2.9
28
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10
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27
30
15
26
1.96
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3.1
42
97
0
240
17
11
27
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3.3
22
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15
58
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11
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1.79
80618712--80618780
20
3.3
20
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21
61
17
10
27
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1.80
80619585--80619642
28
2.1
28
93
0
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6
10
39
1.66
80619905--80620068
47
3.5
47
82
10
176
25
29
17
27
1.98
80630231--80630313
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2.2
37
97
0
157
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20
7
36
1.80
80630912--80631127
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4.7
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10
155
23
30
19
26
1.98
80640507--80640665
72
2.3
71
82
4
180
22
28
15
33
1.94
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19
2.1
19
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0
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5.0
5
100
0
50
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0
0
20
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
24
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1.85
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0
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15
32
26
1.95
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29
2.6
29
95
0
132
24
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50
1.73
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2.0
23
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0
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36
13
14
1.85
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21
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36
20
8
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2.0
53
80
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117
42
6
4
46
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80764398--80764455
23
2.7
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1
0
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19
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8
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54
1.44
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2.1
17
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1.11
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0
0
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0
0
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2
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2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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15
2.4
15
90
0
54
2
13
0
83
0.76
80777571--80777641
28
2.5
28
79
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28
4
18
49
1.66
80778070--80778129
24
2.5
24
79
12
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1
0
43
1.10
80778080--80778129
24
2.1
24
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10
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2
0
42
1.11
80778082--80778136
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1
0
45
1.11
80778083--80778153
33
2.2
33
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0
115
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1
1
42
1.17
80779714--80779786
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2.0
36
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0
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38
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1.88
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46
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31
20
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1.98
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40
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1.99
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2.0
27
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25
2.0
25
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10
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80813368--80813533
6
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6
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24
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53
3
1
42
1.27
80813401--80813444
14
3.4
14
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28
51
56
0
2
40
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.0
20
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3
39
1.36
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25
2.5
25
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0
3
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1.15
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4
1
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1.31
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39
4.9
39
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0
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24
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22
1.98
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162
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24
24
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25
2.00
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13
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1.83
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26
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65
2
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0
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10
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17
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17
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0
1
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15
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64
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1.17
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18
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0
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78
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32
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14
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80853415--80853614
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2.4
84
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332
36
11
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44
1.71
80853415--80853652
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13
2.0
13
100
0
52
15
15
38
30
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80856410--80856553
73
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73
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0
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27
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1.9
27
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35
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25
1.95
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30
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0
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3.1
31
78
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87
31
5
2
62
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328