Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  59  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16439572--16439628
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0
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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16465932--16466262
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4.0
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432
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18
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1.97
16465962--16466307
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164
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455
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2.4
24
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28
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31
1.79
16475754--16475997
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4.6
53
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5
269
42
18
7
31
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.2
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25
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129
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368
25
19
23
31
1.98
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2.5
23
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13
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36
3
5
55
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16508701--16508863
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19
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1
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1.17
16518760--16518829
3
23.3
3
97
0
131
34
0
0
65
0.93
16519932--16520042
45
2.5
45
88
2
170
21
18
18
41
1.90
16520794--16520824
15
2.1
14
94
5
53
80
0
0
19
0.71
16524244--16524541
75
4.0
75
94
2
499
27
16
22
33
1.95
16524521--16524555
14
2.5
14
90
0
52
20
17
2
60
1.49
16524610--16524654
14
3.3
14
87
3
65
22
11
2
64
1.36
16524608--16524657
13
3.8
13
81
5
64
28
10
2
60
1.40
16524521--16524742
103
2.2
103
86
4
306
27
16
13
42
1.85
16524624--16524902
86
3.2
86
82
8
339
26
17
17
37
1.92
16524822--16524966
74
2.0
74
90
0
227
27
19
21
31
1.97
16524825--16524982
74
2.1
74
85
3
219
29
18
18
32
1.96
16526579--16526733
3
51.7
3
69
19
76
32
4
1
61
1.27
16526835--16526928
23
4.0
23
74
19
77
29
4
7
58
1.45
16526827--16527129
24
13.1
24
65
22
91
33
4
6
55
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16527180--16527244
33
2.0
32
81
6
76
33
6
4
55
1.45
16527234--16527281
25
1.9
25
91
0
78
31
8
8
52
1.61
16527223--16527287
25
2.5
25
80
5
76
33
7
6
52
1.55
16528108--16528133
8
3.2
8
100
0
52
38
11
0
50
1.39
16530237--16530315
27
2.9
27
82
0
95
22
32
22
21
1.98
16531437--16531512
32
2.3
32
76
8
82
28
1
1
68
1.06
16531431--16531501
25
2.9
24
81
8
90
32
1
0
66
1.01
16531709--16531748
19
2.0
20
85
4
55
70
0
2
27
1.01
16532349--16532409
28
2.2
26
81
16
70
32
6
3
57
1.41
16532912--16533068
9
16.0
9
67
22
52
57
1
2
38
1.21
16532957--16533044
21
4.1
21
75
11
72
59
1
1
38
1.13
16534048--16534223
86
2.0
86
90
2
273
16
18
14
50
1.78
16535607--16535764
10
17.1
9
68
20
87
32
1
4
60
1.27
16535627--16535704
28
2.8
28
85
12
108
33
2
2
61
1.23
16535612--16535746
37
3.6
37
77
17
104
35
2
2
59
1.25
16535615--16535746
38
3.6
35
76
15
97
35
2
3
59
1.26
16535691--16535764
27
2.7
27
78
15
82
33
1
4
60
1.24
16535737--16535775
21
1.9
20
89
5
60
28
2
7
61
1.37
16537190--16537232
17
2.5
17
96
0
77
44
20
0
34
1.52
16538365--16538404
20
2.0
20
85
0
53
15
12
15
57
1.66
16546981--16547035
21
2.7
21
71
20
53
34
3
12
49
1.59
16555414--16555443
2
15.0
2
92
0
51
50
3
0
46
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16557413--16557456
3
14.7
3
100
0
88
34
0
0
65
0.93
16558224--16558249
12
2.2
12
100
0
52
15
0
15
69
1.20
16563209--16563268
29
2.1
27
82
11
68
26
23
25
25
2.00
16563376--16563425
26
1.9
26
87
0
73
36
24
22
18
1.95
16570095--16570160
34
1.9
34
81
6
80
25
24
21
28
1.99
16583687--16583754
26
3.0
24
77
18
65
66
7
0
26
1.18
16586747--16586795
8
6.1
8
78
7
55
55
0
2
42
1.11
16589222--16589253
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3.8
9
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16
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31
0
0
68
0.90
16594210--16594243
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14
90
0
50
11
2
2
82
0.89
16598046--16598079
14
2.4
14
90
0
50
11
2
2
82
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          321   322   323   324   325   326   327   328