Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  260  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74763189--74763248
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0
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21
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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T
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11
23
33
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
74932993--74933072
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2.8
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1
60
1.36
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0
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34
1
3
60
1.23
74945263--74945321
31
2.0
30
83
6
75
44
13
8
33
1.74
74945258--74945324
31
2.3
27
78
14
71
41
11
8
37
1.73
74948528--74948591
24
2.7
24
83
11
78
28
29
15
26
1.96
74948528--74948600
24
3.1
22
77
12
74
26
28
15
30
1.96
74955000--74955106
32
3.4
32
80
1
117
35
8
11
44
1.70
74955379--74955426
21
2.3
21
82
7
62
45
25
0
29
1.53
74955934--74955963
12
2.4
13
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11
53
36
0
0
63
0.95
74964673--74964707
14
2.4
15
85
9
54
5
31
0
62
1.18
74973598--74973647
24
2.0
25
85
11
68
34
16
20
30
1.94
74979105--74979135
2
15.5
2
100
0
62
0
51
0
48
1.00
74988089--74988134
23
2.0
22
88
12
67
36
4
10
47
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74989873--74989910
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2.1
19
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5
60
63
10
0
26
1.27
74993179--74993241
30
2.1
30
96
0
117
26
3
12
57
1.51
74993283--74993333
24
2.3
23
80
16
54
29
1
7
60
1.36
74993371--74993403
11
2.9
12
86
13
52
66
0
0
33
0.92
74997904--74997936
12
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13
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33
3
0
63
1.10
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2.0
51
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0
195
26
20
19
33
1.97
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19
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20
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4
0
45
1.21
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1.98
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2
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0
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0
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1.18
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0
0
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0.90
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0
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0
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34
100
0
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20
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1.94
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5.6
49
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5
292
24
17
28
29
1.97
75025376--75025666
101
2.9
98
83
5
359
24
17
28
29
1.97
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3.3
65
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0
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1.87
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2.4
98
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2
268
34
21
10
33
1.88
75028766--75028982
33
6.6
33
81
2
240
36
21
11
30
1.88
75028987--75029085
29
3.4
29
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4
164
25
30
10
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75032633--75032667
4
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12
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0
25
0
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2.4
44
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3
144
29
23
13
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1.93
75043657--75043764
44
2.4
44
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3
144
29
23
13
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1.93
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2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75049153--75049238
44
2.0
44
92
0
145
46
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12
23
1.82
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39
92
0
401
30
29
21
18
1.97
75051138--75051172
2
17.5
2
100
0
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0
0
1.00
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0
0
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0.99
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100
0
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0
0
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0
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24
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1.98
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298
3.0
298
94
0
1554
28
20
14
36
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292