Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  35  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9361492--9361550
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19
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2.0
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0
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12
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8
56
13
0
2
83
0.76
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0
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17
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6
39
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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2.4
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9436374--9436417
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2.3
19
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19
1.9
19
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21
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0
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100
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35
2
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2.1
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5
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1.9
32
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14
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32
5
0
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
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1.19
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47
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129
39
0
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0
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0
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208
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21
27
28
1.99
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1.8
93
93
0
297
22
21
28
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9499925--9500190
47
5.7
45
74
14
209
21
27
21
29
1.99
9499925--9500193
94
2.9
93
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21
27
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2.0
23
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40
17
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1.70
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2.7
22
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12
57
19
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38
12
1.88
9515389--9515560
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22
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1.98
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232
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29
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232
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0
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8
100
0
52
23
0
0
76
0.78
9539178--9539202
12
2.1
12
100
0
50
72
8
0
20
1.10
9539415--9539457
10
4.4
10
80
14
54
25
0
2
72
0.97
9543300--9543350
23
2.3
23
86
6
70
39
0
5
54
1.24
9548453--9548504
25
2.1
25
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0
95
65
1
15
17
1.36
9549351--9549428
29
2.7
29
87
2
102
19
26
1
52
1.54
9558215--9558348
62
2.2
58
83
11
164
48
5
2
42
1.42
9563458--9563517
16
3.7
16
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10
50
51
1
3
43
1.28
9563461--9563575
59
1.9
59
86
8
162
51
2
4
41
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9565181--9565219
15
2.6
14
88
8
51
58
0
20
20
1.39
9572829--9572975
45
3.3
43
72
14
120
44
12
17
24
1.84
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21
2.0
21
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0
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29
21
29
19
1.98
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1
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1
100
0
58
0
0
0
100
0.00
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41
5
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1.70
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20
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0
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20
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0
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0
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0
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50
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27
17
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1.97
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2.0
16
100
0
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25
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2.1
13
100
0
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14
33
37
14
1.88
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2.7
49
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19
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23
27
20
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30
1.9
30
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0
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1.95
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36
2.1
36
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0
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3
23
1.72
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18
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22
2.0
22
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8
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0
25
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1.50
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23
26
22
2.00
9635437--9635567
40
3.3
40
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2
156
25
23
27
23
2.00
9642123--9642409
137
2.1
137
96
0
529
31
25
18
24
1.98
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26
2.0
27
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74
24
15
22
37
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26
4.2
26
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2
177
36
24
4
34
1.76
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4
7.2
4
100
0
58
24
0
0
75
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9653603--9653636
14
2.5
14
95
4
61
85
0
14
0
0.60
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20
3.8
20
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15
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62
6
5
25
1.42
9655964--9656016
20
2.7
19
82
11
63
62
7
7
22
1.47
9656021--9656061
21
1.9
22
90
5
66
56
2
0
41
1.13
9656043--9656177
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3.3
41
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12
172
63
0
2
32
1.14
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16
4.8
16
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0
2
32
1.07
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24
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0
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20
2.5
19
83
9
62
28
10
16
44
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292