Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  192  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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49
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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133
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20
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0
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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2.0
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0
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2.2
253
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1
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27
18
15
38
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57367698--57368768
159
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159
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2
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1
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25
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0
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36
7
15
40
1.76
57385603--57385667
31
2.1
31
82
5
78
46
7
9
36
1.65
57388141--57388215
31
2.4
32
84
4
100
49
9
6
34
1.61
57389526--57389599
31
2.4
31
81
0
94
37
5
8
48
1.56
57392828--57393003
76
2.3
76
80
4
196
36
9
11
43
1.72
57394775--57394802
13
2.2
13
100
0
56
28
0
14
57
1.38
57396221--57396466
40
6.2
40
90
0
386
22
21
26
29
1.99
57398635--57398694
10
6.0
10
81
11
61
66
3
8
21
1.33
57414113--57414150
18
2.0
19
85
10
51
44
18
15
21
1.86
57414989--57415022
10
3.3
10
95
4
59
50
17
20
11
1.77
57416356--57416395
17
2.3
18
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4
55
50
2
5
42
1.37
57416526--57416568
13
3.2
13
83
9
52
44
2
0
53
1.13
57416683--57416718
19
1.9
19
88
5
56
55
0
0
44
0.99
57416724--57416756
9
3.7
9
88
11
50
57
0
6
36
1.23
57417832--57417939
28
3.9
27
82
4
126
31
12
19
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57417831--57417939
56
1.9
56
90
0
173
32
12
19
35
1.89
57418734--57418803
23
3.0
23
91
0
104
40
1
14
44
1.54
57419600--57419659
31
1.9
31
83
10
77
21
5
3
70
1.22
57419625--57419670
22
2.1
22
84
8
58
19
2
2
76
1.00
57424074--57424104
2
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2
100
0
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0
0
48
1.00
57425731--57425767
18
2.1
18
100
0
74
43
16
16
24
1.87
57425868--57425892
13
1.9
13
100
0
50
40
48
0
12
1.40
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20
2.0
20
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0
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7
2
12
1.09
57425977--57426044
9
7.6
9
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25
7
19
48
1.74
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4.9
20
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2
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41
13
7
37
1.72
57432476--57432580
19
5.4
19
71
7
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39
14
7
39
1.74
57432472--57432580
39
2.8
39
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4
132
39
14
7
38
1.74
57433462--57433573
20
5.7
20
72
6
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26
5
17
50
1.68
57434265--57434299
16
2.1
17
89
5
54
42
11
0
45
1.40
57434887--57434919
17
1.9
17
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11
50
0
18
0
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0.68
57441038--57441102
33
2.0
33
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0
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35
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20
2.3
20
81
0
58
19
38
19
23
1.93
57446021--57446098
6
13.5
6
77
12
83
78
5
1
15
0.99
57445997--57446098
12
7.9
12
71
25
59
75
4
0
18
1.04
57446012--57446100
41
2.2
41
80
8
101
74
4
2
19
1.10
57446021--57446099
17
4.6
16
79
13
70
77
5
1
16
1.01
57449561--57449818
49
5.2
49
93
3
444
34
8
26
31
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57449560--57449838
51
5.5
51
93
2
458
34
8
26
30
1.86
57449560--57449818
100
2.6
100
98
0
500
34
8
26
30
1.85
57449887--57449973
37
2.3
36
94
5
147
20
18
33
27
1.96
57451644--57451677
17
2.0
17
88
0
50
35
20
8
35
1.84
57456078--57456186
56
1.9
56
84
0
146
22
13
12
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1.75
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92
3.6
92
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10
343
36
18
10
34
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19
2.5
20
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60
2
2
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1.20
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3
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1.26
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13
74
28
2
3
65
1.23
57458505--57458636
18
7.2
18
73
15
85
28
3
3
64
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328