Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  278  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.07
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224
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2.0
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1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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2.4
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1
28
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83179934--83180141
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33
0
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2.2
22
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118
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28
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18
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72
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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10
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1.18
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22
2.1
23
88
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21
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22
50
24
18
22
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83289441--83289607
40
4.2
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15
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22
37
1.94
83314646--83314673
11
2.5
11
100
0
56
42
0
7
50
1.30
83327557--83327591
17
2.1
17
88
0
52
37
8
8
45
1.65
83334044--83334131
37
2.4
37
82
1
115
20
11
28
39
1.87
83336864--83336900
10
3.5
10
86
13
56
40
0
0
59
0.97
83336864--83336897
11
3.1
11
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52
44
0
0
55
0.99
83338606--83338723
58
2.0
58
95
0
209
33
11
22
32
1.90
83338965--83338997
13
2.6
13
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4
50
39
3
12
45
1.57
83340709--83340880
93
1.8
93
93
0
299
27
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20
1.98
83340702--83340877
46
3.8
46
79
12
198
28
30
21
20
1.98
83346969--83347100
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4.6
29
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1
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25
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17
25
1.97
83372210--83372343
68
2.0
68
96
0
250
34
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14
28
1.94
83380149--83380200
24
2.2
24
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0
68
23
23
36
17
1.95
83380833--83380875
21
2.0
21
83
16
54
37
4
11
46
1.61
83381356--83381492
40
3.4
40
88
0
193
23
14
27
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83381478--83381532
28
2.0
28
85
0
74
29
10
27
32
1.91
83385045--83385094
23
2.2
23
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0
55
58
0
4
38
1.17
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224
2.0
217
89
4
678
40
18
12
28
1.88
83391299--83391345
25
1.9
24
95
4
85
68
8
0
23
1.17
83394778--83394871
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2.0
47
100
0
188
31
23
10
34
1.89
83401765--83401866
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2.8
36
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28
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1.94
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2
17.0
2
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0
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0
2
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1.16
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39
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0
160
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24
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1.97
83407669--83407702
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11
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0
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1.56
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10
217
21
20
29
28
1.98
83413274--83413323
15
3.4
15
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2
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10
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1.59
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45
3.8
44
80
9
206
21
20
29
28
1.98
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40
5.2
40
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2
305
25
24
28
21
1.99
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40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
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1.99
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22
2.1
22
100
0
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36
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21
21
1.95
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2
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2
100
0
50
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0
0
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1.00
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2.7
15
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10
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4
7
40
1.52
83445736--83445792
2
28.5
2
100
0
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0
0
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1.00
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3.0
11
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50
26
5
0
67
1.13
83454180--83454220
15
2.6
16
88
11
59
26
4
0
68
1.10
83456262--83456475
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4.5
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210
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17
25
25
1.97
83456264--83456484
94
2.3
92
81
7
248
30
18
26
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83456495--83456612
49
2.4
49
84
2
139
27
19
28
24
1.99
83463883--83464035
48
3.2
48
75
3
139
29
16
28
26
1.97
83479928--83480217
147
2.0
147
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1
447
38
15
18
27
1.90
83490974--83491119
25
6.0
24
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5
206
27
22
21
28
1.99
83490965--83491117
49
3.1
49
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8
204
26
22
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30
1.98
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20
3.3
20
93
0
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20
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1.90
83491168--83491223
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11
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2.0
20
100
0
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20
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1.90
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20
2.2
20
92
0
72
31
22
13
33
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328