Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  6  of  328  ( 39316 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1646311--1646341
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2.0
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2.5
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0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1747391--1747451
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25
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2.0
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3
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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2.2
33
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38
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26
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3.6
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194
29
27
15
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1865549--1865720
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96
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20
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20
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28
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21
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215
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17
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19
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32
1.98
1883508--1883922
173
2.4
173
80
7
464
26
19
21
32
1.97
1893072--1893100
13
2.3
13
94
5
51
41
0
0
58
0.98
1897118--1897154
3
12.3
3
100
0
74
67
0
0
32
0.91
1898726--1899067
151
2.3
150
78
8
349
38
10
6
44
1.65
1902838--1902883
23
2.0
23
82
0
56
67
2
0
30
1.03
1904921--1904957
14
2.6
14
91
4
56
24
5
2
67
1.25
1906842--1907031
93
2.0
93
93
0
326
21
27
26
24
1.99
1916110--1916167
30
1.9
30
82
0
71
13
15
43
27
1.85
1920386--1920417
7
4.2
8
88
11
50
21
0
0
78
0.76
1920386--1920417
15
2.1
15
94
0
55
21
0
0
78
0.76
1920938--1920978
22
2.0
21
85
9
57
43
0
7
48
1.30
1921138--1921288
73
2.1
71
86
2
203
27
17
31
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1926058--1926117
26
2.3
26
80
8
68
48
0
3
48
1.18
1926081--1926120
21
2.0
20
85
14
55
50
0
0
50
1.00
1926071--1926123
26
2.0
26
82
7
63
50
0
0
49
1.00
1934977--1935001
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
1935644--1935682
16
2.5
16
83
4
53
56
5
5
33
1.43
1948484--1948546
30
2.1
28
81
16
74
61
3
0
34
1.12
1958016--1958071
28
2.0
28
100
0
112
39
10
17
32
1.84
1981585--1981731
59
2.5
59
80
3
152
42
15
14
26
1.86
1983439--1983470
16
2.0
16
93
0
55
28
3
12
56
1.51
1988078--1988133
16
3.4
16
72
20
53
21
12
7
58
1.57
1994926--1995004
38
2.1
38
83
4
97
37
2
3
55
1.31
1996441--1996505
29
2.2
29
86
5
87
49
15
7
27
1.72
2000433--2000480
3
16.0
3
100
0
96
33
0
0
66
0.92
2011944--2012003
26
2.3
26
83
13
70
36
1
1
60
1.17
2021009--2021035
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
2021672--2021698
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
2030727--2030771
21
2.1
22
83
4
56
82
0
15
2
0.77
2033351--2033385
11
3.4
11
92
7
56
28
0
0
71
0.86
2033459--2033501
21
2.0
21
95
0
77
25
23
6
44
1.78
2042394--2042503
46
2.4
47
80
7
127
36
22
14
26
1.93
2050469--2050503
4
9.2
4
87
12
56
0
25
0
74
0.82
2053122--2053169
23
2.1
23
88
3
71
62
4
0
33
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2053514--2053592
9
9.4
9
67
20
55
32
2
0
64
1.07
2066603--2066630
7
4.0
7
100
0
56
71
14
14
0
1.15
2066684--2066739
28
2.0
28
100
0
112
50
28
3
17
1.63
2066743--2066815
33
2.2
33
90
0
110
28
15
24
31
1.95
2076074--2076184
31
3.7
30
70
16
86
44
11
11
32
1.77
2083703--2083750
2
24.0
2
100
0
96
50
0
0
50
1.00
2092473--2092509
20
1.9
19
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10
58
56
2
8
32
1.43
2095329--2095366
14
2.7
14
91
0
58
78
7
0
13
0.94
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4
7.2
4
92
7
51
0
73
0
26
0.84
2112519--2112563
23
2.0
23
95
0
81
48
20
6
24
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328