Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  21  of  328  ( 39316 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6312747--6312809
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17
23
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1.97
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1.96
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220
2.8
220
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20.3
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1
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19
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22
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4.4
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20
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1.96
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35
20
22
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2.2
174
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100
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1.21
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7.2
9
70
25
55
30
7
1
60
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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4
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3
1
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0
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1
0
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19
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6363108--6363160
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18
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0
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0
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0
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0.94
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23
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0
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69
64
2
2
31
1.16
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24
2.3
24
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6
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66
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1
30
1.12
6395110--6395161
8
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8
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65
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1
30
1.14
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2.8
24
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6
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52
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1.55
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25
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2
4
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1.31
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2.1
34
82
10
85
54
4
4
37
1.39
6395481--6395538
23
2.6
21
81
13
62
60
1
3
34
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.5
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1
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3
48
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1.67
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88
4.9
86
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15
285
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15
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2.1
30
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19
1.83
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436
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20
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1.9
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242
31
18
20
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1.97
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168
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12
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20
18
29
1.96
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10
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20
17
28
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21
17
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1.96
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1
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4
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1.35
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5
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18
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1.9
19
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5
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55
0
2
41
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6416450--6416490
6
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6
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0
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0
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1.22
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2
0
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1.11
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2.0
22
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4
6
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1.51
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0
3
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0
1
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29
0
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40
0
1
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0
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1
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100
0
0
0
0.00
6448509--6448747
42
5.5
43
77
5
214
34
22
24
18
1.96
6448549--6448710
86
1.9
84
85
2
225
36
22
24
17
1.95
6448550--6448747
86
2.3
86
80
6
224
35
22
24
17
1.95
6449007--6449293
86
3.3
86
86
2
337
36
20
22
19
1.95
6457605--6457705
50
2.0
52
92
3
170
37
6
1
53
1.39
6459786--6459819
17
1.9
17
88
5
50
23
8
11
55
1.63
6460607--6460660
23
2.4
22
90
6
81
35
0
1
62
1.06
6460545--6460664
52
2.4
49
82
8
143
31
0
2
65
1.12
6461149--6461188
9
4.7
9
79
20
50
32
0
0
67
0.91
6461151--6461180
15
1.9
15
93
6
51
26
0
0
73
0.84
6463571--6463626
27
2.1
27
96
0
103
41
17
10
30
1.84
6465872--6465920
25
2.1
23
88
11
73
32
0
0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6468364--6468407
22
2.0
22
86
4
63
36
0
0
63
0.95
6469780--6469915
68
2.0
68
98
0
263
33
6
22
37
1.80
6474651--6474807
51
3.1
50
88
1
233
31
15
23
29
1.95
6479986--6480055
31
2.3
31
87
5
97
32
2
11
52
1.52
6486006--6486050
15
2.7
17
83
10
58
6
26
4
62
1.39
6486352--6486378
14
1.9
14
100
0
54
44
7
25
22
1.79
6487057--6487104
15
3.3
14
77
8
51
60
8
0
31
1.26
6499270--6499316
21
2.3
20
85
3
58
34
4
2
59
1.29
6499278--6499316
21
1.9
21
89
5
62
35
5
2
56
1.35
6503537--6503577
17
2.4
17
88
12
57
65
0
9
24
1.22
6503570--6503634
29
2.4
24
76
20
58
66
0
4
29
1.12
6503570--6503623
14
3.5
15
83
14
58
66
0
5
27
1.13
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5
12.4
5
77
13
65
77
1
1
19
0.94
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35
1.9
35
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11
95
76
1
1
20
0.94
6504588--6504753
88
1.9
88
83
2
217
23
23
21
31
1.98
6504585--6505176
84
6.9
87
85
2
530
18
22
22
35
1.96
6504729--6505176
167
2.7
168
88
1
682
17
22
23
36
1.95
6505035--6505165
40
3.2
40
66
23
99
15
20
25
38
1.92
6504729--6505176
84
5.3
84
89
1
655
17
22
23
36
1.95
6505245--6505436
64
3.0
64
94
1
321
35
14
19
30
1.92
6506510--6506557
20
2.5
20
86
10
64
0
10
8
81
0.88
6511584--6511667
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6514835--6514913
37
2.1
39
81
9
92
64
1
8
25
1.30
6515090--6515130
17
2.4
17
88
12
57
65
0
9
24
1.22
6515123--6515187
29
2.4
24
76
20
58
66
1
4
27
1.20
6520894--6520918
11
2.3
11
100
0
50
60
28
0
12
1.32
6523571--6523604
4
8.0
4
87
12
50
26
2
0
70
1.01
6523571--6523604
13
2.7
12
90
9
50
26
2
0
70
1.01
6524067--6524098
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
6525792--6525925
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15
67
17
64
57
0
8
33
1.34
6536643--6536859
114
1.9
116
85
2
285
46
11
14
28
1.78
6536647--6536894
115
2.1
116
80
3
259
47
10
14
27
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328