Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  42  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12212314--12212359
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0
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1.08
12216467--12216517
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90
9
79
72
0
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19
1.08
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2.1
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100
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18
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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24
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0
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32
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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29
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26
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2
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1.35
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0
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209
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17
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140
1.9
140
84
3
360
29
19
16
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12397103--12397396
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6.3
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0
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9
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28
1.88
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0
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21
29
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1.85
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2.0
324
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0
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19
18
34
1.95
12425651--12425713
31
2.0
31
100
0
126
38
9
6
46
1.62
12433444--12433477
8
4.5
8
96
3
54
64
5
0
29
1.17
12433432--12433488
24
2.4
24
77
16
64
66
3
1
28
1.18
12433432--12433484
16
3.3
15
84
7
61
66
3
1
28
1.20
12433632--12433698
20
3.3
20
66
22
59
53
4
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34
1.49
12433634--12433713
40
2.0
40
100
0
160
55
5
7
32
1.50
12433668--12433747
25
3.1
26
76
5
72
56
7
5
31
1.49
12433598--12433829
23
10.1
22
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24
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57
5
4
32
1.41
12433732--12433830
23
4.2
23
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107
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4
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30
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0
0
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2.0
29
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24
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20
20
1.97
12435943--12435972
14
2.1
14
100
0
60
66
6
6
20
1.38
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89
2.2
89
89
0
293
35
17
16
30
1.93
12435955--12436431
163
2.9
164
87
5
687
36
20
16
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12436208--12436374
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2.2
74
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3
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37
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17
25
1.94
12436359--12436388
14
2.1
14
100
0
60
66
6
13
13
1.43
12436444--12436479
14
2.6
14
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0
63
55
2
13
27
1.52
12436283--12436554
91
3.0
90
88
5
394
38
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15
26
1.91
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254
2.0
252
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37
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16
27
1.92
12436458--12436628
75
2.3
75
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3
274
38
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27
1.91
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2.2
45
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14
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1
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1
1
30
1.14
12448577--12448628
16
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15
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65
1
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1.14
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180
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4
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2.2
18
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0
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64
0
0
35
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3.4
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18
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2
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1.02
12449888--12449952
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3.2
20
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76
3
16
3
1.03
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5.2
8
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5
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0
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13
0.93
12451373--12451415
17
2.6
16
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7
50
79
0
6
13
0.93
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2.0
15
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0
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29
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18
106
43
19
8
28
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12458834--12458969
63
2.1
63
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1
254
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29
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2.2
19
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0
0
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0.94
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0
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14
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0
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0
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2.1
18
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9
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0
0
31
0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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