Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  80  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22047662--22047735
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2.5
28
84
4
85
31
33
14
20
1.93
22055632--22055705
29
2.5
28
84
4
85
31
33
14
20
1.93
22063224--22063271
23
2.1
23
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0
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25
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12
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174
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1.99
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2.3
80
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24
22
29
24
1.99
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2.0
24
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0
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0
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21
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50
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0
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20
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24
20
19
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24
10
19
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42
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17
23
29
1.97
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4.3
40
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25
20
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26
1.99
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80
2.2
80
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209
25
20
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2.1
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142
15
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14
2.0
15
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20
0
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43
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25
16
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29
1.97
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2.3
86
90
2
312
24
17
29
28
1.97
22094123--22094411
56
5.2
56
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393
26
13
24
35
1.92
22097757--22097842
44
1.9
45
90
2
138
23
15
24
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22097764--22097920
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3.7
42
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10
140
24
17
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31
1.97
22108905--22109025
46
2.6
46
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5
127
28
19
28
23
1.99
22113189--22113260
35
2.1
35
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0
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15
2.0
15
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0
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20
26
23
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1.98
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3.0
153
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9
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39
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22127581--22127630
23
2.2
22
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26
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21
2.7
21
91
0
94
25
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15
0
0
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0
0
0.59
22132824--22132872
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0
0
0.59
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2
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2
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0
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0
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0
0
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1.00
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44
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0
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9
14
41
1.78
22144214--22144240
13
2.1
13
100
0
54
14
33
37
14
1.88
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21
2.4
21
83
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57
56
0
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36
1.29
22156095--22156158
29
2.1
31
82
8
78
34
0
3
62
1.11
22158654--22158717
30
2.1
30
85
2
83
40
15
4
39
1.68
22165348--22165409
30
2.1
30
93
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108
24
3
14
58
1.51
22165719--22165745
2
13.5
2
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0
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0
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3
94
5
69
0
0
68
31
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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27
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1
17
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27
2.2
27
87
0
84
33
3
16
46
1.64
22177719--22177775
28
2.0
28
100
0
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21
14
0
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1.28
22177727--22177773
14
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10
0
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1.20
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2.0
41
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15
10
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2
117
28
11
22
37
1.88
22184208--22184333
54
2.3
54
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139
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11
23
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2.1
12
100
0
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14
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1.72
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17
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56
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14
6.0
14
67
22
51
48
1
3
47
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22217242--22217286
24
1.9
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51
2
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42
1.34
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14
24
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0
0
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38
0
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1.13
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15
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15
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1.50
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21
6.0
21
80
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132
15
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220
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62
1.9
59
87
5
169
51
4
3
40
1.38
22240737--22240765
14
2.1
14
100
0
58
51
13
0
34
1.42
22242644--22242712
21
3.3
21
87
2
95
11
24
8
55
1.64
22246070--22246130
11
5.7
11
74
12
56
68
0
1
29
0.99
22249856--22250211
46
7.7
46
92
1
518
40
14
23
21
1.90
22251361--22251526
35
4.6
35
84
8
192
33
24
10
31
1.90
22251356--22251526
74
2.4
73
83
9
217
33
23
11
31
1.90
22254708--22254767
22
2.9
21
80
9
61
36
0
1
61
1.06
22255395--22255448
22
2.4
23
75
9
58
55
1
1
40
1.21
22257101--22257180
39
2.1
39
97
0
151
36
6
23
33
1.80
22259019--22259121
37
2.8
37
96
0
188
24
32
20
23
1.98
22259293--22259789
48
10.4
48
98
0
915
28
27
8
34
1.86
22261152--22261178
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
22263335--22263428
28
3.3
27
78
8
107
31
30
15
21
1.95
22263444--22263717
40
6.9
40
92
2
403
26
31
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22263444--22263712
79
3.4
79
90
4
411
26
31
22
20
1.98
22263444--22263718
119
2.3
120
88
6
425
26
30
21
20
1.98
22264995--22265097
37
2.8
37
96
0
188
24
32
20
23
1.98
22265270--22265674
48
8.4
48
96
0
720
29
27
8
34
1.87
22271788--22271850
6
10.5
6
78
13
67
77
0
3
19
0.90
22282567--22282612
6
7.5
6
90
4
65
78
4
0
17
0.91
22282567--22282612
19
2.5
18
85
3
65
78
4
0
17
0.91
22282632--22282700
9
7.7
9
77
6
68
27
7
18
46
1.75
22282632--22282700
27
2.6
27
81
9
86
27
7
18
46
1.75
22283876--22283908
17
1.9
17
93
0
57
33
3
6
57
1.38
22286181--22286319
74
1.9
75
96
1
262
41
10
9
38
1.71
22302031--22302090
17
3.4
18
77
15
54
66
6
6
20
1.38
22302305--22302381
39
2.0
39
97
2
147
37
2
15
44
1.61
22312820--22313020
93
2.2
93
96
0
366
28
29
19
21
1.98
22312867--22313020
47
3.3
47
78
15
201
29
29
18
22
1.97
22312813--22312988
46
3.8
46
79
12
207
29
29
20
20
1.98
22313003--22313038
18
2.0
18
94
0
63
33
30
16
19
1.94
22313025--22313110
46
1.9
45
85
4
120
30
27
19
22
1.98
22315015--22315102
29
3.0
29
80
8
97
56
15
17
10
1.66
22315015--22315093
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
22315026--22315102
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
22317981--22318246
93
2.9
93
98
0
505
28
29
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22317983--22318243
46
5.6
46
78
15
295
28
29
20
21
1.98
22341286--22341337
21
2.5
21
80
0
59
15
30
13
40
1.86
22355230--22355304
25
3.3
24
66
24
63
48
1
8
42
1.41
22355238--22355306
22
3.2
21
69
19
61
50
0
8
40
1.33
22355230--22355315
43
2.0
43
93
0
145
51
1
6
40
1.37
22361627--22361653
13
2.1
13
100
0
54
22
37
25
14
1.93
22363697--22363734
20
1.9
20
84
10
51
63
2
7
26
1.35
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80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
22373717--22373824
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
22381792--22381940
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328