Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  245  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71210027--71210075
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0
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20
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3
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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23
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71265376--71265407
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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26
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19
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13
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94
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10
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19
3.0
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35
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16
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1.78
71308887--71308958
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105
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0
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100
0
94
31
0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71339019--71339071
6
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1
0
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1.9
36
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0
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1.87
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0
0
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0
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69
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29
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32
1.87
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3.3
25
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5
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2.1
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0
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30
1.42
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25
2.1
25
89
3
79
25
19
23
32
1.97
71390684--71390790
27
4.0
27
85
0
133
25
21
18
34
1.96
71390683--71390799
54
2.2
54
85
4
164
26
19
17
35
1.94
71390780--71390991
27
7.9
27
83
2
255
29
9
21
38
1.86
71390711--71390987
54
5.1
54
77
6
208
28
12
20
37
1.90
71390783--71391042
54
4.8
53
78
7
229
30
9
22
38
1.86
71390726--71391003
81
3.4
81
79
6
278
28
11
21
37
1.89
71390874--71391042
81
2.1
81
80
2
187
30
10
21
37
1.88
71390780--71391042
27
9.8
26
76
13
167
30
9
22
37
1.87
71393154--71393205
20
2.5
21
78
9
61
71
1
7
19
1.20
71398528--71398553
13
2.0
13
100
0
52
53
15
0
30
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71403335--71403442
55
2.0
54
83
7
137
30
32
19
17
1.95
71421336--71421404
6
11.5
6
96
0
93
42
0
7
50
1.30
71425748--71425781
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
71438123--71438164
22
1.9
23
90
9
70
57
9
4
28
1.51
71441540--71441572
16
2.1
15
94
5
57
57
0
0
42
0.98
71442985--71443032
25
1.9
25
91
0
78
41
8
6
43
1.60
71443205--71443436
124
1.9
118
85
5
320
35
20
15
28
1.94
71445879--71445950
35
2.1
35
97
0
135
48
8
6
36
1.60
71452964--71452988
3
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3
100
0
50
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0
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0
0.90
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5.7
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0
68
0
67
0
32
0.91
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43
1.9
43
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2
103
24
27
18
30
1.98
71463145--71463726
204
2.8
203
85
3
819
29
20
17
31
1.96
71475809--71475864
14
3.9
14
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13
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55
1
5
37
1.33
71477677--71477707
2
15.5
2
100
0
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51
0
0
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1.00
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2.0
29
100
0
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23
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0
42
1.55
71479986--71480053
31
2.3
29
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9
104
44
14
4
36
1.66
71479995--71480053
31
1.9
31
100
0
118
44
13
5
37
1.66
71480952--71480988
2
18.5
2
100
0
74
51
48
0
0
1.00
71487888--71488613
361
2.0
362
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2
1224
38
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13
32
1.87
71499249--71499300
23
2.2
24
83
6
63
42
1
0
55
1.10
71508317--71508594
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3.0
92
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1
371
45
15
14
24
1.83
71511223--71511270
10
4.7
10
74
5
51
29
0
4
66
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71532329--71532360
2
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2
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0
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0
50
0
50
1.00
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9
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52
46
0
0
53
1.00
71538063--71538105
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14
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3
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48
0
0
51
1.00
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20
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19
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40
0
3
56
1.15
71545794--71545953
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2.1
76
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1
275
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1
8
49
1.43
71556913--71556953
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15
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43
0
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1.36
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118
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20
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1.99
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49
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0
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1.98
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0
22
1.50
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21
2.2
21
80
0
58
51
25
0
23
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292