Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  300  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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89467219--89467601
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145
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547
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19
16
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1
1
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.94
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1.94
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1.9
19
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27
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10
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89559994--89560032
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3.5
11
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1.58
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18
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0
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24
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25
8
5
60
1.49
89566564--89566675
3
37.3
3
70
13
70
31
8
1
58
1.39
89566544--89566619
33
2.3
34
74
19
79
27
14
0
57
1.37
89569315--89569344
12
2.5
12
100
0
60
50
13
0
36
1.42
89569414--89569471
20
2.8
20
80
10
73
63
6
1
27
1.29
89569944--89569995
20
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20
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70
42
3
3
50
1.39
89569988--89570030
16
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16
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3
68
32
0
0
67
0.91
89575922--89575963
22
1.9
22
85
9
59
38
4
26
30
1.77
89578317--89578342
11
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11
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0
7
69
1.14
89581714--89581739
13
2.0
13
100
0
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1.30
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1
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28
1.12
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7
5.9
7
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0
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0
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1.31
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14
3.3
14
93
0
83
54
8
0
36
1.32
89595231--89595259
14
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14
100
0
58
51
0
13
34
1.42
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2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
18
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0
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0
2
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1.13
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13
2.1
13
100
0
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0
0
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0.99
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13
2.5
13
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4
50
52
2
0
44
1.16
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17
2.4
18
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15
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0
2
30
1.04
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0
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0
0
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1.00
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2.0
46
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0
175
32
10
18
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1.86
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21
2.0
23
86
13
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59
0
2
38
1.10
89616563--89616641
22
3.4
22
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23
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0
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1.25
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12
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0
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0
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1.41
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27
22
2.00
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2.4
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23
23
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23
1.99
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4.6
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138
26
23
27
22
2.00
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2.4
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4
186
23
24
29
22
1.99
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6
138
26
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27
22
2.00
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2.4
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4
186
23
24
29
22
1.99
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138
26
23
27
22
2.00
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2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
89650507--89650607
39
2.5
40
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1
132
30
22
24
21
1.99
89650507--89650689
40
4.6
40
82
3
181
27
22
26
23
1.99
89654666--89654806
70
2.0
70
100
0
282
34
15
19
29
1.93
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3.3
18
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0
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29
1.20
89665030--89665069
18
2.2
18
95
0
71
30
12
20
37
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89673485--89673525
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0
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0
0
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89674448--89674490
2
22.5
2
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63
46
0
2
51
1.13
89674448--89674490
19
2.3
19
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0
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0
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51
1.13
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2
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2
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0
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47
0
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1.14
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0
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0
0
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0
0
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0
0
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0
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12
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84
0
0
16
0.63
89686808--89686863
18
3.1
18
94
5
96
83
0
0
16
0.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328