Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  23  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6853943--6853999
20
2.9
20
78
17
66
43
1
54
0
1.10
6855307--6855368
14
4.5
14
81
4
72
59
4
14
20
1.53
6855356--6855581
77
3.0
75
85
5
294
31
21
20
26
1.98
6855467--6856396
160
5.7
165
77
13
572
33
19
17
29
1.95
6855672--6855814
71
2.0
72
82
8
175
31
20
18
29
1.96
6855676--6856396
160
4.4
160
83
13
970
32
19
17
29
1.95
6855841--6855974
71
1.9
71
87
3
198
29
21
16
32
1.95
6855912--6856237
89
3.8
85
80
11
316
33
19
17
29
1.95
6855500--6856396
488
1.8
489
96
0
1679
33
19
17
28
1.95
6856160--6856302
71
2.0
72
82
8
175
31
20
18
29
1.96
6869359--6869524
35
4.6
35
83
8
192
33
24
10
31
1.90
6869354--6869524
74
2.4
73
83
9
217
33
23
11
31
1.90
6872811--6872859
23
2.0
25
84
11
66
40
14
0
44
1.45
6873445--6873511
10
6.4
11
77
17
56
62
5
0
31
1.19
6873445--6873502
21
2.6
22
76
20
66
62
6
0
31
1.22
6873923--6873948
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
6875828--6875967
60
2.3
61
80
1
156
26
10
20
42
1.84
6878124--6878149
6
4.3
6
100
0
52
30
0
0
69
0.89
6878562--6878620
31
2.0
29
90
6
91
40
11
10
37
1.76
6880735--6880914
98
1.8
98
88
4
274
43
11
4
41
1.60
6881369--6881406
18
2.1
18
90
9
60
52
10
13
23
1.71
6885035--6885104
29
2.3
31
87
7
99
47
0
1
51
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6886894--6886981
41
2.1
41
95
0
158
36
19
7
36
1.81
6887147--6887220
18
4.1
17
75
13
51
60
5
2
31
1.33
6887650--6887683
17
2.0
17
94
0
59
44
5
8
41
1.60
6887969--6888019
27
1.9
26
84
11
68
43
7
1
47
1.43
6887966--6888058
44
2.1
44
80
5
100
40
9
4
45
1.57
6888170--6888203
10
3.5
10
92
4
52
76
0
0
23
0.79
6893157--6893342
95
2.0
92
93
6
324
23
8
15
52
1.69
6894596--6895018
151
2.7
153
82
7
480
30
18
15
34
1.93
6897371--6897409
2
19.5
2
100
0
78
51
0
0
48
1.00
6898238--6898270
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
6898436--6898483
23
2.1
23
100
0
96
41
8
4
45
1.53
6898767--6898800
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
6900806--6900845
21
1.9
22
85
10
57
42
0
7
50
1.30
6900964--6900988
12
2.1
12
100
0
50
44
0
8
48
1.32
6902936--6903208
46
6.0
46
84
1
316
41
15
23
20
1.90
6902947--6903191
91
2.7
91
86
1
328
42
15
23
19
1.89
6902946--6903208
137
1.9
137
85
1
357
41
15
23
19
1.90
6903489--6903521
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
6905687--6905740
20
2.6
21
82
11
67
35
0
7
57
1.27
6905730--6905757
11
2.5
11
100
0
56
28
0
0
71
0.86
6917331--6917388
26
2.2
26
81
6
64
65
0
1
32
1.03
6917452--6917508
26
2.2
26
81
9
64
29
1
3
64
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6918762--6918821
27
2.2
27
96
0
111
20
11
30
38
1.88
6922078--6922131
27
2.0
27
96
0
99
42
3
5
48
1.44
6930620--6930694
38
2.0
38
100
0
150
50
2
10
36
1.51
6931095--6931157
33
1.9
33
96
0
117
31
22
14
31
1.93
6932892--6932916
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
6936351--6936432
2
43.0
2
73
18
68
46
1
3
48
1.27
6937127--6937170
2
22.0
2
95
0
79
47
0
0
52
1.00
6940076--6940116
14
2.8
15
75
20
50
60
2
0
36
1.10
6941036--6941084
21
2.3
22
82
3
64
63
10
0
26
1.26
6943184--6943208
3
8.3
3
100
0
50
32
0
0
68
0.90
6945699--6945726
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
6946395--6946450
25
2.2
26
81
12
62
32
5
0
62
1.18
6946476--6946538
9
6.8
9
77
13
65
31
1
1
65
1.12
6946481--6946531
19
2.7
19
78
6
59
35
1
1
60
1.19
6946477--6946538
28
2.2
28
85
5
81
32
1
1
64
1.13
6947159--6947294
64
2.1
65
94
4
240
52
8
4
34
1.51
6948385--6948423
20
2.0
20
84
0
51
64
2
5
28
1.28
6952899--6952933
18
1.9
18
88
0
52
62
0
2
34
1.10
6955072--6955109
12
3.3
12
85
7
53
50
5
0
44
1.24
6955205--6955249
20
2.3
19
84
7
63
0
57
2
40
1.11
6955209--6955261
19
2.8
18
80
11
61
0
52
1
45
1.11
6956192--6956237
23
2.0
22
88
12
67
36
0
2
60
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6956197--6956242
20
2.1
22
84
11
60
34
0
6
58
1.24
6973957--6974122
35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
6973957--6974127
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
6979667--6979779
31
3.7
29
75
11
84
32
9
3
53
1.51
6985133--6985204
30
2.3
32
79
11
87
52
8
11
27
1.65
6988495--6988589
10
10.3
9
74
15
79
65
2
1
31
1.11
6988495--6988580
19
4.8
17
74
14
66
65
2
1
31
1.13
6988494--6988589
28
3.5
27
78
16
90
65
2
1
31
1.11
6988540--6988601
29
2.1
30
82
8
74
62
1
3
32
1.20
6988821--6988883
29
2.2
29
85
5
83
36
9
1
52
1.44
6988850--6988922
19
3.7
19
74
13
76
27
4
5
63
1.35
6988914--6988982
29
2.5
27
83
6
84
37
1
1
59
1.15
6988953--6989001
19
2.6
19
83
9
64
36
2
0
61
1.08
6988935--6988993
28
2.1
28
87
6
84
42
1
0
55
1.09
6990791--6990909
10
12.4
10
68
14
65
37
2
3
56
1.30
6990811--6990868
18
3.0
20
72
23
61
34
0
5
60
1.19
6990788--6990868
37
2.2
37
86
0
108
37
0
4
58
1.20
6990919--6990988
37
1.9
35
83
11
88
27
5
1
65
1.23
6991779--6991813
12
2.9
12
86
0
52
51
20
5
22
1.68
6995516--6995722
103
2.0
103
84
5
272
42
16
12
28
1.84
6999955--7000032
38
2.0
39
90
5
122
24
11
2
61
1.42
7000115--7000161
22
2.1
22
96
0
85
19
8
10
61
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7005730--7005767
18
2.1
19
90
5
60
21
31
2
44
1.66
7008423--7008752
131
2.5
130
85
6
447
52
15
15
16
1.76
7012368--7012396
15
1.9
15
100
0
58
34
0
6
58
1.25
7013903--7013942
19
2.0
20
86
13
57
37
0
0
62
0.95
7013901--7013948
25
2.0
24
95
4
87
37
0
0
62
0.95
7016756--7016794
18
2.2
17
86
4
51
25
0
2
71
0.98
7021826--7021868
19
2.2
20
88
12
63
20
2
9
67
1.30
7026320--7026370
25
2.0
25
100
0
102
29
15
11
43
1.82
7029010--7029034
3
8.3
3
100
0
50
0
68
32
0
0.90
7029651--7029706
27
2.1
27
83
6
69
42
1
5
50
1.35
7036248--7036292
20
2.2
20
84
7
56
40
6
15
37
1.74
7037626--7037698
29
2.4
30
84
8
87
41
19
6
32
1.78
7044820--7044926
26
4.1
26
88
0
160
34
7
22
35
1.82
7044820--7044926
52
2.1
52
92
0
178
34
7
22
35
1.82
7046582--7046722
27
5.2
26
84
6
174
17
23
23
35
1.95
7046582--7046722
54
2.6
53
92
2
219
17
23
23
35
1.95
7049601--7049630
11
2.7
11
100
0
60
20
0
43
36
1.52
7052265--7052582
46
6.9
46
91
1
469
22
23
14
38
1.92
7052313--7052579
137
1.9
138
93
0
464
23
23
14
37
1.92
7057578--7057897
46
7.0
46
91
0
480
23
23
14
39
1.91
7060713--7060820
26
4.2
25
87
7
153
34
7
21
37
1.81
7060713--7060820
52
2.1
52
91
3
173
34
7
21
37
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7062444--7062584
54
2.6
53
90
2
219
17
23
23
35
1.95
7062444--7062584
27
5.2
27
84
10
182
17
23
23
35
1.95
7064388--7064434
18
2.5
19
82
6
60
31
12
8
46
1.72
7070030--7070093
31
2.1
31
94
5
112
42
7
12
37
1.72
7074703--7074746
22
2.0
22
86
0
61
22
15
4
56
1.57
7084695--7084744
24
2.1
24
88
0
73
26
44
6
24
1.76
7084900--7084967
9
7.6
9
86
0
82
44
22
7
26
1.79
7085468--7085520
24
2.1
26
86
6
74
58
9
18
13
1.61
7087268--7087308
3
13.7
3
100
0
82
34
0
0
65
0.93
7088604--7088649
3
15.3
3
95
0
83
34
0
2
63
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328