Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  233  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2.0
26
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13
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
16
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16
57
70
2
0
27
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.0
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0.99
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29
1.95
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0
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0.84
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11
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0
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0
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109
32
21
10
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24
26
1.93
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44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
68055412--68055545
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
68061331--68061445
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
68061331--68061464
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
68063372--68063431
26
2.4
24
83
8
75
68
3
0
28
1.05
68063394--68063457
21
3.1
22
78
10
64
68
4
0
26
1.09
68063507--68063539
15
2.1
16
88
11
50
69
0
0
30
0.88
68065527--68065579
3
17.7
3
80
7
63
32
1
0
66
1.03
68065527--68065887
24
15.3
24
68
22
101
31
3
2
63
1.24
68065585--68065634
22
2.2
23
82
10
59
32
4
6
58
1.41
68065695--68066174
3
158.7
3
68
19
172
31
2
3
61
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68065763--68065797
17
2.1
17
89
10
54
40
2
0
57
1.14
68065705--68066405
143
4.9
144
90
3
1022
31
2
4
60
1.32
68078530--68078655
64
2.0
64
84
3
164
23
19
23
32
1.98
68078642--68078677
14
2.5
15
86
4
56
22
13
0
63
1.29
68078656--68078823
77
2.2
78
86
4
241
26
15
20
37
1.92
68078767--68078886
64
1.9
64
89
0
186
21
20
25
32
1.97
68080544--68080591
3
17.0
3
82
8
57
29
2
0
68
1.01
68080597--68080655
22
2.6
21
71
12
55
32
3
5
59
1.36
68080711--68080765
3
18.0
3
84
3
56
32
1
5
60
1.30
68080561--68082026
151
9.9
149
83
9
1583
31
3
4
60
1.35
68080862--68080913
3
17.0
3
76
4
50
34
3
1
59
1.27
68080568--68082026
299
4.9
296
84
9
1600
30
3
4
60
1.35
68081158--68081928
3
253.7
3
65
19
104
30
3
5
60
1.35
68081509--68081541
16
2.1
16
94
5
59
33
0
3
63
1.10
68081652--68081687
16
2.1
18
90
10
58
36
0
2
61
1.11
68081610--68082026
153
2.7
152
85
8
504
31
2
5
60
1.34
68089870--68089948
31
2.6
31
79
2
97
40
2
7
49
1.45
68090235--68090281
23
2.0
24
87
8
69
61
6
2
29
1.32
68091522--68091668
49
3.0
49
88
5
176
21
27
17
34
1.95
68091551--68091668
47
2.4
49
90
5
179
22
26
18
33
1.97
68091703--68091832
29
4.5
29
72
5
93
26
26
18
28
1.98
68094005--68094039
8
4.4
8
96
0
61
0
14
0
85
0.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68095025--68095069
21
2.1
21
88
8
65
68
2
0
28
1.01
68098655--68098703
2
24.5
2
100
0
98
51
0
0
48
1.00
68101267--68101325
29
2.0
29
100
0
118
27
6
38
27
1.81
68101360--68101410
25
2.0
25
100
0
102
50
15
3
29
1.62
68104938--68104978
14
2.9
14
89
10
57
24
0
0
75
0.80
68104943--68104978
18
1.9
19
94
5
65
25
0
0
75
0.81
68105025--68105064
18
2.2
18
100
0
80
45
0
0
55
0.99
68105116--68105207
8
10.0
9
71
23
59
39
1
2
57
1.18
68105163--68105202
21
1.9
21
85
10
55
40
0
0
60
0.97
68111634--68111741
4
27.0
4
68
7
67
24
9
1
64
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292