Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  107  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.02
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Period
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Number
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Indels
Score
A
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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12
32
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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370
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19
25
1.98
30099012--30099173
86
1.9
84
81
13
197
32
23
19
25
1.98
30114884--30115005
42
2.9
42
79
9
124
33
24
16
25
1.96
30124063--30124272
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
30131965--30132002
14
2.9
13
81
11
51
57
10
13
18
1.63
30137408--30137517
42
2.6
43
81
4
134
24
17
26
31
1.97
30140347--30140478
29
4.6
29
79
1
122
23
17
34
25
1.96
30147459--30147619
29
5.6
29
84
1
171
24
16
32
25
1.96
30155373--30155535
43
3.8
44
79
11
151
24
17
26
31
1.97
30158004--30158211
53
3.9
54
75
1
184
20
23
18
37
1.94
30168631--30168659
15
2.0
15
93
6
51
68
0
0
31
0.89
30178925--30178964
18
2.2
19
86
4
55
37
10
12
40
1.77
30182716--30182810
44
2.0
48
88
11
144
37
14
13
33
1.86
30190483--30190557
25
3.0
25
78
2
87
36
14
6
42
1.72
30205562--30205604
16
2.7
16
92
0
68
48
18
23
9
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30205562--30205604
8
5.4
8
80
0
50
48
18
23
9
1.76
30205836--30205949
29
4.0
28
73
8
113
29
14
31
24
1.94
30212669--30212841
45
3.8
45
94
0
292
29
24
21
23
1.99
30213597--30213738
47
3.0
47
91
1
232
42
16
11
29
1.84
30214741--30214767
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
30216727--30216828
33
3.1
33
81
5
91
31
11
23
33
1.91
30217315--30217790
237
2.0
235
89
2
720
27
25
18
28
1.98
30218910--30219077
40
4.2
40
77
3
151
23
26
23
27
2.00
30231734--30231901
40
4.2
40
77
3
151
22
26
23
27
2.00
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29
4.6
29
94
0
219
25
32
15
26
1.95
30234780--30234940
58
2.8
58
88
0
187
25
33
15
25
1.95
30234780--30234940
87
1.9
87
85
0
223
25
33
15
25
1.95
30242862--30242993
29
4.6
29
94
0
219
25
32
15
26
1.95
30242833--30242993
58
2.8
58
88
0
187
25
33
15
25
1.95
30242833--30242993
87
1.9
87
85
0
223
25
33
15
25
1.95
30246553--30246592
20
2.0
22
85
14
59
32
5
15
47
1.66
30247541--30247646
55
1.9
55
80
3
124
24
31
21
22
1.98
30250429--30250457
12
2.4
12
100
0
58
27
48
0
24
1.51
30254826--30254904
40
1.9
42
87
5
117
20
41
21
16
1.90
30266804--30267142
123
2.8
123
94
0
579
30
10
25
33
1.90
30266841--30267032
64
3.1
64
60
13
155
27
10
27
35
1.89
30267145--30267354
40
5.2
40
91
1
296
23
20
27
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30283839--30283879
20
2.0
20
95
0
73
21
43
7
26
1.79
30285758--30285798
11
3.7
11
84
15
50
36
0
0
63
0.95
30292419--30292542
61
2.0
60
80
7
135
41
4
12
41
1.63
30298624--30298796
46
3.7
46
75
10
181
22
19
28
29
1.98
30298617--30298789
93
1.9
93
92
0
292
22
20
28
28
1.98
30303295--30303345
15
3.4
15
76
17
52
33
0
5
60
1.21
30306087--30306138
22
2.3
22
90
9
79
57
9
9
23
1.60
30311891--30311994
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34.7
3
98
0
199
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0
0
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0.98
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9.8
6
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16
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18
1
1
78
0.92
30313302--30313348
18
2.5
19
86
3
51
14
6
2
76
1.08

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328