Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  105  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.6
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75
6
138
26
23
27
22
2.00
29252224--29252412
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
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3.0
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2.1
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.96
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16
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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28
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1.99
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92
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1.88
29472092--29472515
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4.5
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93
4
716
29
27
9
33
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29472343--29472412
22
3.3
22
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12
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1.99
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31
2.1
31
93
0
110
37
15
23
23
1.93
29495622--29495668
24
2.0
24
100
0
94
61
0
8
29
1.25
29505122--29505271
43
3.5
43
75
8
153
28
15
24
32
1.95
29506652--29506731
31
2.5
31
90
6
117
22
26
17
33
1.96
29506939--29507021
23
3.4
24
88
6
123
32
21
18
27
1.96
29507071--29507109
20
2.0
20
100
0
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20
12
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1.90
29507072--29507116
20
2.2
20
92
0
72
31
22
13
33
1.92
29514671--29514750
31
2.5
31
90
6
117
22
26
17
33
1.96
29514941--29515058
23
5.0
24
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7
163
30
22
19
27
1.98
29515107--29515173
20
3.3
20
93
0
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1.90
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1.89
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25
1.9
25
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0
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1.96
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42
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42
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3
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30
25
16
28
1.96
29525652--29525693
22
1.9
22
90
0
66
35
19
0
45
1.50
29529663--29529742
4
19.0
4
78
16
74
70
2
2
25
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29534586--29534668
41
2.0
41
90
4
132
33
16
22
26
1.96
29538501--29538764
48
5.6
46
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13
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29
17
29
23
1.97
29538501--29538764
94
2.8
93
82
10
288
29
17
29
23
1.97
29538503--29538871
140
2.6
140
80
10
362
28
18
28
24
1.98
29545452--29545678
48
4.7
47
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195
27
19
28
24
1.99
29555825--29555881
24
2.4
24
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5
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10
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1.9
26
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37
1.55
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2.8
18
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1
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1.30
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71
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0
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28
17
35
1.94
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3.1
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28
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21
28
17
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1.96
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142
1.9
141
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3
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20
28
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1.95
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2
21
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2.1
31
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0
101
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25
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1.94
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24
8.0
24
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2
305
26
21
23
28
1.99
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20
3.0
20
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0
104
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25
1.9
25
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25
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25
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42
1.9
42
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108
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1.74
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9
5.0
9
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19
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1.10
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2.4
26
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15
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1
1
58
1.17
29585986--29586077
14
7.1
14
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23
51
34
1
1
63
1.09
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24
2.0
24
100
0
98
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0
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1.20
29588495--29588540
12
3.9
12
80
2
58
43
4
0
52
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29589149--29589326
41
4.4
40
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5
209
21
22
20
35
1.96
29589149--29589326
82
2.2
81
85
5
234
21
22
20
35
1.96
29589149--29589357
41
5.1
41
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4
131
21
22
20
36
1.95
29591972--29592016
1
45.0
1
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0
54
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0
0
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0.43
29591972--29592016
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0
0
91
0.43
29591974--29592016
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2.3
18
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9
0
0
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25
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5.0
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36
22
22
18
1.95
29598330--29598470
54
2.6
55
87
5
207
36
24
21
17
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328