Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  12  of  292  ( 35004 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3356126--3356229
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0
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0
0
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1.00
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0
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0
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2.1
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25
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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20
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3
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1.20
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2.0
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0
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2.1
23
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0
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4
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1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
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0
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1.21
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0
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1.03
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0
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0
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0
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0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
0
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10
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53
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0
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1.00
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29
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0
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23
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16
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26
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25
26
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15
0
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2.1
16
88
11
50
15
15
0
69
1.19
3581570--3581645
31
2.5
31
84
4
100
19
28
31
19
1.97
3582191--3582309
34
3.5
34
80
3
114
33
9
11
45
1.73
3584383--3584436
22
2.5
22
87
0
72
42
3
9
44
1.54
3584397--3584438
22
1.9
22
100
0
84
42
0
9
47
1.36
3589843--3589953
47
2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
3591244--3591355
43
2.6
43
94
0
206
28
32
25
13
1.94
3591370--3591492
38
3.2
37
91
4
185
27
25
25
21
2.00
3591417--3591832
206
2.0
206
98
0
805
33
23
13
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3598924--3598950
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
3600069--3600093
13
1.9
13
100
0
50
84
0
0
16
0.63
3603275--3603344
34
2.1
34
94
0
122
41
11
17
30
1.84
3603346--3603370
6
4.2
6
100
0
50
52
32
0
16
1.44
3606734--3606793
21
2.8
22
82
10
79
26
23
21
28
1.99
3607159--3607183
13
1.9
13
100
0
50
0
8
0
92
0.40
3611040--3611383
168
2.0
168
93
1
582
23
22
28
25
1.99
3612330--3612363
11
3.1
11
91
0
50
58
29
11
0
1.33
3612321--3612372
22
2.3
22
80
3
59
63
25
9
1
1.35
3615535--3615572
19
2.0
20
89
5
60
47
0
2
50
1.15
3615661--3615687
13
2.1
13
100
0
54
59
14
7
18
1.58
3616428--3616481
26
2.1
26
100
0
108
38
11
22
27
1.88
3618858--3618895
11
3.0
13
85
14
53
28
7
0
63
1.23
3618919--3619244
3
110.0
3
71
11
190
31
7
2
58
1.38
3619603--3619641
2
19.5
2
89
0
60
43
0
5
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1.24
3619652--3619760
9
11.7
9
76
14
60
28
2
0
67
1.10
3619710--3619760
3
17.0
3
95
0
93
33
1
0
64
1.05
3619880--3619976
6
15.2
6
72
21
58
35
3
4
57
1.33
3619880--3619976
9
10.1
9
72
22
58
35
3
4
57
1.33
3619895--3619972
25
3.2
24
75
19
74
35
1
5
57
1.29
3619725--3620111
155
2.6
150
84
7
457
32
3
5
58
1.39
3620092--3620133
2
21.0
2
100
0
84
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3623995--3624031
2
18.5
2
100
0
74
51
0
0
48
1.00
3634689--3634721
14
2.4
14
85
14
50
57
0
0
42
0.98
3635112--3635143
16
2.0
16
93
0
55
50
3
12
34
1.56
3635751--3635781
14
2.2
14
94
0
53
16
0
0
83
0.64
3637104--3637156
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
3638643--3638726
26
3.2
26
94
0
150
36
23
4
34
1.76
3639545--3639583
20
1.9
21
89
5
62
30
2
5
61
1.31
3639677--3639731
24
2.3
24
83
0
65
41
14
1
41
1.56
3639762--3639835
22
3.3
21
82
14
71
33
4
6
55
1.45
3640187--3640238
20
2.7
20
81
3
70
28
3
3
63
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292