Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  223  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65227503--65227528
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2.4
24
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22
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128
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0
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2.1
23
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2
88
0
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5
0
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1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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1.47
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0
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19
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2
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0
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0
0
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1.00
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2.0
17
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117
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13
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1.9
71
88
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3.4
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24
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2
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2.0
24
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0
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36
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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28
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100
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26
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19
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0
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1.9
34
84
6
87
36
1
3
58
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65376423--65376447
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0
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0
0
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0.63
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2
0
63
1.06
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4.5
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61
1.09
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27
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0
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32
1.89
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1.9
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1.68
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51
16
13
18
1.76
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0
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0
0
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0
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14
14
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34
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30
1.82
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16
3.4
16
89
0
81
31
29
3
35
1.75
65407437--65407476
19
2.2
18
90
4
62
15
27
5
52
1.63
65411260--65411330
31
2.3
31
82
4
81
38
8
11
42
1.71
65412442--65412527
42
2.0
42
86
4
120
31
13
17
37
1.89
65421859--65421903
20
2.3
20
96
3
83
62
8
4
24
1.43
65421947--65422011
31
2.1
31
100
0
130
52
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3
21
1.61
65423896--65423936
20
2.0
21
90
4
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70
2
0
26
0.99
65423892--65423937
20
2.4
19
77
19
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69
2
0
28
1.00
65423963--65424003
9
4.6
9
90
0
64
24
7
21
46
1.77
65429147--65429187
3
13.7
3
100
0
82
31
0
0
68
0.90
65432250--65432291
20
2.2
20
88
12
63
2
30
0
66
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65432307--65432341
17
2.1
17
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5
63
0
11
2
85
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5
5.4
5
100
0
54
40
40
0
18
1.51
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31
3.0
31
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0
168
39
9
4
46
1.56
65450212--65450263
10
5.3
10
79
2
61
73
1
0
25
0.94
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20
3.3
21
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8
77
70
1
0
28
0.96
65450212--65450289
21
3.8
21
78
11
74
69
1
1
28
1.04
65450296--65450344
25
2.0
24
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4
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57
2
0
40
1.10
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18
2.1
18
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0
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5
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1.48
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1.9
20
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0
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1.93
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2.0
20
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32
0
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1.55
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2.2
26
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0
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1.78
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26
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0
270
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4
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1.75
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135
2.1
136
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2
509
25
19
23
32
1.98
65483506--65483938
44
10.1
44
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5
582
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30
22
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1.9
13
100
0
50
4
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8
1.47
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24
2.6
24
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9
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25
4
6
63
1.38
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24
2.4
24
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0
69
26
3
8
61
1.42
65485729--65485849
23
5.3
22
68
20
70
34
3
3
58
1.31
65485991--65486061
3
24.0
3
83
8
83
30
4
1
63
1.22
65485992--65486071
9
9.0
9
81
8
83
31
7
1
60
1.33
65488974--65489071
3
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3
72
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74
58
5
0
36
1.20
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33
2.6
33
92
1
106
56
5
0
37
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65488951--65489071
39
3.3
39
78
15
148
56
5
0
38
1.24
65488975--65489066
11
8.7
11
73
11
61
57
5
0
36
1.22
65490986--65491146
48
3.4
47
73
8
164
39
19
16
24
1.91
65490972--65491148
94
1.9
94
92
0
300
40
19
16
23
1.91
65492996--65493552
202
2.7
203
90
4
879
38
15
13
31
1.87
65498291--65498325
10
3.4
10
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7
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48
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20
22
1.76
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2.2
15
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0
0
36
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30
9
0
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1.29
65534572--65534612
21
2.0
21
90
9
66
29
9
0
60
1.28

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292