Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  73  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20045816--20045859
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0
0
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51
1
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1.07
20047478--20047592
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0
0
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0
0
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2.8
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82
4
152
34
13
24
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20
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2.0
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0
0
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0
0
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0
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1.53
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2.3
13
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2
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2
100
0
98
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20105074--20105117
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20
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4
2
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20110386--20110456
15
5.1
15
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40
0
2
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2.0
25
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0
125
40
0
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56
1.13
20110393--20110449
25
2.3
25
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6
71
42
0
3
54
1.17
20114160--20114198
20
2.0
19
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5
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69
0
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1.14
20114332--20114594
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20114538--20114597
28
2.1
28
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5
30
1.40
20114494--20114579
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5
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1.48
20115886--20116301
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20
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20116484--20116692
43
4.8
43
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22
21
32
1.98
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2.4
260
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21
31
1.98
20116205--20116826
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4.8
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1
800
24
22
21
31
1.98
20128456--20128711
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1
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19
22
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29
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1.8
128
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0
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37
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1.90
20132566--20132856
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8
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63
2
4
29
1.27
20132800--20132859
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6
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5
5
30
1.40
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12
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0
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19
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20
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1.77
20138428--20138477
24
2.1
24
85
3
66
26
4
6
64
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1
6
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1.28
20141310--20141441
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3
68
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61
2
6
30
1.32
20141588--20141646
16
3.6
16
73
10
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64
1
6
27
1.28
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0
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0
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0
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0
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0
0
0
0.00
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0
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2.1
33
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211
29
6
16
48
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20216519--20216551
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16.5
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100
0
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0
0
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1.00
20217290--20217366
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15
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0
0
67
0.91
20228293--20228355
30
2.1
30
90
0
99
57
12
3
26
1.51
20228385--20228427
22
2.0
22
85
0
59
55
6
13
23
1.62
20232177--20232421
33
7.5
33
79
7
131
28
22
13
35
1.91
20232278--20232421
33
4.4
32
86
6
164
29
20
11
37
1.89
20232210--20232421
65
3.2
61
74
14
174
30
21
12
35
1.90
20233105--20233152
21
2.2
22
82
14
64
35
18
0
45
1.50
20239860--20239951
33
2.8
32
75
15
89
30
26
11
31
1.92
20241435--20241515
24
3.4
24
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11
103
29
22
18
29
1.97
20241442--20241514
23
3.1
23
86
5
94
31
20
19
28
1.97
20241561--20241631
20
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20
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0
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1.87
20243403--20243518
33
3.5
33
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5
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31
20
10
37
1.86
20244868--20244935
33
2.1
33
100
0
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35
5
14
44
1.70
20244878--20244953
33
2.4
32
84
6
93
35
5
14
44
1.68
20246273--20246327
27
2.0
27
100
0
110
38
7
10
43
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20250875--20251128
55
4.8
54
81
8
258
22
24
16
35
1.95
20250922--20251121
108
1.8
109
87
7
300
23
24
18
34
1.96
20257896--20258039
58
2.5
58
82
4
182
47
24
11
17
1.80
20257886--20258062
58
3.1
57
79
6
180
45
27
10
16
1.80
20258870--20258947
40
2.0
40
89
0
120
35
32
12
19
1.89
20269217--20269409
40
4.8
40
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3
192
30
15
23
30
1.95
20269214--20269409
80
2.4
81
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227
30
15
24
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1.95
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2.5
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1.96
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2.5
39
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0
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22
22
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1.99
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2.0
24
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4
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27
6
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1.67
20282505--20282635
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3.2
40
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169
25
17
25
30
1.97
20282505--20282670
40
4.1
41
79
9
130
27
15
25
31
1.96
20291091--20291117
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
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2.0
16
100
0
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6
6
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6
6.7
6
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0
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0
15
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1.45
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2
20.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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4
152
34
13
24
27
1.93
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30
2.1
30
100
0
124
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12
25
19
1.87
20307693--20307821
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
20324219--20324411
105
1.9
101
80
6
226
34
17
22
25
1.96
20325525--20325584
22
2.7
23
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10
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31
21
26
20
1.98
20325517--20325594
22
3.5
22
80
0
75
33
24
24
17
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20325828--20325893
27
2.4
27
77
7
71
25
19
19
34
1.96
20331883--20331916
18
1.9
18
88
5
52
41
11
17
29
1.85
20332692--20332746
22
2.5
22
87
0
83
40
29
21
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1.84
20345587--20345613
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
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2.7
14
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0
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1.73
20347071--20347116
19
2.4
19
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30
10
10
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2.0
20
100
0
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0
0
50
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2
0
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93
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13
11
18
1.66
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14
2.0
14
100
0
56
50
14
0
35
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328