Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 85040211 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  85040211

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   

This is table  286  of  292  ( 35004 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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0
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50
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2
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2.0
30
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3
1
42
1.28
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2
0
51
1.13
82746915--82746953
17
2.2
18
90
4
62
23
12
15
48
1.79
82759043--82759077
2
18.0
2
88
5
54
51
2
0
45
1.16
82762191--82762229
14
2.7
14
80
4
51
51
7
10
30
1.64
82780407--82780580
69
2.5
70
89
1
262
37
20
12
29
1.89
82781538--82781587
3
16.7
3
100
0
100
68
0
0
32
0.90
82782989--82783189
81
2.4
83
92
2
325
31
12
14
40
1.84
82784770--82784809
13
3.0
13
88
3
53
75
2
0
22
0.93
82785215--82785492
141
2.0
141
99
0
547
33
6
13
46
1.68
82785588--82785637
26
1.9
26
91
0
82
16
12
8
64
1.49
82786741--82786822
40
2.0
41
83
6
105
54
2
3
39
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82788092--82788148
21
2.9
21
71
12
66
57
0
0
42
0.98
82795060--82795109
20
2.5
20
73
0
55
34
2
4
60
1.27
82795160--82795192
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
82796724--82796769
25
2.0
25
83
12
62
36
8
26
28
1.86
82799208--82799263
22
2.5
23
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8
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50
1
1
46
1.22
82799951--82800012
31
2.0
31
100
0
124
25
6
16
51
1.68
82803453--82803502
26
1.9
26
87
0
73
16
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10
62
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22
1.9
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4
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0
2
32
1.06
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19
2.3
18
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7
59
65
2
2
30
1.18
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22
2.5
22
83
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65
1
3
29
1.19
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2.6
44
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2
149
35
13
22
27
1.92
82809961--82810094
46
3.0
45
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4
153
35
14
23
26
1.93
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16
2.5
17
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4
57
31
0
2
65
1.05
82819570--82819677
3
35.0
3
75
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83
30
5
2
61
1.33
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2.5
15
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4
51
33
2
2
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1.23
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26
3.9
25
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13
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6
2
30
1.31
82822645--82822702
26
2.2
25
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11
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58
3
6
31
1.41
82822651--82822702
26
1.9
27
84
7
70
59
3
7
28
1.43
82823410--82823476
18
4.0
17
75
17
61
59
4
7
28
1.44
82827206--82827268
29
2.2
29
85
5
83
42
0
6
50
1.27
82834809--82834846
20
1.9
20
89
10
60
39
0
10
50
1.37
82835588--82835615
6
4.7
6
100
0
56
17
17
46
17
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82838374--82838424
27
1.9
27
92
4
86
64
5
1
27
1.27
82838753--82838792
17
2.2
19
86
8
57
50
5
2
42
1.37
82838753--82838790
19
2.0
19
85
10
51
50
5
2
42
1.39
82838832--82838888
26
2.2
26
84
3
71
61
5
7
26
1.43
82842048--82842092
22
2.0
23
91
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0
48
0
51
1.00
82842856--82842907
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0
1
55
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2.0
30
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37
0
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24
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0
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82843086--82843110
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292