Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  295  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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184
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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21
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28
19
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
A
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2.2
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41
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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192
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0
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4
40
1.74
88107160--88107207
18
2.5
19
80
10
62
52
0
0
47
1.00
88108342--88108423
41
2.0
41
100
0
164
36
4
7
51
1.51
88124883--88124917
9
3.9
9
88
11
54
57
0
0
42
0.99
88124883--88124944
22
3.0
22
80
15
69
54
0
0
45
0.99
88124885--88124948
31
2.1
30
83
13
78
59
0
0
40
0.97
88124900--88124967
31
2.2
31
81
5
84
48
0
1
50
1.10
88125835--88125863
12
2.3
13
94
5
51
20
0
13
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1.26
88126831--88126907
33
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34
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15
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2
0
38
1.12
88126871--88126926
20
2.9
18
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10
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1
0
41
1.09
88127279--88127324
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24
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13
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10
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1.42
88127434--88127481
24
2.0
24
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0
60
27
2
2
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1.11
88130882--88130918
15
2.6
15
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8
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48
0
0
51
1.00
88135901--88135936
19
1.9
19
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5
65
41
0
22
36
1.54
88135983--88136096
48
2.4
47
79
4
122
25
13
21
39
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88138749--88138787
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2.8
14
92
0
60
41
7
17
33
1.79
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16
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17
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9
60
42
0
0
57
0.98
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2.6
22
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51
0
0
48
1.00
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15
3.1
14
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32
0
4
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1.15
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2
272
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17
26
29
1.98
88158727--88159011
136
2.1
136
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18
24
1.98
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26
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1.78
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26
1.98
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2.1
137
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24
1.98
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26
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0
150
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1.77
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0
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0
0
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19
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1.92
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17
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0
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1.82
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2.0
34
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16
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0
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4
152
28
26
13
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1.93
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28
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29
27
13
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1.94
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16
2.1
16
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59
60
0
0
39
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2.4
17
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0
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22
7
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60
1.54
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2.0
43
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42
1.71
88212471--88212537
22
3.0
22
86
0
89
11
19
19
49
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88219819--88219999
40
4.6
40
90
2
267
25
30
21
22
1.99
88227845--88228065
40
5.6
40
92
1
347
25
30
21
22
1.99
88239541--88239761
40
5.6
40
83
4
270
24
22
25
27
2.00
88247914--88248164
27
9.3
27
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199
33
10
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1.81
88247929--88248167
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293
33
10
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5.1
54
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88248010--88248211
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27
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47
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225
27
20
29
22
1.98
88262302--88262342
21
2.0
20
90
4
64
12
39
26
21
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328