Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  35  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10164325--10164358
18
1.9
17
88
5
50
23
2
2
70
1.15
10168011--10168084
36
2.1
36
97
0
139
44
5
20
29
1.73
10175057--10175118
27
2.3
26
76
13
63
38
1
11
48
1.49
10176217--10176314
46
2.2
46
90
1
162
27
24
17
30
1.97
10180039--10180232
102
1.9
102
88
4
293
27
20
22
29
1.99
10180199--10180563
143
2.6
143
87
0
514
26
21
22
29
1.99
10180325--10180545
44
4.8
44
69
13
129
25
23
22
28
1.99
10181958--10182107
46
3.3
46
88
1
203
24
25
15
35
1.94
10182930--10182989
19
3.1
19
81
9
75
5
6
3
85
0.84
10182932--10182990
21
3.0
20
81
16
77
5
5
5
84
0.86
10189861--10189893
16
2.1
16
88
5
50
12
0
9
78
0.95
10195238--10195344
53
2.0
53
96
0
196
33
12
25
28
1.92
10195526--10195627
31
3.3
32
76
12
106
44
3
5
46
1.46
10203162--10203360
99
2.0
99
100
0
398
32
21
18
28
1.96
10203686--10203776
33
2.8
33
96
0
164
29
40
9
19
1.84
10221538--10221661
33
3.8
33
96
0
230
17
9
42
29
1.81
10236404--10236440
2
18.5
2
100
0
74
48
0
51
0
1.00
10236926--10237672
372
2.0
369
94
2
1307
34
11
18
35
1.87
10240202--10240228
14
1.9
14
100
0
54
59
3
7
29
1.42
10243809--10243888
2
41.0
2
78
9
76
43
0
55
1
1.08
10243809--10243921
12
9.4
12
80
7
104
39
0
59
0
1.04
10243876--10243920
4
11.2
4
90
0
63
31
0
68
0
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10248722--10248799
2
39.0
2
100
0
156
50
0
50
0
1.00
10254596--10254672
23
3.6
22
76
10
72
35
3
1
59
1.24
10255045--10255087
19
2.3
19
84
8
52
30
9
0
60
1.28
10255063--10255105
15
3.0
14
83
13
52
27
6
0
65
1.18
10257916--10258095
40
4.5
40
80
2
173
25
23
26
24
2.00
10257917--10258109
80
2.4
80
80
2
208
26
23
26
23
2.00
10258038--10258121
40
2.1
40
82
4
98
26
27
26
20
1.99
10265995--10266173
40
4.4
40
80
3
189
25
24
26
23
2.00
10265995--10266187
80
2.4
80
82
2
217
26
24
26
22
2.00
10266116--10266199
40
2.1
40
82
4
98
26
27
26
20
1.99
10272436--10272466
14
2.2
14
100
0
62
41
32
19
6
1.77
10272872--10272912
21
2.0
21
95
4
75
9
14
14
60
1.57
10274126--10274304
40
4.4
40
80
3
189
25
24
26
23
2.00
10274126--10274318
80
2.4
80
82
2
217
26
24
26
22
2.00
10274247--10274330
40
2.1
40
82
4
98
26
27
26
20
1.99
10278747--10278787
14
2.9
14
77
0
55
36
31
9
21
1.86
10280583--10280611
2
14.5
2
100
0
58
51
0
48
0
1.00
10279835--10281445
837
1.9
830
84
4
2110
39
15
17
27
1.90
10284218--10284251
17
2.0
17
88
0
50
32
5
0
61
1.20
10284292--10284370
26
3.2
23
75
18
61
32
3
2
60
1.28
10284293--10284373
24
3.2
26
85
8
103
32
3
2
61
1.26
10284383--10284433
22
2.3
23
83
10
61
29
9
1
58
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10284542--10284593
26
2.0
25
85
10
70
38
5
0
55
1.24
10291006--10291130
66
1.9
66
91
0
205
34
20
10
35
1.86
10291538--10291648
45
2.5
45
82
4
127
27
19
21
31
1.98
10291315--10291717
221
1.8
221
92
1
691
30
19
24
26
1.98
10291735--10292030
89
3.3
89
75
11
221
31
19
20
28
1.97
10291861--10292114
49
5.6
46
75
11
197
33
19
18
28
1.95
10291912--10292118
41
4.7
43
75
13
163
32
20
18
27
1.96
10291819--10292118
135
2.2
135
87
0
438
33
19
18
28
1.96
10291735--10292114
45
8.5
44
71
11
195
32
19
19
28
1.97
10293599--10293632
17
2.0
17
88
0
50
32
5
0
61
1.20
10293673--10293736
26
2.6
23
77
15
58
35
3
3
57
1.30
10293674--10293739
24
2.7
24
88
4
96
33
3
3
60
1.27
10293765--10293815
22
2.3
23
83
10
61
29
9
1
58
1.41
10293918--10293977
26
2.2
27
85
11
79
38
5
0
56
1.21
10295711--10295784
6
12.3
6
94
0
130
0
47
17
35
1.48
10296132--10296167
2
18.0
2
100
0
72
50
0
50
0
1.00
10315020--10315063
20
2.0
22
83
12
56
75
0
9
15
1.05
10322299--10322358
3
20.0
3
100
0
120
66
0
0
33
0.92
10322357--10322386
3
10.0
3
100
0
60
33
0
0
66
0.92
10344394--10344541
33
4.6
33
79
11
164
33
20
10
35
1.88
10344409--10344467
29
2.0
29
100
0
118
32
20
6
40
1.78
10344544--10344612
29
2.4
29
95
0
120
23
26
11
39
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10352971--10353014
22
2.0
22
100
0
88
27
22
13
36
1.92
10354545--10354577
16
2.1
16
100
0
66
24
15
6
54
1.63
10356414--10356462
12
4.2
11
85
12
62
22
4
0
73
1.00
10356414--10356461
6
8.0
6
79
6
53
20
4
0
75
0.97
10356419--10356461
17
2.5
17
88
3
59
18
4
0
76
0.95
10372140--10372271
33
4.0
33
80
7
135
34
21
9
34
1.87
10372143--10372268
65
1.9
65
85
3
173
34
23
8
33
1.85
10372261--10372358
29
3.4
29
89
0
142
24
24
14
36
1.93
10372841--10372885
20
2.2
21
92
4
74
35
20
4
40
1.72
10393230--10393394
58
2.9
56
81
10
174
42
1
3
53
1.24
10393561--10393631
16
4.4
16
87
0
106
28
26
7
38
1.82
10395919--10395970
5
9.6
5
80
19
52
17
3
1
76
1.02
10395921--10395979
25
2.4
25
80
5
66
18
6
1
72
1.15
10397283--10397309
14
1.9
14
100
0
54
18
7
7
66
1.40
10402924--10402979
18
3.1
18
86
0
58
76
0
3
19
0.93
10402931--10402979
6
8.2
6
93
0
71
77
0
0
22
0.77
10403667--10403705
20
2.1
19
85
9
53
53
17
25
2
1.56
10412912--10412953
6
7.0
6
86
0
57
16
2
4
76
1.07
10413289--10413318
14
2.1
14
100
0
60
36
6
6
50
1.55
10419486--10419686
101
2.0
99
85
1
267
29
25
18
26
1.98
10420408--10420489
26
3.2
26
96
0
155
30
6
26
36
1.81
10430346--10430374
9
3.2
9
100
0
58
41
0
0
58
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10432908--10432939
16
2.0
16
93
0
55
78
3
6
12
1.06
10436062--10436103
14
2.9
15
82
13
52
26
7
2
64
1.32
10442876--10442909
17
2.0
17
100
0
68
23
5
11
58
1.55
10448956--10449127
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
10448949--10449124
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
10455369--10455395
14
1.9
14
100
0
54
22
7
11
59
1.56
10477822--10477895
12
7.2
10
85
10
64
41
0
1
56
1.07
10477846--10477896
2
26.0
2
96
4
95
49
0
0
50
1.00
10480055--10480236
46
4.0
46
93
1
285
39
14
23
22
1.91
10482539--10482590
22
2.4
22
93
0
86
19
32
28
19
1.96
10485082--10485119
2
19.0
2
100
0
76
50
0
50
0
1.00
10485386--10485411
4
6.5
4
100
0
52
76
0
0
23
0.78
10487341--10487372
6
5.3
6
92
0
55
0
46
18
34
1.49
10487341--10487381
18
2.3
18
86
0
55
4
48
17
29
1.67
10487720--10487759
2
20.0
2
100
0
80
50
0
50
0
1.00
10493867--10493913
24
2.0
23
91
4
76
10
4
36
48
1.57
10494000--10494034
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
10509434--10509478
2
23.0
2
90
4
74
46
0
2
51
1.13
10510527--10510606
38
2.1
38
88
0
115
20
21
28
30
1.98
10510599--10510808
43
4.9
43
89
0
305
12
22
33
30
1.92
10511125--10511232
45
2.5
42
83
8
119
24
24
25
25
2.00
10514156--10514192
3
12.3
3
100
0
74
35
0
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10531589--10531642
20
2.7
19
72
8
54
33
0
1
64
1.04
10534024--10534054
7
4.6
7
96
4
55
16
9
0
74
1.07
10534024--10534059
14
2.8
13
88
12
56
16
8
0
75
1.04
10538789--10538938
40
3.8
40
78
9
164
24
27
23
24
2.00
10546908--10547054
40
3.8
38
80
8
163
23
27
24
23
2.00
10551175--10551211
17
2.2
17
95
0
65
59
10
8
21
1.56
10572914--10573002
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
10572914--10572993
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
10572925--10573002
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
10575552--10575723
93
1.8
93
94
0
308
27
29
21
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328